Cancer e Fish sono tornati al castello di Ade, desiderosi di parlare con il signore degli Inferi. I due ex Cavalieri d'oro vengono però fermati da Rhadamante, un "Gigante degli Inferi", che li uccide come punizione per aver fallito la loro missione al Grande Tempio. Nel frattempo, Mur raggiunge la seconda casa dello zodiaco, ma al suo interno trova il corpo morto di Toro, sconfitto in circostanze misteriose. Il Cavaliere del Toro è stato in realtà attaccato da Niobe, un altro Specter al servizio di Ade, ma prima di venire sopraffatto dal Profumo Letale il Cavaliere d'oro ha annientato il nemico con il Sacro Toro. Gemini, Capricorn e Aquarius hanno dunque superato la seconda casa senza incontrare ostacoli, ma all'interno della casa dei Gemelli una forza misteriosa blocca i tre Specter. Intanto, anche Andromeda decide di raggiungere il Grande Tempio, nonostante Lady Isabel gli abbia vietato di recarvisi. Il Cavaliere di Andromeda viene però attaccato al porto di Nuova Luxor da Argetti, Dedalus e Orione, altri tre Cavalieri resuscitati da Ade e ora suoi seguaci. I Cavalieri d'argento vengono però sconfitti al termine di una breve lotta.

Nel tentativo di evitare una catastrofe, Pegasus e compagni utilizzano le loro tecniche per deviare verso il cielo la grande massa di energia generata dai due Urli di Atena: i Cavalieri di bronzo, le cui armature assumono durante l'atto un riflesso dorato, scongiurano la distruzione delle dodici case e l'annientamento reciproco tra Cavalieri d'oro, riuscendo inoltre a salvarsi. A questo punto, Lady Isabel pone fine alle ostilità chiedendo a Mur, Ioria e Scorpio di condurre Gemini, Capricorn e Aquarius al suo cospetto. Presso la statua di Atena posta oltre le dodici case, Lady Isabel consegna a Gemini il pugnale con il quale, molti anni fa, il Cavaliere dei Gemelli tentò di assassinare la ragazza allora neonata: con l'ausilio del pugnale Gemini uccide Lady Isabel, su richiesta della stessa ragazza. Quando Pegasus e compagni giungono alla statua di Atena tutti i Cavalieri se ne sono andati, ma ecco che sopraggiunge Shin dell'Ariete: il maestro di Mur decide di rivelare la verità sul sacrificio di Atena.

Shin spiega a Pegasus e compagni che i Cavalieri d'oro riportati in vita da Ade non si sono realmente schierati dalla parte del signore degli Inferi: in realtà il compito di Gemini e degli altri Specter resuscitati è sempre stato quello di portare negli Inferi Atena, in modo che la dea della giustizia combattesse faccia a faccia contro Ade. Tuttavia, per non destare sospetti, gli ex Cavalieri d'oro hanno dovuto agire senza rivelare le loro vere intenzioni. Shin raccoglie il sangue di Lady Isabel caduto a terra e lo getta sulla statua di Atena: la grande scultura si riduce di dimensioni fino a poter essere afferrata con una mano. Il Cavaliere dell'Ariete rivela che la statua è l'armatura di Atena, che deve essere consegnata alla dea affinché la utilizzi nella lotta contro Ade. Prima che Pegasus e compagni si rechino al castello di Ade, da dove potranno raggiungere gli Inferi e aiutare Lady Isabel a sconfiggerne il signore, Shin bagna con il sangue di Atena le armature usurate dei Cavalieri di bronzo, riparandole e rendendole più potenti che mai. Nel frattempo, Gemini, Aquarius e Capricorn giungono al palazzo di Ade e minacciano Pandora, la sacerdotessa del signore degli Inferi, affinché li faccia entrare nel regno del dio; purtroppo però la vita provvisoria concessa ai Cavalieri resuscitati sta terminando e presto Gemini e compagni moriranno di nuovo. Intanto, anche Mur, Ioria e Scorpio sono giunti al castello di Ade e fronteggiano Rhadamante, che però riesce a tenere testa ai Cavalieri di Atena con sorprendente facilità, nonostante l'inferiorità numerica. Tuttavia, a salvare i Cavalieri d'oro giungono Pegasus, Sirio, Cristal e Andromeda.

Mur, Ioria e Scorpio si sacrificano per permettere ai Cavalieri di bronzo di raggiungere l'ingresso del regno di Ade. Sulla soglia degli Inferi, Pegasus e compagni incontrano Gemini, Capricorn e Aquarius morenti: le dodici ore di vita degli ex Cavalieri d'oro scadono e i corpi dei tre guerrieri si dissolvono davanti agli occhi dei Cavalieri di bronzo. In questo momento giunge Rhadamante, che dopo aver ucciso i Cavalieri d'oro vuole sconfiggere anche Pegasus e compagni: il Gigante degli Inferi mette a dura prova i Cavalieri di Atena, che però non si vogliono arrendere, in nome dei Cavalieri d'oro caduti in questa guerra. Pegasus, il cui cosmo diviene più forte che mai, si getta negli Inferi insieme a Rhadamante mentre il palazzo di Ade crolla, tanto forte è stata la furia distruttiva dello scontro. Intanto, al Grande Tempio Dokho saluta per l'ultima volta il suo antico compagno di battaglia Shin, il cui corpo si dissolve e la cui anima fa ritorno nell'oltretomba. Il Cavaliere della Bilancia si prepara a raggiungere gli Inferi insieme a Kanon.

Pegasus e Andromeda giungono alla prima prigione, al cui interno ne incontrano il custode: Rune è lo Specter a difesa del "Palazzo del Tribunale", il luogo dove le anime vengono giudicate per i peccati commessi in vita e poi inviate nel luogo più adatto degli Inferi dove sconteranno la loro pena. Anche se ancora vivi, i Cavalieri di Atena vengono condannati per le varie morti che hanno causato nella guerra in nome della giustizia, ma vengono salvati da Kanon, che sconfigge Rune con la sua Illusione Diabolica. Mentre Pegasus e Andromeda proseguono la loro corsa, il fratello di Gemini ingaggia una battaglia contro Rhadamante, ma stavolta il Gigante degli Inferi non ha buon gioco del nemico e addirittura rischia di essere sconfitto. Nel mondo terreno gli Specter sono protetti da un campo di forza generato da Ade, che però non è attivo negli Inferi: se non fosse stato per questo svantaggio, probabilmente Mur, Ioria e Scorpio sarebbero riusciti a sconfiggere Rhadamante. Lo scontro viene interrotto dall'arrivo di un gruppo di Specter, poi sconfitti senza difficoltà, che convocano il Gigante degli Inferi alla corte di Ade.

Con la sua Sinfonia dell'Eterna Quiete Orpheo riesce ad addormentare tutti gli spettatori del suo concerto: adesso al Cavaliere d'argento non resta che attaccare Ade, seduto sul suo trono e nascosto dietro una tenda, ma la figura che colpisce si rivela essere un'illusione. A questo punto Rhadamante, sul quale la musica di Orpheo non ha avuto effetto, attacca il Cavaliere di Atena, che però viene salvato dall'intervento di Pegasus. Il giovane eroe è costretto a colpire Orpheo insieme a Rhadamante: il Cavaliere d'argento rimane ucciso dal Fulmine di Pegasus, ma il Giudice degli Inferi riesce a salvarsi. Mentre una nuova battaglia tra Pegasus e Rhadamante sta per iniziare, Andromeda compie una strana mutazione: i suoi capelli diventano rossi e la sua voce cambia. Incredibilmente, il Cavaliere di Andromeda si rivela essere la reincarnazione di Ade e Pegasus, che non ha più alleati, viene sconfitto da Rhadamante e gettato nel Cocito. Nel frattempo, Kanon, Cristal e Sirio incontrano Flegiàs, lo Specter guardiano dello Stagno delle Tenebre, un altro ostacolo nella corsa dei Cavalieri di Atena. La caduta del seguace di Ade per mano di Kanon permette ai tre guerrieri di attraversare lo stagno a bordo di una zattera.

Superato lo Stagno delle Tenebre, Kanon, Dragone e Cristal si imbattono in Rhadamante. Il Cavaliere d'oro affronta il seguace di Ade e lascia proseguire i Cavalieri di bronzo, ma proprio quando sta per sopraffare il nemico la battaglia viene interrotta dall'arrivo degli altri due Giudici degli Inferi, gli Specter più potenti a servizio del signore degli Inferi, Minosse ed Eaco. I due mettono in difficoltà Kanon con le loro tecniche letali, ma in soccorso del fratello di Gemini accorre Phoenix. Venuto a sapere dell'improvviso cambiamento del fratello e rimastone molto colpito, il Cavaliere della Fenice si scontra con Eaco: il fratello di Andromeda resiste ai potenti attacchi del Giudice degli Inferi e riesce a metterlo in grande difficoltà.

Alla fine Phoenix sconfigge Eaco, sotto lo sguardo incredulo degli altri Giudici degli Inferi, ma a questo punto una forza misteriosa teletrasporta il Cavaliere della Fenice alla Giudecca. Qui il giovane eroe incontra Ade, che gli rivela i suoi piani: il dio vuole sterminare l'umanità con un'eterna eclissi solare, che farà piombare la Terra in una nuova e infinita era glaciale. Phoenix combatte con tutte le sue forze contro Ade, cercando di scacciare il dio dal corpo di Andromeda, ma il signore degli Inferi è molto potente e Phoenix non riesce a colpirlo. Comunque, anche se ci riuscisse, il Cavaliere di Atena violerebbe soltanto il corpo del fratello, finendo per ucciderlo. Nonostante tutto Phoenix non si arrende, resiste ai violenti attacchi di Ade e ha persino l'occasione di scacciare l'entità malvagia dal corpo del fratello, quando lo spirito di Andromeda si ribella al volere della divinità.

L'occasione di sconfiggere Ade una volta per tutte non viene sfruttata da Phoenix, che esita a colpire il fratello pronto ancora una volta al sacrificio pur di salvare l'umanità. In seguito all'esitazione del Cavaliere della Fenice, Ade prende completo possesso del corpo di Andromeda e attacca Phoenix, il cui corpo privo di sensi viene gettato nel Cocito. Rimasto solo nella Giudecca, il dio incontra Virgo: il Cavaliere d'oro e Lady Isabel hanno vagato a lungo per gli Inferi alla ricerca dell'ingresso per i Campi Elisi, situati oltre la Giudecca. Virgo è desideroso di combattere Ade, ma viene fermato dall'irruzione di Atena. Intanto, Pegasus è bloccato nel Cocito, un'enorme landa ghiacciata dove finiscono le anime di coloro che hanno osato sfidare gli dei e dove non solo sono presenti Pegasus e Phoenix, ma anche Mur, Ioria e Scorpio. Il Cavaliere di Pegasus si imbatte in Valentine, al quale promette di cedere l'armatura di Atena se lo Specter lo vincerà in battaglia: il giovane eroe viene così liberato dal ghiaccio in cui era imprigionato, ma anche se indebolito e infreddolito deve ora fronteggiare un ostico avversario.

Al termine di una dura battaglia Pegasus sconfigge Valentine e l'armatura di Atena rimane in suo possesso. Nel frattempo, alla Giudecca Lady Isabel cerca vanamente di convincere Ade a fermare l'eterna eclisse, giungendo persino ad offrire la propria vita in cambio della salvezza della Terra. La dea viene ferita, ma quando il suo sangue entra in contatto con il corpo di Ade lo spirito del signore degli Inferi viene allontanato dalle membra di Andromeda: il giovane eroe viene richiamato nel suo corpo dal sangue divino della dea a cui è fedele. Ade è sconfitto, ma il suo spirito scompare portando con sé Lady Isabel, sotto lo sguardo attonito di un impotente Virgo. Lo scontro fra le due divinità viene avvertito da tutti i Cavalieri negli Inferi e Pegasus si dispera, credendo che Atena sia stata sconfitta e che la guerra sia così perduta.

Dokho consegna le armi disposte sulla sua armatura agli altri Cavalieri d'oro, che le scagliano insieme contro il Muro del Lamento, ma purtroppo nemmeno l'energia delle armi della Bilancia è sufficiente ad abbattere l'imponente muro. Tuttavia, a questo punto le armature d'oro rimaste al Grande Tempio giungono negli Inferi in soccorso dei Cavalieri di Atena: l'unica corazza non ancora presente nella Giudecca è quella dei Gemelli, al momento utilizzata da Kanon. Il fratello di Gemini, che nel frattempo ha iniziato una nuova battaglia contro Rhadamante, comprende subito la situazione e si priva dell'armatura, che raggiunge le altre corazze sotto forma di meteora. Nello stesso momento anche Cristal e Sirio, dopo aver superato tutto l'Inferno, raggiungono la Giudecca. Kanon si sacrifica per sconfiggere Rhadamante, afferrandolo da dietro e colpendo sé stesso e il nemico con l'Esplosione Galattica.