Zoöloog Jackson Oz en journaliste Jamie Campbell onderzoeken de eerste dreigende aanvallen van wat lijkt op een dierenopstand tegen de mensheid.

Jackson redt een vriend die wordt gegijzeld door leeuwen. Jamie en Mitch vinden bewijs van een collectief geheugen bij leeuwen en een mogelijk verband met pesticiden.

Door een vleermuizenaanval stort het vliegtuig van Jackson en Abraham neer. Chloe onderzoekt aanvallen door honden en Jamie en Mitch komen niet verder met Senator Vaughn.

Mitch, Abraham en FBI-agent Ben Shaffer onderzoeken wolvenaanvallen in de Mississippi-gevangenis en een onderzoeksstation op de Zuidpool wordt belaagd door vleermuizen.

Mitch legt het verband tussen bacteriën die zijn aangetroffen in de wolf en in Reiden. Ondertussen vecht een team in Rio tegen vleermuizen die overdag aanvallen.

Hartley roept de hulp in van een optometrist om net zo te worden als de zieke dieren, waardoor ze heel snel op zoek moeten naar de moedercel.

Jamie zoekt in Reidens kantoor in Parijs naar bewijs van hun connectie met Ben. Ondertussen ziet Mitch de moedercel in actie bij een gevangen beer.

De bemanning van een containerschip wordt vermoord door besmette ratten, die op het vasteland terechtkomen wanneer het onbemande schip strandt.

Mitch werkt aan een tegengif tegen de mutaties. Burke probeert ondertussen de moedercel te vinden en Chloe en Jamie worden achtervolgd door de autoriteiten.

Het team roept de hulp in van een dierenactivist om per vliegtuig naar Zambia te vluchten en daar het DNA van een luipaard te bemachtigen.

Het loopt steeds verder uit de hand als Jackson tijdens de missie in Zambia gewond raakt en het ziekenhuis overspoeld blijkt te zijn met gemuteerde dieren.

Terwijl Jackson wordt geopereerd, gaan Mitch en Jamie aan de slag met het DNA van het luipaard en de moedercel om een tegengif te maken voor de mutaties.

Maanden na het vliegtuigongeluk heeft het team nog steeds geen remedie gevonden, terwijl de gemuteerde dieren de straten van Washington onveilig maken.

Het team haast zich en vindt Jamie en de luipaard. Als de regering is gestart met verplichte evacuaties, vliegt het team naar Patagonië met een speciaal vliegtuig.

Jamie zorgt voor zichzelf in de wildernis. In Patagonië komen Chloe en Jackson een man met een nieuwe mutatie tegen. Het team ontdekt enkele vreemde sterfgevallen.

Chloe's geheimzinnigheid veroorzaakt wrijving tussen haar en Jackson. Een bondgenoot wordt slachtoffer. Jamie komt in de Canadese wildernis een man tegen.

Een ingestort gebouw veroorzaakt chaos in Vancouver. Het team valt een evenement binnen om bij generaal Davies in de buurt te komen. Logan moet zijn verleden accepteren.

Chloe onthult Jamies locatie voordat het te laat is. Slangen vormen de nieuwste bedreiging. Jackson vraagt Dariela om een belangrijke gunst.

Een krant uit 1895 bevat belangrijke aanwijzingen voor wat er nu aan de hand is. In Lissabon wordt een oude kwal getest en een geest-gen ontdekt.

Mitch legt uit wat de driedubbele helixmutatie veroorzaakt. Abe leidt een team naar een dorp in Engeland waar krekels voor een vreemd effect zorgen.

Abe en Jamie besluiten Jackson niets te vertellen over de rol van zijn vader bij de mutatie. Jackson gaat akkoord met Davies' voorwaarden om zijn moeder te vinden.

Abe gaat mee met Jackson om zijn moeder te vinden, maar ze betalen een hoge prijs. Mitch beseft dat hij zijn vaders hulp nodig heeft om een uitgestorven tijger te vinden.

Het team probeert Jackson te vinden voordat zijn mutatie compleet is. Jackson sluit een akkoord met Davies. De Russen gaan stemmen over het Project Noach.

Jackson keert terug, maar zijn mutatie verandert hem. Robert biecht iets op over het TX-14-gas. Het team zoekt de sabeltandtijger.

Het team zoekt op Pangea naar de sabeltandtijger. Ze proberen om het DNA-geneesmiddel snel te verspreiden terwijl de vliegtuigen van het Noah Objective opstijgen.

Het team ontsnapt uit een gevangenis op Pangea en ontdekt de waarheid over de driedubbele-helixdieren. Alles verandert na een zelfopoffering en een gruwelijke openbaring.

Tien jaar nadat de dieren zijn genezen en de mensheid onvruchtbaar is geworden, komen Jackson en het team weer bijeen na een nieuwe, mysterieuze aanvalsgolf.

Er blijkt een verband te zijn tussen de hybridenaanvallen. Mitch ontmoet een vrouw die beweert zijn dochter te zijn. Abrahams onvruchtbaarheidsonderzoek wordt gevaarlijk.

Abe en Dariela overwegen drastische maatregelen om hun familie te beschermen. Jamie en Clementine voeren een riskante chirurgische ingreep uit op Mitch.

De hybriden naderen New York. Abe en Dariela sluiten zich weer aan bij het team om erachter te komen door welke kracht de dieren worden aangetrokken.

Jamie is gearresteerd, maar wil dat Mitch en Logan op jacht gaan naar de mysterieuze Herders. Jackson vertelt Tessa in Mexico wat er met zijn familie is gebeurd.

Mitch probeert Clementine uit handen van haar ontvoerders te redden. Een blik in het verleden wijst uit wat Abigails connectie met de hybriden is.

Het team probeert zowel Abe en Dariela's zoon als andere vermiste kinderen te redden. Mitch en Jamie komen een oude bekende tegen.

Abigail gijzelt en verhoort Jackson om haar geheime agenda te bewerkstelligen. Tijdens de vlucht raakt het vliegtuig van het team in de problemen.

Het team volgt Mitch naar Kopenhagen en komt in aanraking met zijn alter ego Mr. Duncan. Logan gaat naar Korea om een hybride-nest te onderzoeken.

Jackson vraagt Abe om hulp, terwijl Abigail vecht voor haar leven. Jamie doet Mr. Duncan een aanbod.

Vanwege giftige sporen kunnen de teamleden hun vliegtuig niet uit. Clementine krijgt weeën, maar heeft complicaties tijdens de bevalling.

Wanneer het team vanwege een plotselinge crisis strandt in het hybridengebied, zetten Tessa en Dariela een reddingsmissie op.

Jackson en het team proberen het laatste baken uit te schakelen voordat de hybriden de muur doorbreken. Abigail probeert de baby van Clementine in handen te krijgen.