某天地球出现许多孢子，其中诞生的幼虫侵入人体后，通过吞噬掉宿主的头部管理这个“死掉的身体”，它们能任意变形，其食物便是与寄生体相同的物种。泉新一就是被寄生的人类之一，但是由于某种意外，寄生在他体内的生物并没有吃掉他的大脑，而只是取代了他的右手。面对这突如其来的状况，新一陷入恐惧之中……

新一终于明白了自己的立场，决定与寄生在他体内的生物和平相处，并给它取名叫“右”。寄生兽逐渐渗透到人类世界中，现在到处频传着残忍的杀人碎尸事件，新一决心使用小右的力量，与其他完全体寄生兽进行殊死搏斗。里美是新一的同伴同学，两人互相喜欢，里美敏锐察觉到新一的变化，但是她什么都没说。

杀人碎尸事件已经多到让人麻木，新一是唯一知道真相的人类。新一发现学校里潜伏着寄生兽，而这个名叫田宫良子的寄生兽竟然以老师的身份公然出现，田宫同样发现了新一的寄生兽体质。新一与田宫交谈后，发现田宫并无战意，但她的伴侣A先生视新一为眼中钉。A先生独闯学校，四处寻找新一的踪迹，想要杀死他。

新一在小右的掩护下重伤了A先生，A先生想要移居到田宫的身体，却被田宫制造的爆炸杀害。怀孕的田宫决定抛弃“田宫良子”的身份，杀掉学校所有人，新一也险些遇害。小右能从新一身上脱离一段时间，这让新一很吃惊。新一的妈妈发现了他的异常，但是新一无法对父母说出自己身体的秘密……

新一发现自己的大脑与小右逐渐融合，这让他莫名恐慌。新一无意间看到长井被人群殴，他上前劝架却被对方毒打。关键时刻，神秘少女加奈出言制止，她发现了新一的异常，开始对新一展开调查。在另一边，新一的母亲被急需更换肉体的寄生兽杀害，并占据了肉体，父亲受重伤生死不明。

新一被寄生后的母亲刺穿心脏，小右将自己与新一的心脏合体化，把新一从鬼门关拉了回来。重生后新一的身体被改造，拥有超越人体的机能，然而小右与新一融合后每天要完全睡眠四小时，成为了致命的弱点。新一前去看望父亲，父亲对新一撒谎说母亲行踪不明，不过新一早已知道事情真相，他发誓要报丧母之仇……

新一顺着感知到的方向，一路飞奔到堤坝，然而新一找到的并非杀母凶手，而是另一个被寄生但仍然保留着人类大脑的宇田守。作为同伴的两人倾诉着彼此的遭遇，宇田决定帮助新一。宇田找到了寄生在新一妈妈身上的寄生兽，但被其刺中胸口掉进海里。此时新一闻讯赶到，小右却突然陷入沉睡，新一决定自己手刃杀母仇人。

新一回到学校，但他的生活并未恢复平静。光男由于加奈的缘故，再次找新一的麻烦，却因新一外表和性格的改变而认不出新一。里美也察觉到新一的变化，新一冷漠无情的一面让她感到莫名的恐惧。此时名为岛田秀雄的转学生接近新一，可实际上这位转学生是田宫良子派来观察新一的寄生兽……

岛田秀雄察觉到某些时刻小右的反应极其微弱，这让他十分困惑。裕子爱慕着岛田，因此暗中观察他。裕子偶然发现岛田的脸是伪造的，她震惊之余明白了岛田的真实身份。裕子尝试与岛田沟通，她拜托岛田离开学校并不要杀人。岛田认为自己的身份暴露，他决定杀人灭口，裕子陷入危机！

裕子情急之下将准备好的硫酸扔向岛田，使其身体遭到腐蚀意识不统一，为了逃生她从楼上跳下，所幸身体并无大碍。岛田陷入狂乱，四处虐杀老师及学生，老师们组织学生撤离，但里美所在的班级仍被困学校。新一潜入学校，看到遍地尸体的他内心产生了动摇。冷静过后，新一顺利救出里美，并用石头贯穿了岛田的心脏，杀死了他。

加奈梦到自己遭怪物围困之时，被骑士新一所救，因此更加断定新一是自己的“命运之人”。加奈看到有关岛田的新闻，对新一的身份有所怀疑，她拔下新一的头发并保存起来。在另一边，神秘组织的寄生兽只身闯入流氓窝点，疯狂虐杀成员，只为测试杀人能力，而这个组织的寄生兽老大竟然要竞选市长……

加奈错以为自己能够感应新一，对新一的屡次劝告置之不理。为了保护加奈，新一不得已向她坦白寄生兽与自己的秘密，但加奈不肯相信，新一决定让小右现出原形。两人约定当日，加奈将其他寄生兽错当成新一而遭到攻击。目睹加奈被刺中的新一愤怒之下将寄生兽杀死，最终加奈死在了他的怀里。

面对加奈的死，新一依旧冷漠，这让裕子和里美难以理解。而新一的存在引起了寄生兽市长等人的关注，于是作为部下的田宫良子雇侦探开始对其调查监视。新一也发现自己正慢慢失去人类的感情，他深夜前往加奈死掉的废墟，不料被侦探拍到了变身的小右。在新一的阻拦下，小右没能杀掉侦探，新一面临着身份曝光的大危机！

新一与里美的感情出现了裂缝，而侦探仍在对新一进行监视。新一找来之前的同伴宇田帮忙，两人商量之下决定先活捉侦探。在另一边，侦探将调查结果如实告诉了田宫，侦探慌乱的样子竟让田宫拥有了人类的感情。新一和宇田找到侦探，并将寄生兽的事情托盘而出，此时新一却意外接到了田宫打来的电话……

曾被田宫雇用的侦探仓森找到新一，希望新一帮忙寻找失去联络的同伴。两人来到某地下车库，正巧遇到准备进食的寄生兽。新一与小右联手杀死了寄生兽，并发现此地竟是广川为寄生兽组织准备的“食堂”，这么一来新一就成了广川集团的敌人。广川方计划派后藤杀死新一，但三木请求出动，与新一展开决斗！

面对新型的敌人，新一有些招架不住了。他与小右在树林里设下埋伏，本以为斩杀了三木，却没想到其躯体上潜伏着五只寄生生物，而名叫后藤的寄生生物竟能够完全统一全身意识，新一不敌只好撤退。侦探仓森深夜回到家，却发现妻子与女儿惨死家中。侦探向警方提供有关寄生兽的线索，同时潜入田宫凉子家意图为家人报仇。与此同时，寄生兽集团的部分成员也对田宫凉子产生了杀意……

田宫被组织里的寄生兽视为眼中钉而遭到围攻，田宫设陷阱斩杀攻击她的三只寄生兽，回到家后却发现孩子被侦探仓森劫为人质。随后田宫私闯新一家，并通知新一在公园会面，然而却意外遇到了里美。仓森与田宫对峙，田宫母性觉醒杀死了作势伤害婴儿的仓森，但她即将面临警察的搜捕。

田宫良子向新一提出人与寄生兽可以和平相处的想法，之后为了保护自己的孩子而被警察射杀，受到触动的新一终于流下了眼泪。然而，新一屡次出现在寄生兽杀人现场的经历也引发了警方的怀疑，拥有鉴别寄生兽能力的杀人犯被派来鉴定新一的身份。

因为寄生兽的一连串的事件使得新一深受平间关注，平间让拥有特殊感受能力的杀人犯浦上测试新一……总算洗清嫌疑、回到了高中生活新一的身边又出现谨慎的平间！然后政府终于开始了庞大的扫荡作战！！

警察和特种部队合作开始了一场宏大的的寄生兽扫荡战！山岸率领的特殊部队，使用了特殊的眼，引起了混乱的同时也确实着消灭寄生兽。但是人类一方可以看见胜利之后，有一只寄生兽出手使部队全灭。

寄生兽方面的领导人广川也被杀死，部队出乎意料的就解决了他，但更出乎意料的是广川是一位人类，而特种部队也被后藤逼入了绝境而全灭，后藤突破了包围与新一相遇，新一感到十分害怕，但后藤现在无心恋战。害怕的新一在女朋友村野里美的安慰下重新鼓起了勇气，并与村野发生关系。

在女朋友里美的安慰下鼓起勇气的新一被后藤追杀，而右也偷了一辆汽车向对自己有利的深山里逃去，新一和右制作了各种战斗计划，但都没有成功，失去了右的新一悲伤的往村子里逃去，并遇见了一位和蔼的老奶奶，暂时住了下来。

村子里传出山里有怪物存在，新一不得不离开村子里，为了消灭怪物新一带上老奶奶送的柴刀向山里前进，而右也成为后藤的一部分，新一用人类的智慧和后藤交战，在最后束手无策之际利用人类随意倾倒的垃圾堆里面的铁管攻击后藤的伤口处，后藤身体里面的寄生兽因为铁管里面的毒素而四分五裂，右也因此回到了新一体内，最终将召唤分散的寄生兽的后藤杀死。

在人类的作战之后再也难觅寄生兽的踪迹，而杀人犯浦上却盯上了新一，绑走了新一的女朋友里美，为了救出女朋友，新一追到天台上，浦上问新一人类和寄生兽有什么区别，而里美让新一去报警，新一冲了过去打倒了浦上，但里美却被推了下去，右醒来救了里美，最后警察赶来。