Cuando Jane Villanueva era una niña, su abuela le dejó claras dos cosas: las telenovelas son la mejor forma de entretenimiento y perder la virginidad es lo peor que le puede ocurrir a una mujer. A sus 23 años y en pleno Miami, Jane es una chica responsable y piadosa, emocionada con crear un futuro junto a un novio perfecto con el que, por supuesto, no mantiene relaciones. Pero todos sus planes se van al traste cuando es inseminada accidentalmente por el despiste de una ginecóloga que pasa una mala racha. Paradojas del destino, el esperma pertenece a Rafael, un antiguo amor platónico de Jane, ahora casado con una retorcida mujer y dueño del hotel donde ella trabaja. Jane se ve obligada entonces a cambiar radicalmente de perspectiva: ahora su vida es la mejor telenovela y ella es la protagonista.

Mientras Jane intenta ocultar su embarazo, su madre la presiona para que denuncie a la ginecóloga y sus rifirrafes con Rafael la ponen en un compromiso continuo. Además, Michael empieza a estar celoso y el padre de Jane reaparece para conocer a su hija.

Alba, la abuela de Jane, ayuda a Xiomara en su empeño por ocultarle a su hija que Rogelio es su padre, aunque está decepcionada con ella. Mientras, Jane decide dar un gran paso en su relación con Michael, quien a su vez trabaja investigando la repentina muerte de Zazo.

Jane empieza a sentirse culpable de sus crecientes sentimientos hacia Rafael, lo que se añade a su estrés por los preparativos de su cada vez más cercana boda con Michael, a la que Rogelio no deja de insistir en acudir. Mientras, Rafael y Petra se enfrentan a una persona de su pasado.

Muy furiosa con su madre, Jane decide que necesita su espacio y se muda a casa de Michael, pero la convivencia juntos no es todo lo ideal que ella había imaginado. Finalmente, decide dar una oportunidad a Rogelio, pero las cosas no salen como esperaban. Mientras tanto, Michale recibe la visita de su hermano, al que odia, y Rafael y Petra tratan de definir el estado de su matrimonio, pero Petra podría tener un as en la manga.

Jane empieza sus prácticas en un colegio mientras lidia con las malvadas hijas gemelas de Rogelio, que se han propuesto hacerle la vida imposible. Rogelio insiste en que Xo use su banda para su actuación en el Hotel Mirabella, pero la banda no es lo que esperaba. Rafael es arrestado después de que Petra le tienda una trampa.

Jane decide que lo mejor para ella es ir despacio con Rafael, pero le resulta más difícil de lo esperado, sobre todo cuando sus amigas insisten en llevarla a un nuevo club del que él también es dueño. Mientras, Xo y Rogelio tiene una extravagante doble cita, y Petra sigue conspirando para complicar aún más la vida a Rafael.

Jane y Rafael encuentran ciertos obstáculos a la hora de contar sus secretos, mientras él lidia con las trampas que Petra sigue tendiéndole. Xiomara tiene una entrevista con un importante productor musical llamado Elliot (Juanes), y Michael está cada vez más cerca de capturar a "Sin rostro".

Jane empieza a ver la luz en su sueño de ser escritora, mientras sigue estrechando lazos con Rafael, pero Petra se presenta con un nuevo as en la manga y reclama sus derechos sobre el bebé, así que Jane pide ayuda a Michael, quien a su vez tiene una interesante teoría sobre la identidad de "Sin rostro". Por su parte, Rogelio se prepara para una prometedora entrega de premios. 

Una tormenta tropical obliga a Jane a quedarse en el hotel toda la noche, mientras su madre se queda cuidando a su abuela en el hospital, y por supuesto Rogelio acude a consolarla. Michael sigue convencido de que Rafael tiene algo que ver con "Sin rostro" y Luisa recibe una inesperada visita en prisión.

Jane recibe noticias prometedoras sobre el futuro de su trabajo en el colegio, pero las cosas se complican cuando Rogelio le ofrece una beca como guionista en su telenovela. Alba anima a Xo a mantener la promesa que le hizo a Dios sobre Rogelio. Mientras, Michael sigue convencido de que Rafael es "Sin rostro" y desobedece las órdenes de su jefe de dejarlo en paz.

La carrera de Jane como guionista va avanzando, pero todo parece demasiado bonito para ser cierto, especialmente si Rogelio anda cerca. Rafael está obsesionado con la conexión de Sin Rostro con el hotel y empieza a temer por su familia. Mientras, Petra es amenazada por la sombra de su pasado.

Mientras Michael desgrana los detalles de la supuesta identidad de Sin Rostro, Jane se plantea su futuro y el de su bebé después de recibir noticias desconcertantes en su visita al ginecólogo.

A medida que el misterio de Sin Rostro se va desenmarañando, más secretos salen a la luz, y a Jane le surgen sospechas sobre Rafael por un malentendido. Mientras, Rafael saca a su hermana Luisa del psiquiátrico y encuentran una pista sobre el paradero de su padre.

Jane y Rafael se preparan para recibir los resultados de la amniocentesis y se replantean la idea de vivir juntos. Mientras, el hotel Marbella recibe la visita de Angelique Harper, que resulta ser la novelista favorita de Jane, ocasión que Rafael decide aprovechar para darle una sorpresa muy inesperada.

Jane se siente algo distante de Rafael, así que decide centrarse en la escritura para despejar la cabeza, pero sufre una crisis y acude a Michael en busca de ayuda. Mientras, Petra encuentra el artista invitado perfecto (David Bisbal) para la celebración del Mirabella's Calle Ocho, pero ello conlleva que Rafael deba pedir ayuda a Rogelio, quien a su vez decide pegarse a Michael para preparar su próximo papel como detective.

Jane se plantea si está suficientemente preparada para ser madre, así que decide formarse más, empezando con un curso de lactancia. Mientras, Rafael organiza una fiesta con Petra, que a su vez descubre algo sorprendente sobre Aaron Zazo. Xiomara sigue peleada con su madre por haberse ido a vivir con Rogelio. 

Rogelio recibe la visita de su madre, Liliana, y Xiomara intenta ganarse su aprobación. Tras estropear sin querer la posibilidad de Rafael de recuperar su licencia de venta de alcohol en el hotel, Jane se pierde la celebración de la Pascua Villanueva en su intento por arreglar las cosas. Mientras, Rafael descubre información sobre su madre biológica. Alba da un pequeño paso en el terreno amoroso. 

Jane no acepta la decisión de Rafael y vuelve para convencerle de que deben estar juntos, así que deciden acudir a terapia de pareja para solucionarlo. Mientras, Xo se siente culpable por haber besado a Marco, Petra es secuestrada por Roman Zazo y Michael descubre un secreto sobre Nadine.

Aún decepcionada con Rafael, Jane intenta llevar su embarazo lo mejor posible, mientras se ve obligada a recurrir a Michael para demostrar que Petra está mintiendo. Xiomara intenta arreglar las cosas con Rogelio, que se plantea volver a su antigua telenovela, y Alba empieza a recordar lo que ocurrió cuando se cayó por las escaleras.

Jane está nerviosa por asistir a una reunión de antiguos alumnos del instituto porque no siente que su vida sea lo que esperaba que fuera. Rafael habla a Petra sobre la petición de custodia total de Jane, llevando a Petra a ver esto como una oportunidad de convertirse en una heroína. Xo no entiende por qué Rogelio se enfada en un ensayo.

Final de temporada. Jane provoca un tremendo conflicto entre Rafael y Michael cuando, inesperadamente, se pone de parto. Mientras tanto, Xiomara y Rogelio intentan llegar a tiempo a casa para ver al bebé y Petra hace un descubrimiento.

Ahora que su hijo Mateo es una realidad diaria, las cosas se complican para Jane, tanto en lo familiar como en su proyecto personal de convertirse en escritora. Rafael y Michael se ven obligados a trabajar juntos para resolver el asunto del secuestro, mientras Jane todavía se debate entre sus sentimientos hacia uno y otro. Por su parte, Rogelio se enfrenta a ciertos fantasmas de su pasado que complican su relación con Xiomara, y Petra sigue empeñada en salirse con la suya y podría tomar una decisión que lo cambie todo, especialmente ahora que cuenta con otra inesperada muestra del esperma de Rafael.

Jane por fin ha cogido ritmo con Mateo, pero se encuentra perdida en mitad del triángulo amoroso que forma junto a Rafael y Michael. Para evitar una denuncia, Xiomara y Rogelio se ven obligados a actuar en un crucero. Petra y Rafael desconfían de Lachlan (Michael Rady) y su reciente propuesta de negocio. Alba toma una decisión crucial que cambia su vida.

Jane es admitida en la universidad y se plantea su primer gran dilema como madre: si será capaz de dejar solo a Mateo tan pronto para seguir la oportunidad que tanto ha deseado. Rafael ayuda a Jane con el bautizo de Mateo, pero se ve obligado a confesarle a Jane la verdad sobre Petra. Xo ayuda a Rogelio a afrontar su pasado. 

Inmersa entre sus labores como madre y su trabajo en el colegio, Jane se olvida de planear la fiesta sorpresa para los 25 años de Lina (Diana Guerrero como actriz invitada). Rafael sorprende a Jane pidiendo la custodia compartida. Petra recurre a Michael para intentar mantener a Rafael y Jane separados. Rogelio es chantajeado por su exmujer, Luciana, para conseguir otra vez su papel en "La pasión de Santos".

Parece que Jane finalmente está preparada para tomar una decisión sobre su vida amorosa. Rogelio se enfrenta a su mayor némesis artística: la mismísima Britney Spears. Alba ha dado los pasos adecuados para legalizar su situación como ciudadana, pero el pasado de Xo podría complicar las cosas más de lo esperado. 

Jane y Rafael se preocupan por el futuro de Mateo, ya que quieren evitar que se convierta en un niño mimado. Además, Jane no empieza con buen pie la universidad, donde su atractivo profesor le pone alguna traba a su vida personal. Animado por Xo, Rogelio decide crear su propia serie cuando ve que su trabajo actual llega a su fin.

Tras seis meses sin verse, Jane se encuentra con Michael al salir de compras en pleno Black Friday. Mientras tanto, Rogelio intenta salvar "Hombres locos" y afronta una difícil dilema personal y profesional. Jane y Rafael tienen una cita y empiezan a entrevistar a potenciales niñeras.

Jane descubre que todavía necesita encontrar la manera de pagarse el graduado universitario, mientras Rogelio se esfuerza por confiar en su becaria y Michael busca a la madre de Luisa.

Jane y su familia reciben la visita de la madre de Rogelio, que se encuentra en un estado emocional sensible debido a una inesperada noticia sobre su marido. Noticia que Jane promete mantener en secreto. Mientras, se prepara para su primer día como ayudante de profesor. Michael y Susanna encuentran nuevas pistas sobre la madre de Luisa.

Jane se plantea volver a tener citas cuando conoce a un chico llamado Dax. Rafael comparte cierta información con Michael. 

El profesor Chavez no deja de aparecer en sus sueños, así que Jane se replantea sus sentimientos hacia él. Mientras, ella y su madre buscan el anillo de compromiso perfecto para Liliana y descubren que Rogelio podría estar intentando pedir matrimonio. Lo que no saben es que lo hará con un anillo que el pequeño Mateo se ha tragado.

Jane no deja de pensar en si debería o no acostarse con Jonathan, mientras Rogelio y Xiomara intentan superar sus diferencias. El plan de Michael toma un giro inesperado.

Ahora que Jane tiene sus sentimientos claros, intenta que Michael se reconcilie con Rafael, pero no sale tan bien como esperaba. Centrado en superar su desamor, Rafael se olvida de Petra y sus necesidades. Xo y Rogelio siguen actuando como una pareja pese a su ruptura, algo que Jane no ve con buenos ojos.

Jane y Michael intentan recuperar el tiempo perdido. Petra se preocupa por la actitud de Rafael, pero no se da cuenta de que está ayudando a Micahel a encontrar al hijo de Mutter, Derek. Rogelio descubre la verdad sobre Paolo, su asistente.

Tras dar a luz, Petra ya se ha puesto a trabajar de nuevo y no parece demasiado interesada en la maternidad. Xo decide invitar a casa al antiguo romance de Alba, Pablo, pero la abuela se empeña en que su exnovio trae mala suerte. Jane intenta solucionar el distanciamiento con su padre, pero no sabe que Rogelio sigue atrapado en casa de Lola, su fan acosadora.

Petra se plantea si quizá está sufriendo depresión postparto y hablar con su madre tampoco le ayuda mucho. Mientras, Rafael y Jane empiezan a buscar un nuevo hogar, pero se encuentran ciertos inconvenientes. Rogelio planea una sorpresa para su hija.

Jane tiene una idea muy clara de cómo celebrar su despedida de soltera, pero cuando su madre y Lina se involucran, nada sale como había planeado. Michael, por su parte, quiere pasar una noche con sus amigos, pero las cosas se ponen incómodas cuando Rogelio intenta organizar la fiesta.

Jane debe enfrentarse a un horario ajustadísimo, la aprobación de su trabajo y el entusiasmo de Rogelio hacia la boda. Mientras, Petra descubre la historia del viaje de su hermana para encontrarse con ella y Rafael persigue una nueva oportunidad de negocio.

Jane dobla el turno en el Marbella para ganar algo de dinero extra, pero eso le quita tiempo con Mateo. Mientras, ella y Rafael intentan llegar a un acuerdo sobre la custodia compartida y deciden recurrir a un intermediario. Xo sorprende a todos con su interpretación en la telenovela de Rogelio.

Las mujeres Villanueva tiene una tradición para el Día de La madre, y Jane está emocionada preparándose para su primera celebración como madre. Pero sus planes son frustrados cuando Petra invita a todo el mundo a un brunch. Rogelio se ofende porque Dina no le invita a su cumpleaños. Rafael se mete en problemas gracias a su hermanastro.

Jane tiene grandes planes para el primer cumpleaños de Mateo, pero las cosas se complican cuando descubre que podría haber un inconveniente con la localización para la boda. Rogelio afronta un reto en pleno rodaje. Jane y Petra ayudan a Rafael, pero tienen distintas opiniones sobre cómo solucionar el problema.

Final de temporada. La boda de Jane y Michael se complica, para variar. Jane quiere cambiar el tema de su tesis y esta preocupación le influye en su gran día. Rafael considera contarle a Jane todo lo que siente. Anezka tiene una emergencia. Xiomara recibe noticias inesperadas.