Americká válečná loď USS Nathan James je na tajné misi ve vodách Severního pólu. Musí udržovat radiový klid, aby utajila svou polohu, a neohrozila tak bezpečnost mise. I když se zprvu zdá, že jde o další rutinní misi na prověření bojeschopnosti lodi, pravda se brzy ukáže být poněkud jiná a o to více znepokojující. Bitevní loď je totiž jedním z mála míst na celé planetě, kam ještě nepronikl nebezpečný virus. Posádka lodi tak musí udělat vše proto, aby doktorce Scottové zajistila bezpečí a umožnila jí probádat virus a objevit protilátku. Když navíc začnou chodit zprávy z domova o tamní situaci, je jasné, že se jedná o nemilý závod s časem.

Na posádku bitevní lodi USS Nathan James čeká veledůležitý výsadek na liduprázdné základně v Guantanámu. Úkolů je hned několik. Zajistit dostatek potravin pro budoucí putování, najít prostředky důležité pro výrobu vakcíny a nástroje pro doktorku Scottovou, a doplnit palivo, kterého loď má již kritický nedostatek. Z toho důvodu se na souš vydávají tři taktické týmy. Každý s jedním z úkolů. Pár minut po výsadku ale začíná být jasné, že základna není zas tak neosídlená, jak se na lodi domnívali. A tak, když se postupně všechny tři týmy ocitnou pod palbou, z předem stanovených úkolů se rázem stává jediný. Přežít. Aby toho nebylo málo, na lodi je zrádce, který nehodlá nechat loď ze základny za žádnou cenu odjet. Na pomoc si zavolá dokonce bitevní loď ze své domoviny.

Poté, co Rusové dostali díky komunikaci s Quincym do šachu americkou loď v přístavu u základny Guantanámo, začínají se vyjednávat požadavky možného příměří. Rusové chtějí původní vir, doktorku Scottovou a celý její výzkum. Ovšem v jejich rukou by vakcína nesloužila všeobecnému blahu, nýbrž pro ně, aby se mohli chopit moci v nově utvářeném světě. S tím se ale kapitán Chandler nehodlá smířit. Začíná se tedy sestavovat plán, jak ruskou válečnou loď obeplout a dostat se z pasti, aniž by si toho kdokoliv s nepřátelské posádky všiml.

Doktorka Scottová sama vakcínu proti viru, který vyhladil již téměř celé lidstvo, extrahovat nedokáže. K ruce jí musí být někdo zkušený v oblasti biochemie. Takový je na palubě jen jeden, doktor Quincy Tophet. I když kapitán zprvu nesouhlasí s tím, aby Quincyho pustili z provizorní cely, nakonec mu nic jiného nezbude. Celý výzkum se ale zkomplikuje teprve ve chvíli, kdy vinou úniku paliva dojde na palubě k požáru, čímž dojde k vyřazení jak motorů, tak generátorů, a sání mořské vody. Loď je tedy nepohyblivá, laboratoř se nemůže chladit, a co víc, bez sání mořské vody není ani dostatek pitné vody. Posádka proto musí najít způsoby, jak nastalé situace vyřešit. Jak provizorně uvést loď do pohybu, jak provizorně ochladit vzorky doktorky Scottové, a jak se dostat k nejbližšímu ostrovu Serrana Bank pro pitnou vodu.

Po odbočce na odlehlý ostrov, kde posádka lodi doplnila tekutiny, a poté, co se podařilo uvést loď zpět do chodu, se konečně mohou všichni vydat do Nikaragui, kde je jejich cílem nalézt rezervaci opic. Na těch hodlá doktorka Scottová provést testy nově extrahované vakcíny proti zákeřnému viru. I když všichni předpokládají, že rezervace bude liduprázdná, stejně jako na Guantanámu tomu tak nebude. V Nikarague zuří občanské nepokoje, a co víc, ostrov je rozdělen na dvě frakce, nakažené a nenakažené, kteří se ukrývají v osadě uprostřed džungle. Této osadě velí samozvaný vůdce El Toro, kterému se podaří zajmout výsadkovou jednotku. Na kapitánovi teď bude nalézt z této situace východisko, zachránit své muže a pokud možno i pomoci ostatním nenakaženým, kteří trpí pod El Torovou nadvládou.

Po téměř půlročním putování širým mořem začíná na lodi houstnout atmosféra. Námořníci začínají propadat beznaději a panice, po palubě se šíří fámy ohledně toho, na čem vlastně doktorka Scottová pracuje, a co námořníky čeká. Když navíc začne uvězněný Quincy podrývat morálku ještě víc, začíná jít do tuhého. Celou situaci pak ještě zhorší nákaza Dannyho, která způsobí nouzové utěsněné východů, vypnutí ventilace a nárůst strachu na palubě lodi. Část posádky proto žádá povolení opustit loď. Kapitán a jeho velící důstojníci tak musí rychle přijít s něčím, co by morálku námořníků pozvedlo a pomohlo námořníkům přečkat další dny, během kterých doktorka Quinnová bude dělat další testy na opicích.

Poté, co se Rusům podařilo dát svou loď opět do pořádku, vydávají se po stopách Nathan Jamese. Rusové se za žádnou cenu nehodlají vzdát a chtějí získat Dr. Scottovou. Ta ve svém výzkumu narazí na nečekaný problém. Původní virus je desetkrát zhoubnější a vakcína žádná. Navíc jí začínají docházet opice. Jako zázrakem se však ozve tísňové volání z rybářské lodi. Onou přeživší by mohla být osoba, která je vůči viru imunní a která by znamenala průlom ve výzkumu doktorky Scottové. Jenže záchranná operace nedopadne podle představ. Do cesty se americkým vojákům připletou Rusové. Začíná se boj o přežití jak vlastní, tak i jediné naděje na vytvoření funkční vakcíny.

Poté, co byli kapitán Chandler a Tex byli uneseni Rusy, musí sami na cizí lodi bojovat o přežití. Jedinou šancí se zdá být výměnný obchod, který navrhují Rusové. Tedy Dr. Scottovou výměnou za životy kapitána, Texe a Tophetovy rodiny. Rusové totiž mají na palubě Nielse Sorensena, člověka, který je imunním přenašečem onoho zhoubného viru a s jehož pomocí by měli přivést vakcínu na svět jako první a jediní. Na lodi USS Nathan James se mezitím pod dočasným vedením důstojníka Slatteryho rozbíhá záchranná mise, která členy své posádky zachránit ještě dříve, než dojde k obchodu. Nakonec se do léčky, kterou chystají, rozhodne zapojit i Dr. Scottová, která už má vakcínu hotovou. To ale Rusům sdělit nehodlá. S její pomocí, vychytralostí Texe a s pomocí statečného mariňáka Cossettiho se mise musí podařit. Otázkou je, zda se zpět vrátí ve zdraví všichni.

Poté, co je tělo Cossettiho pohřbeno se všemi poctami, které se s tím pojí, rozbíhá se testování prototypu vakcíny na vybraných dobrovolnících. Jenže věci nejdou podle plánu. Symptomy jednotlivých se až moc liší, a někteří dokonce nemají organismus natolik odolný, aby tomu vůbec odolal. Po smrti prvního z dobrovolníků je proto na čase rychle přijít s řešením a upravit vakcínu tak, aby nezemřeli další. Začíná se tedy závod s časem o záchranu životů. S řešením bude muset pomoc jak Bertrise, tak i Quincy. Na souši mezitím stále zuří boje mezi těmi, kteří se zatím nenakazili. Jednak ve snaze zabránit nákaze, ale také ve snaze přežít, získat zásoby a střechu nad hlavou. Mezi nimi je i žena kapitána Chandlera s rodinou.

Vojenská loď USS Nathan James po měsících dřiny splnila, co se od ní očekávalo. Na její palubě je nejen vakcína, ale i lék na zákeřný virus vraždící lidstvo. Jejím posláním je teď dostat se do funkční laboratoře, kde se dá lék distribuovat dál. Jenže najít takovou laboratoř není lehký úkol. Po problémech s původní laboratoří Fort Detrick se nakonec musí plout do Baltimoru. Do města ovládaného těmi, kteří z viru profitují, v čele s Thorwaldem. Do města, kde se oficiálně virus léčí, ale pravda je naprosto opačná. A právě takové realitě bude muset posádka USS Nathan James čelit, což pro nikoho z ní nebude jednoduché.

Prezident Michener je ve svém úřadě již půl roku. Za tu dobu se daří vakcínu šířit mezi populaci Spojených států a jinde po světě. Jenže ne všichni jsou nápomocni. Čína v čele s prezidentem Pengem podle všeho zadržuje vakcínu a používá ji k vydírání okolí. A tomu je třeba zabránit. Krom toho se ukazuje, že v Japonsku vakcína nezabírá a vir zmutoval. Jenže teď, když už doktorka Scottová není mezi živými a její odkaz je připomínán její podobiznou na známkách, není nikdo, kdo by takový problém uměl vyřešit. A tak bývalý kapitán Chandler, teď ministr obrany, odlétá s Valkýrou do Číny řešit nastalou situaci, zatímco posádka lodi Nathan James v čele s novým kapitánem Slatterym řeší problémy s vakcínou ve Vietnamu. A tak zatímco Chandler se starou známou Sashou večeří s prezidentem Pengem, několik členů posádky Nathan James je ve Vietnamu uneseno. Začíná boj o přežití.

Po únosu části posádky Nathan James je třeba rychle jednat. Zbývající členi na lodi v čele s dočasným důstojníkem hledají tři tajemné lodě, které těsně před útokem na klub s unesenou posádkou vpluli do Vietnamských vod. Na palubě těchto lodí by mohla unesená posádka i s kapitánem být. Na souši zatím operují dva týmy. Danny Green a Burk, kterým se podařilo uniknout při přestřelce v baru a kteří se snaží kontaktovat loď a zároveň pomoci unesené posádce, a Chandler s Wolfem, Sashou a její kamarádkou Jesse, kteří se snaží urychleně dostat k lodi, aby mohli naplno zahájit záchrannou operaci. Oba týmy musí bojovat o holý život, aby se nakonec k lodi dostali. Ve Spojených státech zatím prezident Michener a jeho okolí sledují napjatě situaci a z útržků zpráv dohlíží na celou operaci.

Posádka USS Nathan James je vlečena do zajateckého tábora, kterému velí bájný pirát Takehaya. Ten byl původně u námořnictva, kde získal zkušenost s vojenskou taktikou, ale s koncem světa v podobě viru se dal na druhou stranu. Teď má v plánu využít krev unesené posádky pro vlastní prospěch, jelikož americká vakcína nezabírá. Zbytek lodi USS Nathan James zatím po svých unesených spolunámořnících usilovně pátrá. Vydává se do Shanzaie, kam je vedou stopy, a s pomocí místních se posouvají krůček po krůčku dál. Chandler má navíc dávné problémy se Sashou, které vyplouvají na povrch. Do toho všeho musí posádka zpacifikovat nespolupracující Jesse, která jako jediná z nich má vrtulník. Vše vrcholí přímým přenosem ze zajateckého tábora, kde se po nevydařeném útěku chystá poprava posádky.

Unesená posádka se rozhodne využít videa, které Takehaya pouští do světa a zakóduje do něj tajnou zprávu o své poloze. Jenže odkáže ji osazenstvo USS Nathan James rozluštit? A nepřijde na to samotný Takehaya? Zatímco se ostatní snaží unesenou posádku všemocně hledat a bojují s nedostatkem paliva a nepřízní Číny, kterou musí řešit až vloupáním do Pengova sídla a drsným vyjednáváním, houstne atmosféra i doma na pevnině. Lidé se bouří a chtějí, aby prezident vysvětlil, co hodlá s únosci dělat. Novináři videa od Takehayi vysílají do celého světa a Michenerova pozice je čím dál více oslabená. Naštěstí Peng spolupracuje lépe, než se původně očekávalo a posádka je ve výsledku zase o krůček blíže k záchraně svých přátel.

USS Nathan James je uprostřed minového pole, ze kterého není na první pohled cesty ven. Je třeba vymyslet plán, jak miny deaktivovat a loď vysvobodit. Po neúspěšném pokusu manuální deaktivace se ale musí přijít s něčím chytřejším, co by miny ošálilo a zároveň nikdo nezemřel. Navíc musí za pochodu řešit problém s torpédem, které se nezadržitelně blíží a které by mohlo aktivovat ono minové pole. Na domácí půdě zatím prezident Michener informuje okolí o přistoupení na požadavky Takehayi, stahuje flotilu z čínských vod a připravuje se na meeting s lídry světových celků, kterým se začíná jeho styl vlády nelíbit. U Takehayi je zatím stále vězněna část posádky. K tomu ale onemocní Takehayova žena malárií a doktor Rios musí zasáhnout. Na jejím životě teď závisí životy všech vězněných členů posádky.

Posádka lodi Nathan James dál pokračuje v prohledávání ostrovů podle mapy od prezidenta Penga. Nicméně najít unesenou část posádky se stále nedaří. Pomůže až chytrý plán v rukou Garnettové. Jen o pár momentů později se začíná přestřelka na ostrově s cílem zachránit rukojmí a své přátele v jednom. Celá situace se však komplikuje ve chvíli, kdy se na ostrově objeví čínská tajná služba. Nakonec je třeba použít i zbraně většího kalibru. Ani to však nezabrání Takehayovi v útěku. Prozatím. Prezident Michener zatím ve Spojených státech potají jedná s novinářem Jacobem, kterému schůzku s ním slíbila Kara. Zjišťuje, že situace není ani zdaleka tak stabilní, jak si myslel, a že regionální vůdci jdou jeden proti druhému a všichni dohromady proti němu. I tady bude třeba situaci uklidnit.

Posádka lodi Nathan James teď musí urychleně na otevřené moře, aby se zbavila čínských vojáků a mohla kontaktovat velení na souši o úspěchu záchranné operace. Jenže cestu jí zkříží čínská flotila. Až ten, proti komu posledních několik dní bojovali, jim pomůže ztratit se čínské flotile s dohledu a kontaktovat souš, to vše za přísných bojových podmínek na lodi. Takehayova žena Kyoko navíc začíná rodit a je potřeba rozhodnout, zda dát dítěti protilátku, nebo ne. Ve výsledku začne Chandler se Slatterym vyjednávat s Takehayou o formě vzájemné spolupráce. Na souši zatím Jacob dál pátrá po Michenerově minulosti, aby ho dostal z pozice prezidenta. Za tím účelem kontaktuje i Curtise, vraha Rachel Scottové. A to, co zjistí, se nebude Michenerovi, natož veřejnosti, zamlouvat. Převrat se blíží.

Národ truchlí. Prezident Jeffrey Michener je po smrti. Nedokázal totiž unést tíhu své minulosti a poté, co mu ji reportér Jacon Barnes vmetl do tváře, se oběsil. Novým prezidentem se stává Howard Oliver, kterému se stejně jako řadě senátorů nelíbí lístečková potravinová politika jeho předchůdce. A tak jako první krok musí najít její náhradu. Jenže to se Kaře nelíbí a ostře proti tomu vystoupí. Na lodi Nathan James zatím doctor Rios obnovuje laboratoř Rachel Scottové. Posádka se ale chystá na zátah na pašeráka Wu Minga, který je napojen na prezidenta Penga. S pomocí Takehayi se posádce nakonec daří Wu Minga lokalizovat. To ale netuší, že celá síť je mnohem rozsáhlejší, a že i Čína s ním má své plány. Navíc je třeba najít lodě, které jsou označeny tajným symbolem a které slouží jako nástroje pro pašování.

Zelená mlha, která způsobuje genocidu obyvatel a staví je proti americké armádě vezoucí protilátku, se podle všeho vyrábí na ostrově Paraiso. Když se tam posádka lodi Nathan James vydá, zjišťuje, že ostrov je plně obydlen přeživšími, kteří se tam pouze skrývají před nákazou. Ovšem to vše platí jen do chvíle, kdy malá dívenka začne prosit vojáky o pomoc. Všechno je jinak. Obydlený ostrov je jen zástěrkou pro výrobu raket se zelenou mlhou. A za vším stojí Peng. Ten se svou bojovou lodé teď uhání směrem ke Koreji, aby vyhubil další své nepřátele. A v tom mu musí Nathan James zabránit. Je však potřeba podpory, a tak Tom Chandler žádá velení o podporu v podobě lodé Hayward Actal a Shackleton. Netuší však, že plují přímo do pasti. V Bílém domě je totiž špion, který Penga informuje o přesných pozicích lodí a o úmyslech amerického námořnictva. A tomuto špionovi je teď Kara na stopě.

Kara je na útěku. Poté, co byla svědkem dvojnásobné vraždy řízené Bílým domem, se teď musí skrývat a zachránit si život. I ta, které tolik věřila, je totiž ve spiknutí namočená. A tak hledá útočiště i reportéra Jacoba, se kterým si prvotně nemohla vůbec přijít na jméno. Společně musí světu odhalit, co se za zdmi Bílého domu děje. To vše na pozadí probíhajícího dělení amerického území a stavby zdi, která by jednotlivá teritoria měla separovat. U čínského pobřeží zatím dále eskaluje konflikt mezi kapitánem Chandlerem a kapitánem Meylanem. Jeho loď byla potopena a tak teď přebývá na USS Nathan James. To však jen do té doby, než přijde tajná depeše, že Tom Chandler má být zbaven velení. S Chandlerem ve vazbě se ale posádka USS Nathan James odhodlává ke vzpouře ve snaze svého skutečného kapitána osvobodit a nastolit, respektive obnovit starý pořádek.

Kara prchá s Jacobem před pronásledováním, a pomoci jim může jediný člověk. Staronový přítel Tex Nolan. Ten ale sám bojuje o život, a tak se jejich vzájemné setkání stane jednoduchým terčem pro ty, kteří je pronásledují. Společně jim ale mohou vzdorovat, a co víc, společně se mohou pokusit osvobodit prezidenta z moci Allison a poodhalit světu, že za zdmi Bílého domu není něco v pořádku. USS Nathan James mezitím pokračuje k břehům Japonska. Tom Chandler už totiž s pomocí Takehayi zná úmysly prezidenta Penga. Ten chce vyplenit muzeum japonské kultury a celou japonskou rasu vyhladit se vším všudy z povrchu zemského. A tomu musí posádka USS Nathan James zabránit. Podaří se jim tentokrát s Pengem zatočit jednou provždy?

Loď Nathan James má být potopena. Kapitán Chandler to však předpokládá a místo Jamese použije čínský torpédoborec, který zabavil...

Boj o Ameriku se chýlí ke konci. Kapitán Chandler stojí před náročným úkolem, který by mohl navždy změnit jeho život.