El equipo decide infiltrarse en el set de una película en Kazajstán para deshabilitar un misil nuclear de la época soviética que está siendo vendida por terroristas.

Sylvester se reencuentra con su distanciado padre, un general retirado, que pide al equipo ayuda cuando cree que un dictador africano ha descubierto un arma de la segunda Guerra Mundial de destrucción masiva y tiene la intención de usarla.

Cuando el Equipo Scorpion viaja a Irlanda para la ceremonia conmemorativa anual de Megan, Walter descubre que un desastre natural situado en un lago cercano ha creado una nube venenosa que podría matar a todos en el pueblo. A su vez, Cabe y Toby tratan de aliviar la tensión entre Tim y Walter.

Cuando una simple misión para proteger un banco de semillas va mal, el Equipo Scorpion debe salvar a Happy, Sylvester y Cabe, que comienzan a sufrir alucinaciones basadas en el miedo y que amenazan con su vida.

En Halloween, el equipo Scorpion se enfrenta a un caso para demostrar la existencia de fantasmas en el Queen Mary, pero descubren un desastre demasiado real cuando encuentran un "barco fantasma" en riesgo de colisión mortal. Además, Walter considera tomar nota de los intereses de Paige para mejorar su relación.

Una tormenta solar deja sin electricidad la ciudad de Los Ángeles, y el equipo debe ayudar a un joven piloto y su novia que se pierden en el Pacífico sin sistema de navegación o contacto por radio. Además, durante la crisis, Walter debe cuidar a un grupo de compañeros de clase de Ralph, y Cabe trata de decirle finalmente a Allie que la ama.

El lado materno de Paige se despierta cuando el equipo debe salvar a un niño inconsciente e hipotérmico atrapado en la cavidad de la rueda de una avión. Además, la mentira piadosa que Walter le dijo a Paige comienza a pasarle factura, y Paige se da cuenta de que algo está pasando.