被认定为世界遗产的熊野古道——玉仓山悄悄建起了玉仓神社。被宫司的祖父养育的铃原泉水子对外面的世界的生活几乎一无所知。在初中3年级，内向的泉水子想要改变自己，某天早上她剪了自己的头发。那时候，泉水子父母的朋友相乐雪政出现在学校。泉水子，和青梅竹马雪政的儿子深行再会了…。

经过修学旅行一事后，深行决定了自己升学的意愿。另一方面，泉水子给没有去修学旅行的和宫同学转交礼品，泉水子以前依恋着的总是平静温柔的和宫，说出了意想不到的话。这个时候，男同学们突然和深行吵架了，他们的状况有点不同……。

春天到来，泉水子升学到了东京的凤城学园。宿舍的室友是少女宗田真响，她在学园有个弟弟的真夏。开学典礼那天，真响想要转换心情而改变了发型，泉水子也摘下了眼镜。泉水子和真夏一样在C班，深行和真响在A班。与深行分开而感到不安的泉水子觉得同班的留学生同学不寻常。留学生向胆怯的泉水子打招呼……。

真夏和重伤真响的高柳一条做个了结。真响和真夏将弟弟真澄介绍给了同行的泉水子和深行，泉水子才知道真响他们也是“特别的存在”，见到了他们的坚强和觉悟。另一方面，雪政以约聘讲师的身份来到了学园，这使本来距相互靠近的深行和泉水子的距离再次拉开了。一个人向泉水子打了招呼，那是学生会会长如月・金・仄香。

开始放暑假了。泉水子等人一起拜访了真响所在的老家长野，泉水子初次体验到去朋友家玩的心情。宗田家还邀请了在大学担任教授的父亲的学生们，烤肉派对开始了。这个夜晚，突然醒来的泉水子，在院子里和真澄再会了……。第二天学生会执行部在户隐进行集训。于是泉水子知道了学园里复杂的对立关系……。

真响测试了深行作为山伏的能力。感到危险的泉水子拼命试图阻止，这样的自己将深行也卷进来了。这时候，真夏得知了从小就很重要的爱马・泰比生病的消息。真夏听不进去真响的阻止，让真澄代替自己参加集训。对于一个人随意行动的真夏，真响感到了从未有过的难以掩饰的不安……。

真夏消失了。真响认为是真澄带走的，真响也无法一个人把真澄呼唤出来。泉水子想要帮助伤心的真响，如果是姫神的话应该可以呼唤出真澄，泉水子这样和深行商量。但是，姫神并没有出现，泉水子注意到真澄就站在眼前。泉水子请求希望真澄将她带到真夏所在的地方……。

暑假结束了，学园祭的准备开始了。今年的主题是“战国学园祭”，举行的是曾经八王子城攻防的模仿战。以此决定学园第一的位置，高柳打算劝诱泉水子等人加入自己这一边来战斗。随后，另泉水子意想不到的是，自己竟代替真响穿着战国服装在展示讲习会上担任了公主身份的模特……。

学园祭终于拉开了帷幕。泉水子和深行在内的学生会执行部的成员全员着装在学园内巡逻。泉水子的班里是开模拟店的，顺便享受到了热闹，不过，泉水子在心中关于姫神突然出现的时候的事耿耿于怀。一直说着姫神的话题的深行，让泉水子在情感上感到了醋意。之后，泉水子进入了恐怖屋鬼突然遭遇到了……。

晚上深行与真夏在学园内调查，发现高柳设置了咒术设置。真响和真夏为了以防万一，召唤了真澄协助。终于到了学园祭第二日。真响作为大战游戏防卫军的公主，和高柳正面对抗。深行在学园内加强警戒，并且将手机交给泉水子，叮嘱万一出了事情，必须保持联络。但是，趁着只有泉水子一个人的间隙，高柳和留学生们接近过来……。

凤城学院发生了变化，不安稳的气氛飘散开来。通信设备都不能使用了，深行感到了也许是泉水子的原因。但是，和真夏一起赶到了高柳所在的地方的时候，泉水子的身影已经消失了。泉水子一想到自己并不普通就感到害怕，已经无法回到学园了。深行决定将泉水子接回来，但被挡住了去路，八王子城的亡灵们袭击过来了……！