热斗的爸爸答应在他升上小学五年级的时候，为他设计一个网络领航员，这天爸爸果然依约寄来一张RD磁盘，他特地为热斗设计了网络领航员-洛克人！ 正当热斗以洛克人和同学--迪卡欧的气力人对战较劲时，却发现同班同学-美露出事了！！

热斗和美露为了帮玛莉老师追回她被机器狗咬走的包包，来到了一列地下铁的列车上，没想到刚好碰上列车失控的突发状况！洛克人调查出有病毒从中作祟，然而失控下超高速行驶的列车即将撞上终点站，热斗、美露与所有乘客能平安逃过这场大灾难吗？

WWW组织的威利博士又派遣了一个神秘的女孩：色绫丹居进行邪恶的破坏行动，她的网络领航员：彩色人将秋原镇的红绿灯全部陷入故障的局面，弄得到处塞车，甚至引发不少的交通事故，在热斗的洛克人和转学声伊朵的葛莱德的同心协力下，终于将彩色人打跑了…

热斗的学校这次来了一位实习老师：日暮闇太郎，没想到他竟然对伊朵的稀有芯片非常感兴趣，甚至利用强迫的方式逼伊朵的网络领航员：葛莱德和他的网络领航员：数字人进行网络对战，最后还是不敌热斗等人的通力合作…

这次WWW组织竟然控制住了机器水族馆里的安全系统，让所有的机器鱼通通飞到了秋原镇的街头上空，为了阻止这一切，热斗便派洛克人前去水族馆的控制室查明一切，原来控制室又受到了计算机病毒的影响而失控，但在这次的战斗中，到底是谁帮了热斗一个大忙？那个叫鲨鱼人的网络领航员又是谁呢？

WWW组织为了造成人类世界的骚动与不安，这次竟然把脑筋动到了水利局，控制住水利局的安全系统之后，造成秋原镇的用水全部就此中断，引起镇民生活上极大的不便，原来是WWW组织的色绫丹居挟持了水利局技术员的儿子冰川透，藉此进入计算机程序中进行破坏…

为了能够抢先一步玩到最新版的游戏软件，热斗和美露、迪卡欧都留在伊朵家等着午夜12点，就准备好好的享受一下新软件的乐趣，谁知道WWW组织这次派出了电击伯爵来进行破坏，企图将这个软件的原始数据偷走，让所有的小朋友失望…

火野健一每次有个新的计划都会毁在洛克人的手上，因此心生报复，决定派出火焰人找洛克人下战书，约在焚化厂那里进行决斗，没想到后来应战的竟然是美露的网络领航员：萝露，就在千钧一发之际，洛克人终于赶到，解除了萝露的危机…

WWW组织这次派出了瑜珈战士：玛哈尼˙杰玛来对付碍眼的洛克人，他的魔术人竟然利用催眠波将镇上的人都催眠了，但是在伊集院炎山的帮助下，洛克人惊险逃过一劫，炎山究竟是敌是友呢？

眼看着大家期待已久的N1锦标赛就要在今天正式的举行，谁知日暮先生却跑来找热斗帮忙，因为他的数字人在经过规格的修改之后产生了失控的状况，还好有个骷髅人及时出现，将数字人打倒之后，热斗他们才能够在时间之内赶往会场…

热斗的第一场比赛被排在N1锦标赛的第一天下午，与他对觉得竟然是算命师美雪和她的网络领航员：骷髅人，美雪预测热斗将在五分钟之内败下阵来，但在热斗的努力尝试下，美雪放弃了这个坚持，自动脱离程序，让热斗取得了胜利…

热斗和萝露今天都要上场比赛，热斗的对手是WWW组织的火野健一和火焰人，萝露的对手是WWW组织的色绫丹居和彩色人，丹居为了打倒萝露不惜使出卑鄙的手段，但萝露却在伊朵给的稀有芯片的帮助下，在最危急的时候打倒了丹居的彩色人…

洛克人与火焰人再度对阵，洛克人一开始以惊人的攻击让火焰人处于劣势，谁知火野健一却利用会场的太阳能系统提供火焰人主要的能量，让它的威力顿时提升好几倍，会场的温度热得吓人，也因此影响了热斗的战斗力…

伊朵为了替热斗他们庆祝第一天比赛的胜利，决定请他们到大餐厅吃饭，谁知碰上伊集院炎山，用言语奚落他们，弄得热斗对炎山提出挑战，在大街上就开始进行网络对战，引来了威利博士手下的网络领航员的觊觎…

为了能够得到更强大的战斗力，热斗和洛克人在迪卡欧的帮助下，一起在会场的训练室进行最后的练习，而美雪看似中途出来搅局，其实是在 为热斗进行训练，热斗在对抗曼哈尼˙杰玛的魔术人时虽然使出了程序进阶，但是威力和炎山所使用出的效果相比，实在差太多了…

在所有单人赛的赛事结束之后，N1大赛紧接着要进行的是配对赛，第一场比赛就由萨洛关姊姊和迪卡欧配对出击，没想到她们第一次连手就碰到WWW组织的暴风人和炸弹人、面对这两个完全自律型的网络领航员，它们自己就是自己的主人操控者，看得大家全都傻眼了…

比夫司令与热斗这次要连手出席配对赛，对抗自律型网络领航员暴风人和炸弹人，但暴风人它们却让洛克人和鲨鱼人脱离了主人操控者，为的就是让他们无法得到主人的芯片支持，比夫司令和热斗为了救出被带出场的两个领航员，一路向比赛会场附近的灯塔挺进，比夫司令却在这个过程中暴露了他就是阿正叔的秘密

大会为了让曾经打败过一次的网络对战员还有赢得优胜的机会，特别推出了一个败部复活赛的单元，WWW组织的丹居和火野健一利用卑鄙的手段让自己被抽签系统选上，曼哈尼˙杰玛又利用易容术将一片邪恶的芯片送给美露，让萝露在比赛的时候一瞬间变成了邪恶天使，开始打自己的伙伴：洛克人…

当美露为萝露插入恶魔芯片之后，萝露的性情转眼有了绝大的变化，甚至开始攻击自己的队友，还好伊朵等人发现不对劲，开始追查是谁在遥控萝露，熟谙稀有芯片的日暮先生也适时的清醒过来，告诉热斗和美露破解的方法，才惊险的打赢了这一场。

眼看着炎山就要和热斗配对对抗暴风人和炸弹人了，但是炎山的父亲因为临时有事，要炎山到附近的饭店签一份40亿的合约，在与伊朵共乘一个电梯时，意外地被困在电梯里，所幸最后及时赶到会场…

炎山和热斗是参加准决赛的搭档，但是他在一上场后就将洛克人打到一边，准备独自面对暴风人和炸弹人，最后因为长剑的芯片在帮伊朵的时候早就掉了，无法使用程序进阶对付暴风人，差点害得布鲁斯惨遭暴风人的毒手，最后还是洛克人及时使用程序进阶打败了暴风人、晋级决赛…

炎山没想到热斗和洛克人竟然会在N1大赛的期间进步这么多，甚至逼他必须使出进阶程序来对付热斗和洛克人，就在他好不容易得到胜利之际，竟然冒出一个自称叫法老人的网络领航员，一击就让洛克人被删除了程序，它究竟是何方神圣呢？

法老人沉睡了整整20年，以世界之王自居的它，立刻利用网络在世界各地制造出各种异象，为的是证明它拥有这种力量，甚至回到科学署找寻自己诞生时的数据，而热斗的爷爷竟然就是当年创造它的人，这对热斗会有什么影响呢？

热斗和一班好朋友都发现自己的PET上出现了奇怪的饼图案，也都认为这和洛克人必定有一定的关系，在热斗的父亲：光博士的指示下，准备的必备的东西之后便向科学署前进，希望能够找到当初创造洛克人的基础，也就是架构，如此便能让洛克人复活…

炎山和布鲁斯都为了还热斗和洛克人一个人情债，来到了科学署的网络世界里只身与法老人对抗，但是即使布鲁斯已经这么厉害了，仍然不是法老人的对手，在众人的呼唤下，洛克人总算清醒，与布鲁斯一起打败了法老人，及时将人造卫星的轨道修正过来，避免了卫星坠落的危机…

热斗一行人来到南方的岛屿：爪哇岛玩，没想到却碰上这里近来传闻中的主角：那艘幽灵船，为了救被幽灵船带走的阿正叔和小透，热斗和伊朵等人勇敢的来到幽灵船上，消灭了船上计算机中的病毒…

网络上有一个新兴偶像：小秋，受到大家非常广大的欢迎，最近还主办一个真实小秋的比赛，希望能从小秋的歌迷中选出一名才艺双全的代言人，没想到参赛的人全都离奇的失踪，原来这次又是网络病毒捅的楼子…

热斗和洛克人这次来到天堂市，没想到在参加欢迎庆典的时候，竟然因为人多把洛克人的PET放在一边，被贫民区的小孩偷走了，热斗在找寻洛克人的时候，也因此被扯进达利尔市长和贫民区的恩怨之中…

米莉欧妮是一个企业的负责人，但是以收集网络领航员为乐，甚至成立了一个网络领航员博物馆，利用奖品吸引网络对战员来参加比赛，再将中意的领航员纳为己有，这次她看中的是洛克人，好在炎山也刚好在场，派出布鲁斯事实为洛克人解围…

正当热斗在前往这趟世界之旅的下一站途中，他所搭乘的公交车竟然发生引擎故障的问题，为了能够寻求援助，热斗特别跑到附近一户人家借用电话，没想到却碰上了前WWW组织的成员：电击伯爵得挑战…

热斗这次来到世界之旅的最后一站：纳玛斯提，这里是个以咖哩为名的大都市，而热斗平时最喜欢吃的就是咖哩，于是就抓住这个机会大快朵颐，却不知这其中原来暗藏了前WWW组织的干部：曼哈尼杰玛的阴谋，一场咖哩大对决于是展开…

在热斗进行世界之旅的期间，日本的网络中已然建立了一个名叫网络城市的虚空间，美露迫不及待的带热斗和洛克人了解网络城市，但此时伊朵家的网络却遭人入侵，害得伊朵差点被瓦斯毒死，幸好有洛克人实时阻止了歹徒的网络领航员，才没酿成悲剧…

网络城市在病毒的肆虐下，竟然下起了雨，致使网络之城的数据也在逐渐消失当中，洛克人一行人为了拯救这批数据和网络之城，同心协力一同歼灭网络之城地底下的病毒工厂，总算是有惊无险的克服了这一关

福音会的高斯˙玛格尼斯利用来日本的机会，透过日暮闇太郎的计算机将日本银行各大企业的账户内存款金额进行偷天换日的大动作，让绫小路家的存款一夕之间变成了零，金融就此混乱，经过洛克人和布鲁斯的出面，总算又让一切恢复了原样…

福音会为了摧毁网络世界和现实世界，在电算市埋伏了许多安装了他们的芯片的行动式企鹅冷气机，时机成熟后，便利用这些企鹅让电算市整个冰封在冰雪之中，眼看着日本全国都要遭殃，还好有洛克人、热火人的努力、才得以将冰冻人赶走，暂时解除了危机…

福音会为了摧毁网络世界和现实世界，在电算市埋伏了许多安装了他们的芯片的行动式企鹅冷气机，时机成熟后，便利用这些企鹅让电算市整个冰封在冰雪之中，眼看着日本全国都要遭殃，还好有洛克人、热火人的努力、才得以将冰冻人赶走，暂时解除了危机…

前WWW组织的干部火野健一的网络领航员：火焰人受到病毒工厂和冰冻人的连续攻击，计算机数据已经遭到严重的损害，在名人的建议下，将他的战斗经验值移植到热火人的身上，果然成功的将冰冻人打退，但是他们接下来还会面对福音会什么样的阴谋呢？

剪刀人五兄弟听了长老说的故事之后，认为洛克人是个十恶不赦的大恶人，就冲动的决定要为世人除害，而这点正好中了阴影人的阴谋，洛克人被困在不知名的网络之城里，还好有炎山和布鲁斯帮忙，才打退了阴影人，洛克人也才得以回到热斗的身边…

奶油岛是个以科技文明的小国，这次奶油岛的公主为了推广反病毒程序特别来到日本，没想到典礼却因为细故必须延期举行，原来是奶油岛的布莱德公主见到这个难得的机会，特地退除掉公主的身分，在热斗的带领下在日本玩了一天…

荒驹虎吉是个网络西洋棋的高手，受到阴影人的挑拨，便来到东边的城市寻找能够和他一决高下的网络对战员：热斗，但是热斗对网络西洋棋一窍不通，还好有美露和萝露在一旁帮助，才得以不致出丑，而虎吉最后也被他们的友情所感动了…

网络世界的猫病毒在一次雷击的晚上跑出了研究所，让网络世界里的网络领航员和所有病毒都开始慢慢变成了猫，为了挽救大家的危机，热斗的爸爸还特地赶回来与研究所的人员制造疫苗程序，最后才有惊无险的让一切又恢复了原状，但拉修却是这次事件中最大的受益者，从此可以随出现在现实世界中…

前WWW组织唯一的女干部：色绫丹居受到福音会干部的挖角，决定转任到福音会工作，没想到她一心想要再度发光发热的梦想没实现，反而彻底了解了福音派会干部高斯对WWW组织的鄙视，遂决定回到WWW组织的朋友身边…

热斗的班上来了一个转学生：星田球太，因为他父亲星田球马被交换球员的关系，必须常常搬家，更换学校，好不容易才习惯了前面的学校，又得转学，热斗为了替他打气，特地在球场与他以前的朋友进行一场网络棒球赛，也因此建立了深厚的友谊…

奶油岛布莱德公主的网络领航员骑士人，不知因为什么原因突然失控，恣意进行破坏，甚至还想破坏最重要的防火墙，布莱德公主只有求助于热斗，最后热斗他们才发现这一切原来是来自黑暗之岛的烧夷弹人搞的鬼，所幸一切还得以挽救…

比夫司令这次上月球去进行一些系统的修复工作，没想到会在月球上发生意外，他身上的氧气又无法维持太久的时间，热斗等人在一次巧合中得知比夫司令出事，便前往宇宙开发局，协助搭救比夫司令，也是因此才知道原来有个名叫星球人的网络领航员霸占了月球…

威利博士在生前事先预录了一段画面，声明他早已将自己的大脑复制在一枚芯片上，作为WWW组织东山再起的依据，为了得到这枚芯片，前WWW组织的四大干部和 福音会的高斯、还有热斗等人都急忙赶到一个海岛上，而众人也在这里发现了一个惊人的秘密：原来高斯和电击伯爵竟然是亲兄弟…

伊朵父亲经营的卡布冈公司最近新推出了一种网络赛车为了达到宣传和纪念的目的，特地在网络城市举办了第一届的网络赛车大赛，广邀各路好手参加，参赛者可以透过PET插入附属芯片随时更新赛车的配件，最后的优胜眼看就要落入布鲁斯或洛克人之手、没想到…

福音会的首领这次利用一个计算机魔物，在世界各地的网络之城恣意行动，吃了不少的网络领航员，陆续有网络领航员失踪的消息便不胫而走，为了查明其中原因，大家都动员了许多力量，但洛克人和布鲁斯连手都不是这个福音兽的对手，它究竟还会引发什么样的灾难呢？

神秘的网络领航员：霍提人的出现引起了福音会首领的注意，因为福音会派出的福音兽竟然在看到霍提人之后就立刻转身而去，冷冻人奉命除掉霍提人，却碰上热火人前来复仇，就在福音兽一步一步统治了网络世界时，幕后的首脑：威利博士才露出了他的真面目…

就在热斗等人和前WWW组织的重要干部连手起来对抗福音的时候，他们竟然意外的发现，一直躲在幕后控制福音会的人竟然是威利博士，色绫丹居和曼哈尼杰玛在得知这个事实后，都决定放弃攻击，而福音又将法老人的化身：霍提人给吞掉了，热斗他们到底该怎么办才好呢？

面对福音强大的威力，连霍提人都被它吸收了，为了阻止福音将网络世界全部吸光，洛克人和热斗决定使用额外密码，就在密码的力量消失之后，洛克人竟然也开始进行第五段的变换模式，也因此彻底将福音兽打倒，拯救了网络世界…

热斗等人到伊朵家去吃蛋糕，没想到却碰上吸尘器失控的局面，被病毒感染的吸尘器把所有点心和洛克人它们的PET都吸进去了，弄得热斗一行人不得不到伊朵家布满机关的两个神秘区域探险，处处提心吊胆的…

日暮先生和阿正叔都非常爱慕热斗的老师：玛莉老师为了争取她的芳心无所不用其极，但在日暮先生得知玛莉心仪比夫司令之后，就决定向比夫司令挑战，进行一场堂堂正正的网络对决，赢的人就可以赢得与玛莉老师约会的机会，没想到最后赢的人却是…

迪卡欧的弟弟奇小欧一直在阿梅洛柏市就读那里的天才幼儿园，这次到日本来玩三天，迪卡欧为了在弟弟面前树立哥哥的形象，特别请大家帮忙配合演一出戏，谁知刚好卷入曼哈第一餐厅和隔壁的乌龙面店之间的纷争，差点让这个谎言曝光。

炎山和热斗网络对战到正精采的时候，突然接到公司的通知表示要他去处理一个合约的签署，炎山赶往指示的地点之后，却发现是一家不起眼的公司，但在他耐心的等待下，终于感动了这家公司的老板，虽然这一天内一波三折，最后还是取得了合约…

热斗的爸爸光博士正在研究一项将计算机世界实体化的软件，没想到研发完成后，竟然因为潜藏在购物广场服务器中的病毒入侵次元核心，使得整个装置产生不稳定的现象，让病毒入侵到真实世界中，热斗一行人在得知这个消息后，立刻赶往现场扫毒…

光博士开发了可以融合主人操控者与领航员的同步晶片，可是却被阴影人偷走了，就在科学省被异次元空间包围时，热斗使用仅存的同步晶片与洛克人双向融合，打败了野兽人。

热斗与美露到网路城市参观，没想到却遇到巨大的幽浮在毁坏网路城市，洛克人进入幽浮中才发现又是野兽人搞的鬼，野兽人这次又开启了异次元空间，热斗与洛克人双向融合后一举消灭了野兽人。

热斗为了上次输给雷火一直耿耿于怀 这次为了破获偷袭网路银行的大本营 拼了全力 当洛克人正与犯人沙漠人进行苦战时 侦察人适时帮助洛克人藉由以侦察人的灵体共鸣 洛克人终于打败沙漠人

阴影人一直想星云王国的神秘男子的控制、所以它计画在和他拆伙之前要先拿到他的所有黑暗晶片、为了这个目的、它故意将黑暗晶片的秘密工厂所在地泄漏给网路警察知道、让热斗和炎山先闯进工厂…

泡泡人认为他之所以一直无法打倒洛克人、就是因为洛克人有灵体共鸣这项特殊的能力、所以他也决定结交朋友进行灵体共鸣、好不容易有水人和冰冻人肯和他做朋友、但他就是无法进行灵体共鸣 …

炎山的IPC公司与科学省联手研发新型的PET、不但可对抗黑暗晶片的力量还能够保护网路领航员、为了阻止这项发明、雷射人派了布鲁斯和重力人前来盗取新型PET、还好在炎山和热斗、洛克人的努力下得以挽回颓势…

洛克人有一次碰巧在新网路城市救了水人之后、水人从此喜欢上洛克人、片刻不想离开他、但是洛克人又刚好碰上灯炉人前来挑战、身上黏着一个水人实在太不方便了、不过这次还好有水人的帮忙、才让洛克人打败了灯炉人高热的攻击 …

伊朵发现太空中的宇宙碎片…也就是宇宙垃圾的状况不太对劲、深怕会影响到自己公司的宇宙航空站、便找了热斗等人上太空去对付在太空中的垃圾人、最后才了解垃圾人只是太过于寂寞、才把垃圾收集起来当成了自己的朋友…

这次为了逮捕前来日本与星云交易黑暗晶片的福音会首领：高斯˙玛格尼斯、比夫司令和他的两个手下：美雪美雪、黑玫瑰假面都一起回到日本、但为了保住比夫司令的身分之谜、众人使出了各种方法…

热斗在对付重力人的时候差点败在它的手上、还好有网路警察岬刑警和他的网路领航员：棱镜人适时出现、将重力人封锁在光之迷宫里、此时科学省正在研发对战晶片传送门、好改善PET只能准备五枚晶片的缺点…

岬刑警误信百合子的话、利用黑暗同步晶片进行双向融合、除了对网路领航员：棱镜人造成伤害之外、更对他的身体和精神上也造成极大的影响、热斗为了要救他只有想办法解除他的双向融合…

星云知道洛克人在之前对抗棱镜人的战斗中受到重创、便在他还在修复期间前来攻击、黑暗机器生命体都想趁着这个机会抢头央B还好有雷火、侦察人和拉伍、闪电人前来支援、才没让它们逮到这个空档造成太大的损害…

新型的PET总算完成了、但是在它的初始化还没结束之前、星云的雷射人又派遣布鲁斯前来破坏新型PET、在亚妮塔和炎山的誓死保护下果然守住了PET、当初始化正式完成时、它所产生的效力也超乎所有人的想像…

热斗自从得到新型PET之后、就因为它强大的力量而沾沾自喜、炎山看到这个状况觉得非常不妥、特别请拉伍在回国之前配合自己演了一出戏、希望能够藉此挫挫热斗的锐气…

洛克人在进行网路对战的时候、因为热斗插入的一枚晶片、让他和萝露、冰冻人都被吹到了凯萨岛、热斗等人找日暮暗太郎问清了状况之后也跟着去了凯萨岛、竟然碰上百合子想要盗取凯萨像的这个插曲、适时加以阻止…

星云的人这次又计画利用火花人让火车失控通通撞进电算车站、让人类产生战栗与恐惧、但是热斗刚好在这列火车上、在他和萨洛马的努力下、总算及时挽回了原本即将发生的悲剧…

夏洛国是世界上的主要稀有金属产国、星云这次派遣冰人攻占稀有金属的矿山、目的在于量产黑暗晶片、为了阻止他们的野心、热斗大老远的从日本跑到夏洛国、谁知向来服从纪律的雷火竟然会违背命令…

网路城市突然出现不明物体绑架领航员，经过炎山的调查有可能跟车站前的电玩游戏有关，于是让萝露做饵，引诱敌人上钩，最后发现幕后居然是快板人在搞鬼，就在热斗与炎山逼问快板人是否是星云的党羽时，福音出现了

美露因为帮忙热斗的爸爸做实验，因而获得了两张游乐园的门票，开始她跟热斗的第一次约会，可是没想到剑人居然从中作梗，破坏约会的气氛，就在热斗正要与洛克人双向融合时，剑人将晶片打掉了…

热斗在网路对战时，遇到转助爷爷，知道他因为孙子的央求而勉强答应参加网路对战，于是自告奋勇的教他对战晶片使用的方法，没想到转助爷爷自己发明的电动陀螺因为受到病毒的入侵失去控制，开始攻击转助爷爷的孙子光之助，就在千钧一发时，转助爷爷救了大家

热斗有一份暑假作业是自由报告、为了不输给迪卡欧和伊朵、热斗坚持要抓到大型的昆虫好和他们媲美、谁知却不知不觉来到一座石塔中、遇到各式各样诡异的状况、还遇到了看守石塔的领航员：雾人…

美露帮忙朋友照顾一只小猫咪、和可爱的小猫相比之下、莱西就显得非常的不懂事和讨厌、弄得美露和热斗对拉修都有怨言、让拉修难过得离家出走、也因此吃了不少的苦…

利卡尔制造了可以防止雷达侦测的人造卫星、为了能够让布鲁斯变回原样、炎山想尽办法找出利卡尔博士的藏身地、但他却派遣黑暗机器生命体前来阻挠、这场攻防战到底会有什么样的结果呢？

热斗和伊朵一行人搭乘伊朵家的太空船就进入宇宙要去找寻利卡尔博士的下落、但利卡尔为了阻拦热斗、竟然派出布鲁斯来对付他、争取他进行最终计画的时间、他的最终计画到底是什么？会对人类世界造成什么重大的影响呢？

原来百合子就是玛莉一直以为早在15年前的那场飞机意外中丧生的双胞胎妹妹、在百合子遭到岬刑警追击的时候意外被车撞之后、百合子的记忆全都恢复了、原来她是被迪奥选为侦查地球的探员、从小由威利博士扶养长大、但是迪奥是什么？星云和威利博士之间又有什么关系呢？

为了能够让布鲁斯恢复原样、科学省和IPC研发的疫苗晶片和异次元转换器一起派上用场、由热斗和洛克人亲自上场对付变成黑暗机器生命体的布鲁斯、炎山又在最紧要的关头上阵、总算将被封印住的布鲁斯找了回来…

阴影人在佛鲁迪的帮助下再度复活, 誓言要找利卡尔博士抱仇、但是这场邪恶对邪恶的决战、阴影人根本就不是利卡尔博士的对手、三两下就被删除了…

卡尔博士为了达成藉住黑暗机器生命体以统治整个地球的目的, 甚至不惜和雷射人进行融合, 与洛克人等网路领航员作战, 热斗和洛克人差点不敌, 但在所有网路领航员好友的帮助下, 终于证实了邪不胜正的道理, 保住了人类世界的和平…

神秘彗星接近地球，令地球的网路世界起波澜，巨大病毒竟然实体化到处搞破坏，当仁不让的热斗和炎山再次派拍档领航员洛克人和布鲁士攻坚，虽轻描淡写地打败病毒，但却找出问题所在，原来来自神秘彗星的外星领航员迪奥要「审判」地球，地球危在旦夕，凶险的战斗即将展开…..

神秘彗星接近地球，引起连场网路大战，先由洛克人和布鲁斯力斗科鲁迪，随而带出外星领航员迪奥要审判地球的重大问题。热斗和炎山以「双向融合」的方式分别带同洛克人和布鲁斯进入彗星网路，并找到外星领航员迪奥。迪奥表明对「双向融合」感兴趣，并要以此为题来考验热斗……

迪奥开始考验人类，首先赐行星生命体给心术不正的驯兽师犬饲猛雄。生命体化身为网路领航员野兽人后，网路世界乱作一团，热斗和炎山马上出动，但亦未能压制野兽人，幸好这时热斗之父祐一郎完成「异次元空间发电机」，提升了洛克人和布鲁斯的战斗力。经一番战斗，两领航员合力打败野兽人，让人类过了首关「试练」。

行星生命体的威胁 迪奥开始考验人类，首先赐行星生命体给心术不正的驯兽师犬饲猛雄。生命体化身为网路领航员野兽人后，网路世界乱作一团，热斗和炎山马上出动，但亦未能压制野兽人，幸好这时热斗之父祐一郎完成「异次元空间发电机」，提升了洛克人和布鲁斯的战斗力。经一番战斗，两领航员合力打败野兽人，让人类过了首关「试练」。

近日发生一连串的奇特窃案，失物尽是威利博士的收藏品，热斗和炎山合力侦查下，发觉最可疑的是情圣查理，洛克人和布鲁斯更与此人的领航员螺旋桨人在网路中交起手来，几个回合过后，真正窃匪沙漠人终亮相，其操控者竟是电视台导演砂山登，一时间，局面变得更混乱，最后洛克人和布鲁斯虽全身而退，但看来砂山登仍会再临……

热斗认识了一位行径大懵的OL叶月唯，后发觉此女已成为迪奥代理人斯拉的目标。斯拉利用她对公司的怨气，以行星生命体化成「石头人」袭地球网路，热斗马上派洛克人应战，但石头人实太利害，洛克人的武器全数被变为石头，幸好洛克人情急智生，改变战略，终打败石头人，令一切回復正常。

洛克人和布鲁斯参加「领航员赛车」，唯云云车主中有一个心术不正的西古雷，其执令斯拉有机可乘，一场弘扬体育精神的赛事顿成为赛车的「杀戮战场」。西古雷的闪光人屡出矛招，令多部赛车出事退出，洛克人和布鲁斯唯有奋力还击，最后将闪光人击败。西古雷虽败阵，但百足之虫的性格驱使他投向新WWW…

亚美罗巴发生类似陨石坠地的神秘大爆炸事件，热斗和炎山一众往查究，发觉此陨石坑有时空偏差的现象，后又受大批已灭绝的病毒袭击，幸好危急间一自称「卡尼路」的神秘领航员出现，为洛克人和布鲁斯化解危难。事后，炎山获得「迪奥徽章」，并决定留在亚美罗巴继续查究神秘大爆炸之事，热斗则返回日本…

网路罪犯高斯连同其领航员磁铁人被判重刑，其女儿特斯拉马上以「新WWW」领袖之名宣称要反击，如是者，由热斗挂帅的网路警察马上镇守监禁高斯的网路看守所。未几，果见已归附新WWW的犬饲和砂山攻来，经一番大战，当热斗以为自己稳操胜券时，特拉斯才亮出皇牌，一举劫走高斯和磁铁人，大壮新WWW声威。

际遇未如理想的「影像作家」纳尔西.秀被斯拉利用，以行星生命体「影像人」的力量弄得全电算市一片粉红，热斗和直升机师查理分别派领航员洛克人和螺旋桨人查究，结果演变成网路大战，第一回合洛克人和螺旋桨人吃了小亏。影像人食髓知味，再次出动，但这次洛克人已激出斗志，和螺旋桨人「灵体共鸣」，成功打败影像人。

新WWW的成员犬饲猛雄有所行动，派其网路领航员野兽人将市内的汽车变成野兽，一时间，全市乱作一团。热斗与名人一同展开行动，起初处处受制于「野兽汽车」，幸机智的热斗想出以敌制敌的一招，方令洛克人顺利进入网路世界，再加上神秘网路领航员卡尼路现身相助，洛克人终打退野兽人，令世界回復正常。

石屎森林 新WWW的成员犬饲猛雄有所行动，派其网路领航员野兽人将市内的汽车变成野兽，一时间，全市乱作一团。热斗与名人一同展开行动，起初处处受制于「野兽汽车」，幸机智的热斗想出以敌制敌的一招，方令洛克人顺利进入网路世界，再加上神秘网路领航员卡尼路现身相助，洛克人终打退野兽人，令世界回復正常。

Lan meets a girl named Jasmine from the country of Choina. To complete her training as a pharmacist, Jasmine seeks a rare flower, and Lan agrees to help her. However, a man named Bengel in a medicine company hopes to steal the medicine that Jasmine is concocting, so he kidnaps Jasmine and threatens to delete her NetNavi Meddy if she doesn't give up her secrets. Lan and MegaMan manage to rescue the two from the perilous situation.

BubbleMan returns, and this time, he seeks a rare treasure hidden in the depths of the internet. He joins up with IceMan and SpoutMan to undergo this mission, but MegaMan and Roll are close behind to keep the young NetNavis out of trouble. MagnetMan also tails the group, hoping to snag the treasure for himself.

落泊的程式研究员伊汪因为得不到上司赏识而走入邪道，以其超级压缩方法来掳走众多领航员，网路战警炎山和拉伍追查之下，从热斗之父处得到灵感，诱出伊汪，大战随即展开，经一番苦斗，炎山和拉伍的领航员布鲁斯和闪电人合力打败伊汪的冰人，并将伊汪绳之于法。

骇客马克和哈利两兄弟为怕罪证落入网路警察真边手中，遂借用行星生命体重力人的力量来谋害真边，令真边掉进了体重急增的迷雾中，热斗协助追寻根源，混乱间搞出一幕潜艇飞天事件，经一番战斗，洛克人在卡尼路协助下终打败重力人，令一切回復正常，马克和哈利兄弟也难逃法网……

骇客马克和哈利两兄弟为怕罪证落入网路警察真边手中，遂借用行星生命体重力人的力量来谋害真边，令真边掉进了体重急增的迷雾中，热斗协助追寻根源，混乱间搞出一幕潜艇飞天事件，经一番战斗，洛克人在卡尼路协助下终打败重力人，令一切回復正常，马克和哈利兄弟也难逃法网……

雷火之旧友伊利亚来日本参加西洋剑比赛，以无敌姿态杀入决赛之同时，市内的美术馆内的古代武器相继被武士人盗走，随热斗侦查此案的雷火发觉伊利亚有可疑，遂设下圈套引伊利亚露出马脚，经一番激战，伊利亚回头是岸，反助洛克人和检索人打败自己的领航员武士人，从而化解了这次事件。

坏蛋土门凯的领航员烧夷弹人在逃避追捕时躲进了烟花工人六尺玉燃次的PET中，并展开了一段奇缘。在燃次的教化下，烧夷弹人戾气渐消，但土门凯不肯放过他，且令他回復行星生命体的可怕面貌，期间热斗和洛克人加入战围，经一番苦战，终于阻止了一场大灾难。土门凯被绳之于法，而烧夷弹人则重获新生，正式成为燃次的拍档。

新WWW总动员干扰通讯卫星，藉此令世界陷于混乱。行动期间其总裁特拉斯遇上情圣查理。查理不畏风暴将特拉斯送到「工作地点」，此举打动了特拉斯的心扉，但两人毕竟是对立者，当查理知道自己助纣为虐后，马上补过，派螺旋桨人修復被干扰的卫星系竟，化解了一场灾难。

干探岬悟郎昏迷三个月后甦醒，随之而来的是一场网路大战，军用的领航员卡尼路受重创，返送到科学省急救，接而来的是连串银行数据失黐市件，当中又涉及威利博士之女百合子。洛克人出动对付偷取银行数据的行星生命体炸弹人，经一番苦战，在稜镜人和针状人的配合下，终打败炸弹人，平息了一场风波，唯在背后搞事的特斯拉又有新目标….

这次热斗和班上到水利局去教学观摩、没想到整个城市的自来水就出了状况、原来是黑暗机器生命体泡泡人在搞鬼、为了帮助大家有便利的水可以使用、热斗和洛克人虽然有些争吵、还是完美的完成了使命…

黑暗机器生命体闪光人出来作乱、弄得学校的电灯都出了问题、镇上也到处发生错乱的现象、但是洛克人显然不是闪光人的对手、便向萝露借用力量、进行灵体共鸣、终于打败了闪光人…

玛莉老师和小透成立了一个温泉社、要研究温泉的幼蔺M成分、热斗和美露、奇小欧参加之后、还以为可以藉此机会泡泡温泉、没想到他们的规矩一堆、根本就没泡到温泉…

Dex has returned to DenTech City and, giving up his dreams of being the strongest NetBattler, has now embraced a life as a curry chef. Dingo also moves to DenTech to work for the original WWW's curry shop. Meanwhile, Sunayama and DesertMan work together in their latest scheme, but Yahoot, Dex, and Dingo work together to stop him.

日暮先生抽奖抽到了两张保龄球馆的招待卷、邀请玛莉老师一起打球、热斗和美露作陪、原本数字人想暗中帮忙日暮过关、谁知保龄球人的突然出现反而帮了他一个大忙…

一个名叫植物人的黑暗机器生命体这次突然让秋原镇的电力产生中断现象、弄得铁路交通、银行业务种种会用到电脑资料的业务都遭到了阻碍、热斗在名人的指示下立刻前往调查、还与火焰人一同解决了问题…

热斗和洛克人培养出的默契超乎外人所能想像、这天来到科学历史园、发现野兽人作乱、甚至因为镜子的关系产生了真假热斗、让洛克人一时不知该听哪个人说的话、但最后还是靠着他们的默契、打破重重难关、打倒了敌人…

迪卡欧跑到夏威夷岛上找www组织的四个成员拜师学艺、这天以为自己学成了就回到日本找热斗挑战、殊不知www组织的人根本就是故意输给他的、为的是避免这个大麻烦继续待在那里困扰他们、但洛克人和灯炉人对抗的时候还好有气力人帮助、才得以胜利…

Lan and Dex travel to Choina in hopes of finding a medicine for an ill panda bear in DenTech's zoo. There, they meet Cardamom, the grandfather of Jasmine. Meanwhile, many people in Choina wish to steal Cardamom's medicinal secrets, so Lan and Dex team up with Jasmine to help stop such a villain.

传闻有人私卖黑暗晶片、造成很多网路领航员失去控制、热斗身为网路战警奉命调查此事、却发现这件事和自己的玛莉老师有关、原来这一切都是神秘男子和阴影人设下的陷阱…

黑暗机器生命体利用异次元空间盗取稀有金属、如此一来就可以制造出更多的黑暗晶片、为了阻止它们的野心、热斗和洛克人必须不断的尝试、利用双向融合进入异次元空间对付灯炉人…

伊朵到了国王岛之后就开始设计游戏程式、以自己为故事的主角、设计出名为草莓公主的游戏程式、谁知道公主这个主角的资料却被病毒给偷走了、于是她就用假 mail骗热斗、美露和玛莉老师到了国王岛、帮她找回资料…

Yai holds a NetNavi design contest, and Viddy is so thrilled to participate that he quits his job with Neo WWW. However, upon winning the contest, Viddy is disqualified because the contest is restricted to children. Enraged, Viddy begins transforming AyanoTech's game characters into rabbits, but Lan and MegaMan intervene to stop Viddy's rampage. Viddy returns to his life at Neo WWW.

新WWW总裁特斯拉为自己预祝生日，派其手下每天都在网路中搞小动作，令网路战警热斗疲于奔命，幸好网路警探岬悟郎看出事件脉胳，出计替热斗锁定敌人踪迹，唯洛克人以寡敌众，全程均佔下风，幸最后关头百合子的领航员针状人出现，击败特斯拉的磁铁人，局面才扭转。

敌对的夏洛国和克里武兰国以合作研究「双向同步」而化解仇怨，分别代表两国的网路战警雷火和布莱特亦展开了友宜，但期间发生双向同步研究所遇袭事件，查看之下发觉已有一支行星生命体军团在冰城内蓄势待发，形势危急下，雷火和布莱特合力打败作梗的空气人，并消灭了军团，为两国建立了长久友好的基础

偷车贼阿剑派其行星生命体车灯人入侵汽车博物馆的展品「自动导航系统」，令市面的汽车成为他的囊中物，幸系统中的导述小姐露德通风报讯，让热斗和洛克人及时出战，经一番战斗，终打败车灯人，瓦解偷车集团之余，也保护了露德得尊严。

影子人在神秘男子的委托下、到处破坏世界各地的X管制塔、热斗在得知消息后、与洛克人出面阻止、但是根本不敌使用了黑暗晶片的影子人、还好有以执行命令为第一要务的侦察人帮忙、才删除了影子人…

主题公园「恐龙天地」受不明病毒侵袭，热斗等人往查究，发觉乃新WWW成员纳尔西的杰作，随之而来的例牌是一场激烈网路对战。洛克人面对庞大的病毒军团和影像人，处处受制，危急关头，美露和领航员萝露借助拉修的晶片数据，成功进行「双向融合」，令洛克人得到足够的支援，反败为胜。

为了查出制造黑暗晶片的工厂、得意忘形的热斗以为自己绝对没有问题、竟然大意的中了沙漠人的圈套、差点害得洛克人被删除、自己就此埋在沙堆中、还好有炎山和布鲁斯出面相助…

亚美罗巴的电脑网路出现可解开任何电脑锁的骇客，炎山和拉伍苦苦追寻下，终锁定犯人拉德，再追查下，又发觉教拉德开锁秘技的狱友将卡斯二十年前曾和神秘领航员卡尼路接触，疑云重重之下一场惨烈网路大战展开，最后炎山和拉伍的领航员布鲁斯和闪电人发挥威力，打败拉德。

热斗等人从国王岛回来的途中经过夏威夷岛、打算去看看迪卡欧、顺便吃吃曼哈二号令人怀念的咖哩饭、没想到卡欧因为一个网路急救箱的关系、让气力人瞬间增强了好几倍实力、一下就让洛克人处于劣势…

新WWW总裁特拉斯因年龄问题而恼恨网路警察，趁网路警察搞机械人擂台赛时发烂，攻击力极强的机械人FP30顿成为她的俘虏。乱局一发不可收拾之际，热斗和烟花工人六尺玉燃次力战FP30，但特斯拉确实怨气太深，连融合后的洛克人也佔不到甜头，最后还是由特斯拉之父来解开困局…

热斗一行人来到新落成的海洋塔逛街 ,没想到遇到野兽人来势汹汹的攻击,就在千钧一发之际,金属人与洛克人灵体共鸣产生的金属灵体,发挥强大攻击力,一举删除了野兽人…

早被删除的黑暗机器生命体阴影人透过过去隧道重生，来到现世，以强悍的战斗力力压洛克人和布鲁斯之余还令野兽人及闪光人吃尽苦头。热斗之父祐一郎想出「返回过去」之法来解决此事，遂安排洛克人和布鲁斯返回二十年前的世界，但这时阴影人出现，挟持洛克人和布鲁斯，齐齐进入了过去世界…

热斗与来自夏洛国的雷火 一同赴秋原镇处理案件 就在热斗不敌影像人的攻击 处于危险之际 雷火发挥智慧 救了热斗

洛克人、布鲁斯和阴影人透过过去隧道进入了二十年前的网路世界，经一番战斗，神秘的卡尼路出现，协助洛克人对抗阴影人，但耐何洛克人竟染上黑气，一时间失去常性，幸卡尼路和布鲁斯仍然奋勇作战，为热斗制造出传送疫苗晶片的空间，洛克人接触过疫苗后醒觉过来，返回现实世界，但危机仍然存在….

丁戈发现自己的「图腾大人（图腾柱）」柱被安放于博物馆中，遂用尽一切方法盗取之，殊不知新WWW成员也视之为抢夺目标，双方交起手来，同时间，热斗得知新WWW有所行动，亦加入战围，一场混乱的网路战随即展开，经一番战斗，丁戈的领航员战斧人使出浑身解数，打败新WWW的领航员，除力保「图腾大人」不失外，还引证了自己的「迪奥选定者」身份。

炎山与布鲁斯成消灭沙漠人交给佑一朗做深入研究 邪恶势力为了防止秘密被揭开 派闪光人至科学省营救沙漠人 炎山与热斗同心协力 一同打倒闪光人 沙漠人与闪光人也因为滥用黑暗晶片 导致自己的资料被侵蚀走向灭亡之路。

乔伊娜少女茉莉花再次来到日本，热斗当然耐心地招呼她，期间发生海豚被虐事件，喜爱动物的茉莉花追查下发觉原来新WWW的成员犬饲利开海豚来贩运黑暗晶片，遂伙同热斗挑战恶势力，两人的领航员美蒂和洛克人力战野兽人，过程惊险万分，但邪不能胜正，野兽人最后也落得败走收场。透过此战，茉莉花亦确定了自己乃被迪奥选中的人。

市内举行「金冠小姐选举」，包括色绫丹居、特斯拉、真边等一众有自信的美女马上报名参加。比赛有结果，早想抢夺金冠的特斯拉使诈获胜，成为冠军，更马上在众目睽睽下展示盗黐本能，随即而来的当然是一场网路对战。特斯拉败阵，夺金冠好梦成空，后补而上的冠军是众望所归的玛莉老师。

电算商店街来了一个名叫城户舟子的少女、她自称是会召唤不幸的超倒楣少女、只要她所到的地方从来没有好事发生、她的网路领航员水人一旦哭起来就会冒出电脑水、把火力发电厂的系统全部都侵蚀掉了、为了阻止水人、洛克人和数字人便进行灵体共鸣…

萝露等领航员突然受袭，证据显示乃洛克人所为，令热斗一时间摸不头脑，经一番查究，发现原来乃洛克人的共同体「黑暗洛克人」的杰作，目的是要消灭洛克人。黑暗.雅和百合子救出被困的洛克人，造就一场洛克人对黑暗洛克人的决战，结果双方旗鼓相当，打成平手。事件过后，一切回復平静，但黑暗洛克人仍在暗角冷笑，准备捲土重来….

为了彻底将黑暗机器生命体的异次元转换器研究透彻、科学省特地请到能量工学界的专家：利卡尔博士来、谁知道就在他修复了转换器之后、竟然将布鲁斯和洛克人身上的能量吸走、让它们无法对抗前来破坏的火花人…

神秘男子为了制造人类的战栗与恐惧、派遣灯炉人在网路世界作乱、弄得地热发电厂的电脑系统出问题、进而引发地层底下的熔岩产生变化、赶往现场的炎山和在当地泡汤的热斗适时出面阻止了惨剧发生…

一向以拥有发亮额头而自豪的绫小路伊朵来日本搞「光额小姐选举大会」，并邀请烟花匠六尺玉燃次为她主理烟花演，期间黑洛克人的手下暴风雪人和乌云人来袭，热斗等人马上派领航员应战，经一番激战，暴风雪人和乌云人败走，伊朵的盛事顺利进行，而对于热斗来说，最大收获乃发觉六尺玉燃次亦是迪奥徽章拥有者。

这次影像人再度回来、对热斗和洛克人进行报复、藉由超人气电影：星际游侠来散布破坏的因子、复制出无数的洛克人、让洛克人和布鲁斯疲于奔命、最后炎山终于想出利用磁性克制录影带复制人的策略、一举打败影像人…

近日时兴恋爱占卜，适值热斗又经常和茉莉花出双入对，一向心仪热斗的美露当然醋海翻波，情急下唯有求教于恋爱占卜大师安藤.朗美达，唯见朗美达竟然被行星生命体星星人害得惊惶失措，一心要盖过茉莉花的美露马上和萝露来一个「双向融合」，力战星星人，最后在热斗的支援下大获全胜。

亚妮曾经因为车祸重伤住院、复健期间都是她的看护领航员丝尔克耐心的鼓励才让她度过最难熬的复健阶段、所以她始终无法原谅医院大火将丝尔克删除的布鲁斯、拿着利卡尔博士给她的黑暗晶片强化片要陷害布鲁斯 …

新WWW一众向网路警察展开大反攻，先破坏异次元空间发电机，再选正日食时出击，令热斗无法和洛克人作「双向融合」应战，结果全电算市陷于一片混乱。这时，旧有的WWW组织看不过眼，决定和新WWW对干，弄来了已报废的异次元空间转换车，让热斗可和洛克人双向融合，一举击退敌人，力保电算市。

热斗和炎山为了搭救亚妮塔、追着那架直升机来到星云的基地、竟然碰到阴影人也到了那里、双方打起来布鲁斯和洛克人都不是对手、炎山在情非得已之下为布鲁斯插入黑暗晶片、虽然打败了阴影人、但布鲁斯也就此成了黑暗机器生命体…

攻佔刚落成不久的轨道升降机「触天塔」，并以卫星坠地来唬吓世人，其时热斗和美露正处身触天塔内，正好和新WWW来个大对决，经一番战斗，一对活宝贝终于战胜邪恶，败阵的新WWW成员全数陷法网，但这时怪事再起，原来黑暗洛克人已接收新WWW的设施，并准备向世界发动可怕攻击….

炎山自从失去了布鲁斯之后、内心旁徨无依、就在此时一个世界级的服装设计师来举办服装发表会、她所设计的可携式电脑遭到星云的利用、控制了模特儿、企图窃取航空宇宙的重要资料…还好适时遭到炎山的阻止…

丁戈、茉莉花和查理等拥有迪奥徽章的网路战士突然失踪，令热斗百思不得其解。此时，黑暗洛克人再派其旗下的黑暗机器生命体攻击地球，热斗单人匹马应战，只能节节败退，这时候查理等人以双向融合的姿态加入战围，才令热斗松一口气，但毕黑暗生命体有备而来，大战一触即发….

黑暗机器生命体开动巨大的开矿机冲向闹市，令世人陷于恐慌中，但热斗的同步晶片受损，未能出战，眼看兵凶战危之时，丁戈等人及时以「双向融合」来应战，团结就是力量，一举击溃黑暗机器生命体大军，助人类逃过一劫。黑暗机器生命体虽行动受创，但其背后的指挥者终现身，正是理格尔博士….

忍者黑暗.雅老是执于行刺热斗，但又发觉热斗运数奇佳，于是信心开始动摇。深层博士派行星生命体剑人打劫银行，连番得手后遇上追查到来的热斗，一场惨烈的网路对战随即展开。眼见热斗处于下风，危在旦夕时，黑暗.雅出手相助，让热斗有机会反败为胜。战后，两人开始建立同伴关系….

Dr. Hikari and Famous bring the CrossFusion Members together at the beach for special training, but the training session is really just a relaxing vacation in the sun to help calm their nerves. Yai and Anetta also attend, as well as the original WWW members. The gang ends up exploring a haunted house, and Maylu continues to fight Jasmine for Lan's affection.

The CrossFusion Members meet with Chaud to explore ancient ruins discovered in Netopia which bare Duo's symbol. Inside, a holographic image tells of an alien race that travels to planets via Duo's comet and destroys civilizations that are deemed dangerous. Slur becomes enraged that the heroes have discovered the past of her race and commands the destruction of the ruins. The children barely manage to escape in time.

The CrossFusion Members formulate a plan to infiltrate Neo WWW's hideout and rescue Tesla. Also, the member's Crests of Duo have mysteriously faded away, the first three victims being Chaud, Raika, and Princes Pride. Count Zap also assists Mr. Gauss in the rescue of his niece. To pass security, the members must scan their hands. But once inside, the Darkloids Cloudman and LarkMan attack. Battling up to the top, they reach Dark MegaMan, who reveals that Mr. Gauss tricked the members into the tower in exchange for Tesla. The hand scans gave Dark MegaMan the data that rested within Duo's Crests. As the members escape the tower, Tesla CrossFuses and vanishes.

Charlie is startled to discover Tesla has been sleeping in his apartment. Meanwhile, Dark MegaMan lures Ms. Yuri into a trap to steal her Crest of Duo. When she refuses to comply, Dr. Regal then appears and steals it himself. Lan, Charlie, and Tesla battle with the remaining Darkloids, deleting CosmoMan and forcing Dark MegaMan to retreat. Dr. Wily explains that Dr. Regal needs the data within the Crests of Duo to achieve access to the power within Duo's comet. Dr. Regal has planned such a thing for decades as he had already taken Baryl's Crest twenty years ago when Baryl was alive.

The Asteroids begin invading Earth, and the CrossFusion Members fight to ward them off. However, until Slur is defeated, the numbers will only grow, so while the members battle the Asteroid invasion, MegaMan, ProtoMan, SearchMan, and Colonel jack-in to take Slur down themselves. However, their efforts are futile, and Slur easily overcomes them on her own.

Thirty years ago, Duo's comet had crashed on Earth, and Dr. Regal plans to travel through space and time to absorb its power. MegaMan, ProtoMan, SearchMan, and Colonel rush through time to thwart Dark MegaMan who was sent to help Dr. Regal gain access to the comet. However, Dark MegaMan plans to absorb the power himself and become the ultimate NetNavi, but Slur refuses to allow him to do so by deleting him. Before fading away, Dark MegaMan self-destructs and prevents Dr. Regal from succeeding. The heroes return home, and the renmants of Dark MegaMan's being rejoin with MegaMan's soul, and MegaMan forgives him.

Duo begins to erase the Earth, and in order to stop him, all thirteen CrossFusion Members must join together. However, Baryl has already died. Dr. Wily of the past works with Dr. Wily of the future to send Baryl through time and space using the Spectrum program. Once Baryl arrives in Lan's time, he receives a SynchroChip and uses CrossFusion to help his allies take down another invasion of Asteroids.

Bass reappears and now infused with the power of Nebula Grey, he deletes Slur. Meanwhile, Dr. Regal gains access to Duo's power and begins his attack on Earth, but Duo kills him before beginning the erasure of Earth. The CrossFusion Members travel to Duo's comet, avoiding demise as the Earth vanishes. They confront Duo, begging him to reverse the erasure, but Duo cannot comprehend their pleas, having more interest in CrossFusion instead, a technology similar to his own race's.

泡泡人无意间捡到了一个小婴儿网路领航员,大家都不知道该怎麼处理,这时发生几起奇怪的破坏事件,原来是电脑兽造成的,虽然热斗等人前往对付，却完全无招架之力,这时抱著小婴儿的洛克人突然兽化,发挥出惊人的力量…

泡泡人捡到的婴儿网路领航员能让洛克人兽化,当光博士还在研究这件事时，兽裔兵又出现了，而且分成两派战斗著,还与前往处理的洛克人等人发生战斗,虽然好不容易打败了兽化後的兽裔兵，却还是完全不知道他们的目的…

科学省来了一名访客-苍木真琴，她自称是名人的女朋友，原来真琴正在研究让网路领航员实体化的另一种方法--复制实体，这个研究招来了兽裔兵的觊觎，利用真琴急著完成研究的心理，偷偷协助她，没想到完成的复制实体竟然被兽裔兵夺走用来破坏现实世界…。

日暮和舟子意外目击到了幽灵船，热斗等人在真边的要求下前往探查幽灵船的真相，果不其然是兽裔兵搞的鬼，原来是库雷卡派的兽裔烈焰人修复了当地的沉没战舰，为的是要摧毁鬼火岛上法尔沙兽裔兵的复制实体工厂，还打算趁机大肆破坏热斗等人待的彼方世界。

伊朵再度转入了秋原国小，让热斗等人非常开心。伊朵为了展示卡布冈公司实验中的巨大影像装置，而找了热斗他们到公司开发部门。但是，未完成的装置却突然失控，热斗让洛克人进入打算停下装置。就在洛克人等人破坏了卡布冈公司的保全系统，往装置核心前进的时候，却发生了以卡布冈公司为中心的大范围的不明大规模停电。

泡泡人出现在洛克人等人面前。众人询问他是在哪裏找到托里尔之後，泡泡人说出是在亚美罗巴军队的老旧军事设施伺服器世界裏。为了调查，炎山前往亚美罗巴，在应该无人的基地遇见一名少女。另一方面日本的伺服器世界发生了领航员大量失踪事件。热斗和洛克人查出事件元凶是兽裔兵法老人。而兽裔法老人却将抓来的领航员改造成自己的手下攻击洛克人。

兽化之後的洛克人在打倒兽裔兵之後依然没恢复原状，持续破坏网路城市。连热斗拼命的呼唤也无效，让热斗等人非常错愕。萝露和葛莱德想用麻痹攻击制止兽化洛克人的行动也失败了，兽化洛克人躲进伺服器世界的深处，就此失去踪影。神祕的少女出现在情绪低落的热斗面前，打探托里尔的消息。

神祕的少女转学到热斗的班上，很快成为男生的焦点。热斗对於少女一直打探托里尔和洛克人的关系感到困惑。另一方面，数字人在网路城市裏遇到跟自己一模一样的网路领航员。另一位数字人知道水人等人要去见洛克人，就和真正的数字人调包，打算接近洛克人。看到两位宛如双胞胎般的数字人在战斗让萝露等人很惊讶…。

冰冻人发现受伤的兽裔冷冻人误闯伺服器世界的祕密基地。兽裔冷冻人想要摆脱冰冻人，可是冰冻人因为担心所以看顾著兽裔冷冻人。这个时候，连续发生了冰系的领航员被不明人士袭击的事件。进行调查的热斗和洛克人推测应该是和兽裔兵有关。接著又收到小透的联络表示冰冻人下落不明。

祐一朗和名人接下深海调查艇上的工作，热斗和美露也跟著来到海边。但是法尔沙的兽裔闸门人想抓走托里尔早已潜伏在船上的伺服器世界。而有相同目的的库雷卡的急速人也藉由复制实体实体化，直接攻击船只。热斗赶忙用双向融合应战。不料兽裔闸门人夺下了深海调查艇的系统，要求用托里尔交换艇内的祐一朗和美露的性命。

再度兽化而失控的洛克人在深海艇的系统内追逐兽裔闸门人并且造成破坏。热斗等人束手无策。这时候为了解救兽裔闸门人，新的兽裔兵-燕子人出现了。燕子人注意到兽化洛克人旁的少女领航员很可疑。於是兽裔燕子人实体化，攻击那名领航员的使用者-艾莉丝。热斗跟艾莉丝一起躲进了船内。在混乱的情况中，无法控制的深海艇裏面有祐一郎和美露在等待救援。

托里尔由网路警察保护著，法尔沙和库雷卡两方阵营得到这项情报之後，为了争夺托里尔，不断派出兽裔兵到网路警察的伺服器世界裏。在网路警察待命的炎山，迪卡欧，丁戈，美露，再加上雷火，合力将敌人击退了。网路警察原本的目的是要抓住在搜寻托里尔的神祕少女领航员以及艾莉丝。如预期地，少女领航员进入网路警察的伺服器世界裏，却因为库雷卡和法尔沙的战斗而下落不明。

法尔沙军和库雷卡军找到托里尔所在位置之後，与兽化病毒大军一起发动攻击。洛克人等人为了守护托里尔挺身而战。照著祐一朗的作战计划成功的将双方人马封闭在伺服器世界的一角，不料库雷卡军的兽裔黑暗人却成功脱逃并且接近托里尔。在兽裔黑暗人压倒性的强力攻击之下，洛克人他们陷入了危机，幸亏有艾莉丝的领航员的帮助而化解了危机。之後艾莉丝开始说出关於彼方世界以及托里尔的事情。

热斗等人被连接彼方世界的次元裂缝吸进去了。彼方世界，那是一个现实空间与电脑空间交错的神奇世界。拯救遭到实体化病毒攻击的热斗的竟然是巴雷尔上校。热斗很高兴见到了熟人，巴雷尔却像是第一次见到热斗似的。与巴雷尔并肩战斗的卡尼尔也不同於以往认识的卡尼尔，洛克人为他的冷酷感到不解。这个时候兽裔眼镜蛇人为了抓走托里尔袭击而来。

炎山和美露与热斗等人失散，来到废墟般的彼方世界。两人遇到在荒野奔驰的货物列车，认识了列车司机-铁国男以及他的领航员-冲锋人。炎山一行人搭著国男的列车来到某城镇。那是一个铁路网络极度发达，风格回异的城镇。在那裏出现了库雷卡军的兽裔废铁人。吞噬铁轨的兽裔废铁人和兽化病毒一起想要攻陷城镇。炎山让布鲁斯实体化，打算制止兽裔废铁人…

热斗和众人失散的情况下，来到了一处小渔村。热斗与洛克人恰巧在那里救了一名受到兽化病毒袭击的少年-小次郎。村子里一名很会作菜的女性-香菜，她为了答谢热斗救了小次郎，而准备了一桌好菜请热斗吃。虽然香菜个性活泼，其实有一段痛苦的过去。香菜过去担任厨师的豪华客船受到兽裔兵的攻击而沈没，存活下来的只有香菜一个人。香菜和领航员-利爪人一直在等待向兽裔兵报仇的机会。

雷火和丁戈为了寻找热斗等人迷失在彼方世界的山中，此时出现了一位仙人风骨般的老人。相信他可以听到风声进而得知热斗的所在地的雷火等人却被他带到温泉街-亚米伊达。老人家没钱却在餐厅大吃大喝，大泡温泉，让遭到牵连的丁戈和雷火叫苦连连。这时候，在温泉街亚米伊达当老大的维纳斯和影像人这对搭档来了。雷火和丁戈派出侦察人和战斧人击退了让镇上居民困扰不已的影像人…

炎山和美露为了寻找热斗等人来到某个镇上，遇见了挖洞专家土太郎和回收业者培利斯。这时候有位像似有钱人的女性-米莉欧妮雅来访。米莉欧妮雅是因为看上能够挖掘坚硬岩盤的土太郎等人的技术，要委托他挖出藏在岩山深处的宝藏。两个人很高兴的接受了委托，但是炎山却对米莉欧妮雅的言行感到可疑而开始调查。另一方面，美露为了协助土太郎等人而跟著来到了现场。

热斗和雷火、丁戈在香菜的村子裏重逢。丁戈为了寻找咖哩的材料到山裏去，却在湖边被潜水艇外形的领航员-潜水人抢走了他抓到的猎物。丁戈追著潜水人潜入了湖裏的城堡，得知城堡主人黑须和绮萝路与兽裔兵联手，靠著控制湖水而支配附近的村子。甚至还得知艾莉丝被关在城堡裏。绮萝路追上救出艾莉丝的丁戈和战斧人，并且派出领航员-马戏人对付他们。

热斗等人遵照艾莉丝要求，离开了香菜的村子要前往异次元空间研究所。途中，PET收到来自祐一朗的通讯却马上就断了。在现实世界裏，兽裔兵发动攻击，网路警察疲於应付。而在彼方世界裏，库雷卡军的兽裔武士人为了抢走托里尔，带著大军攻击热斗等人。热斗一行人分别让各自的领航员实体化应战，却寡不敌众陷入苦战。这时候，艾莉丝受到攻击倒下了。

兽裔乌云人率领的法尔沙军队对异次元空间研究所发动总攻击。洛克人，萝露，战斧人立即实体化应战。炎山和雷火启动研究所的防卫系统想阻止法鲁札军队的前进。但是却被法鲁札闯入，破坏了研究所。为了和法尔沙交战，洛克人兽化了。

热斗等人前往威利研究所，却遭到法尔沙军的兽裔剪刀人攻击。洛克人等人准备应战，这时候杀手人和他的使用者-达克.基刹奇出现，删除了兽裔剪刀人。根据基刹奇的说法，前方有法尔沙军建构的要塞，如果不摧毁那裏就无法前进。基刹奇为了完成任务要单独前往，热斗自愿助他一臂之力。这时候兽裔剪刀人的弟弟们为了向基刹奇和杀手人报仇，开始实行作战计划。

被兽化因子入侵的卡尼尔现在成了库雷卡的战士，立下不少战功。热斗等人为了到威利研究所，途经已成废墟的都市时遇到兽裔卡尼尔。兽裔卡尼尔为了夺取同步化抗体不断的向托里尔逼近。洛克人等人只好应战。甚至库雷卡也现身阻挡在洛克人等人面前。这时候，祐一朗为了对抗向现实世界进攻的库雷卡，法尔沙两阵营的兽裔兵，召集了双向融合人员。

在库雷卡与法尔沙鷸蚌相争之中，威利的手下黑须和绮萝路捉走了托里尔。洛克人等人的实体化也到了极限，热斗等人山穷水尽。热斗和炎山，雷火，不顾危险进行双向融合应战，却在双方阵营的猛攻之下倒下了。然後现实世界开始出现次元裂缝。彼方世界的威利博士利用托里尔开始进行某项计划。

库雷卡和法尔沙的对决分出高下的那一刻，威利发动了同步化抗体的力量。结果诞生的是库雷卡和法尔沙合体之後的-超电脑兽。超电脑兽以压倒性力量开始破坏彼方世界。热斗等人束手无策。另一方面，在现实世界裏，查理一行人聚集在持续扩大的次元裂缝前。祐一朗和热斗通讯了解状况之後，想到了消灭兽化因子的方法，但是这方法还是需要托里尔的力量。不过托里尔的身体却开始资料分解了。