En 1715 sur l'île de la Providence. Le pouvoir appartient aux pirates qui organisent la contrebande dans les Caraïbes. Le capitaine Flint, terriblement craint de tous, s'associe à la belle Eleanor Guthrie afin de contrer la flotte britannique qui rêve de remettre la main sur l'île. Mais les opposants à Flint sont nombreux, à commencer par sa nouvelle recrue, l'ambitieux John Silver

Le capitaine Flint est persuadé qu'un voleur se dissimule au sein de son équipage. Il décide de le démasquer. Rackham prend une initiative qui déplaît au capitaine Vane. Pendant ce temps, John Silver et Max doivent se cacher dans un bordel. De son côté, Eleanor fait face à un terrible dilemme.

Toujours à la recherche de l'Urca de Lima, Flint et Gates comprennent qu'ils vont avoir grand besoin de renfort. Pendant ce temps, Billy et John Silver sont confrontés à un problème moral. De son côté, Eleanor Guthrie ne peut dissimuler son admiration pour le capitaine Vane. Gates obtient une promotion.

Le capitaine Flint et ses membres d'équipage continuent de pourchasser le galion espagnol Urca de Lima. Les plans d'Eleanor s'effondrent brutalement, et tout change pour la jeune femme. Parallèlement, Anne Bonny et Rackham sont hantés par les péchés qu'ils ont commis au cours de leur existence.

Le capitaine Flint, grand pirate des Caraïbes, met au point un plan pour contrer les attaques de la flotte britannique.

Après bien des péripéties, parfois mortelles, le capitaine Flint se découvre un nouvel allié, totalement inattendu. Pendant ce temps, l'équipage de Vane attend des jours meilleurs. De son côté, John Silver s'apprête à faire le plus terrible des sacrifices...

Depuis son évasion spectaculaire, Flint écume les mers sur son navire. Profondément marqué par la mort de la femme qu'il aimait, il noie son chagrin dans le meurtre. Il multiplie les attaques dans les ports et devance son équipage, au plus près du danger. Silver tente de le raisonner, sans succès. De son côté, Eleanor, prisonnière, accepte de collaborer avec un envoyé du pouvoir. Elle l'accompagne vers Nassau. Sur l'île, Anne Bony s'inquiète car les travaux de restauration du fort n'avancent pas. Elle place Jack Rackham face à ses responsabilités. Elle ne sait pas que le pirate a un plan : il a envoyé Charles Vane capturer la précieuse cargaison d'un navire...

Une flotte royale fait route vers Nassau, avec à son bord Eleanor. La jeune femme tente de faire comprendre à Rogers qu'elle est indispensable à la réussite de son opération. De son côté, le capitaine Flint affronte une terrible tempête pour échapper au capitaine Hornigold. Il souffre d'hallucinations, qui lui montrent Miranda sous la forme d'un spectre. John Silver, qui souffre depuis son amputation, aide comme il le peut les pirates à colmater les brèches dans la coque du navire. A Nassau, l'ancien capitaine de Charles Vane refait surface et renverse les alliances...

Flint et son équipage sont toujours à flot après la terrible tempête qu'ils ont dû traverser. Ils sont maintenant dans une zone sans vent et dérivent à petite vitesse. La nourriture, et surtout l'eau potable, commencent à manquer. Un rationnement strict est mis en place. Silver tente de faire comprendre à Flint qu'ils feraient mieux d'enterrer la hache de guerre pour le bien de tous. À Nassau, Max et Anne prennent une décision importante qui concerne l'avenir de leur relation. Quand elles apprennent qu'une flotte s'apprête à envahir l'île, elles en avertissent Rackham et Teach. Porteur d'un message du nouveau gouverneur, le capitaine Hornigold pourrait bien renverser les alliances à Nassau…

Le capitaine Flint et ses hommes ont pu rejoindre une île. Sur place, ils trouvent de l'eau douce en abondance, mais comprennent vite qu'ils ne sont pas seuls. Des esclaves en fuite vivent là en communauté. Ils n'ont aucune envie que leur lieu de vie soit découvert. Les pirates sont faits prisonniers et interrogés. Silver tente de semer la zizanie chez ses geôliers. A Nassau, la récompense pour la capture de Charles Vane en intéresse plus d'un. Rackham tente l'impossible pour lui permettre de fuir. S'il rejoint l'équipage de Teach, il a une chance d'éviter la pendaison...

Toujours prisonniers des esclaves en fuite, sur l'île qui leur sert de refuge, les hommes de Flint tentent de négocier leur libération. Flint en personne mène les débats. Lorsque monsieur Scott arrive blessé, les équilibres sont rompus. A Nassau, le nouveau gouverneur britannique prend ses quartiers. Eleanor essaie d'influencer Max pour qu'elle se soumette à l'autorité anglaise, mais la jeune femme a plus d'ambition pour son avenir. De son côté, Jack Rackham envisage de signer la grâce offerte par Sa Majesté aux pirates, afin de profiter tranquillement de son butin. Anne Bonny veut l'en dissuader. En mer, Charles Vane et Barbe Noire attaquent un vaisseau espagnol...

Une guerre sanglante qui se joue aussi bien sur terre qu’en mer, où Anne et Jack Rackham sont dans une situation périlleuse et ont pu s’en sortir grâce à l’intervention de Barbe-Noire.

Tandis que Flint et ses compagnons font face aux Anglais, à Nassau, les choses ne sont pas moins intéressantes. La mort de Charles Vane a bien semé les graines de la révolution, avec un peuple qui se montre de plus en plus méfiant. Billy Bones en profite pour faire naître la peur au sein des proches du gouverneur. Terreur à qui il finira par donner un nom et un visage, où, pendant son discours, nous assistons à une réunion entre les personnes au sommet de l’alliance pirate : Flint, Barbe-Noire, Rackham, Madi, et celui qui sera destiné à devenir le roi de Nassau et à entrer dans l’histoire : Long John Silver…

Les combats qui ont ravagé Nassau et les rivages de New Providence redéfinissent les alliances. Les luttes de pouvoir n'ont jamais été aussi sanglantes et les rudes batailles qui ont opposé les pirates aux troupes royalistes ont laissé la ville exsangue. Dans la confusion, John Silver s'enhardit, augmente son emprise sur les pirates et se rapproche encore plus de Madi. Il annonce fièrement ses intentions : il est venu pour libérer le Nouveau Monde. Pendant que la capitaine Flint prend lui aussi ses responsabilités, Barbe Noire reste dans l'ombre, attendant son heure pour abattre ses cartes...

Flint cède sous l'autorité de Billy. Eleanor a un plan pour Rogers. L'argent se transforme en une source peu probable d'aide. Max est mis en garde.

Max n'a pas respecté la loi. Il va devoir affronter son action. Tandis que Rogers se penche sur son passé, Flint et Madi arrivent à un compromis et à une entente réciproque. Et Long John Silver est de retour...

La survie de Flint est entre les mains de Silver. Billy suscite des tensions. Eleonor, de son côté, est capable de tout pour parvenir à ses fins. Rogers, quant à lui, semble s'en sortir...

L'Espagne envahit Nassau sans trop de difficultés. Silver tente d'arranger les relations entre les pirates et les anciens esclaves. Flint et Eleanor s'allient pour survivre à l'invasion espagnole...

Le capitaine Flint prépare son dernier assaut contre la forteresse de Nassau, réputée imprenable. Pendant ce temps, la légende de Long John Silver grandit et s'étend...

Flint lance un dernier assaut désespéré pour tenter de lever l'emprise anglaise sur Nassau. Silver est contraint de prendre une décision irréversible. Tandis que Rackham affonte Rogers, la situation, à Nassau, est changée à jamais...