第 3 季包含《佐助夺还篇》和《原创篇》

《佐助夺还篇》（日语：サスケ奪還編）火影忍者第五篇章，在2004年11月3日－2005年5月18日期间播出，改编自原作漫画的第172－238章。主要讲述佐助因接连失败而陷入比以往更强烈的复仇怒火，已不近人情的他主动接受大蛇丸派来的音忍四人众邀约，以投奔敌人的方式寻求力量。他的逃跑迫使鸣人与同期三名下忍，在当上中忍的鹿丸带领下进行这项危险的艰巨任务，从敌人手中将佐助救回木叶。

《原创篇》（日语：オリジナル編）自2005年5月25日开始到2007年2月8日期间，《火影忍者》播出共84集的动画原创篇章，故事设定于佐助夺还行动过后以及动画疾风传之间，主要讲述鸣人一行伙伴各自的任务故事，期间一小部分内容则改编自原作漫画的第236－238章。

Pátá řada (2004–2005), Šestá řada (2005)

Naruto returns from his training journey eager to see his friend Sasuke. But Sasuke has only one thing on his mind: his quest for revenge against his older brother. His unquenchable thirst for power knows no bounds, and soon he is lured from the Leaf Village by Orochimaru's minions, the Sound Four. Determined to get him back, Shikamaru and Naruto put together a team of the top genin in the village to go after him, and the chase begins!

Naruto revient de son voyage d'entraînement, impatient de voir son ami Sasuke. Mais Sasuke n'a qu'une seule chose en tête : sa quête de vengeance contre son frère aîné. Sa soif inextinguible de pouvoir ne connaît aucune limite, et il est bientôt attiré hors du Village de la Feuille par les sbires d'Orochimaru, les Quatre du Son. Déterminés à le récupérer, Shikamaru et Naruto forment une équipe composée des meilleurs genins du village pour le retrouver, et la chasse commence !

נארוטו חוזר ממסע האימונים שלו להוט לראות את חברו סאסקה. אבל לסאסקה יש רק דבר אחד בראש: נקמה באחיו הגדול. צימאונו לכוח אינו יודע גבול ועד מהרה הוא נלקח ע"י החניכים של אורוצ'ימארו, רביעיית הצליל. נחושים להחזיר אותו, שיקאמארו ונארוטו מרכיבים צוות והמרדף מתחיל!

Final do Exame Chunnin e inicio da destruição de Konoha.

Саскэ, осознающий, насколько велика разница в способностях между ним и братом, которого стремится убить, отправляется к Оротимару, чтобы стать его учеником и познать новую силу. В погоню за ним отправляется команда из Конохи.

Naruto thuyết phục Jiraiya huấn luyện mình cho trận đấu cuối của kỳ thi, và Nhóm 7 đã được thực chiến khi Orochimaru tấn công vào làng Lá.