In het bubbelbad in zijn achtertuin worden de stoffelijke resten van een marine-luitenant gevonden.

Een SEAL krijgt per pakketpost een bom thuisgestuurd. Vance vervolgt zijn fysiotherapie voor de verwondingen die hij opliep toen hij gegijzeld werd.

De overvaller van een waardetransport weet via de wielkast van een militair transportvliegtuig aan zijn achtervolgers te ontkomen.

Een tijdens de Vietnamoorlog verstuurd en vervolgens zoekgeraakt poststuk blijkt een zelfmoordbericht van een officier te bevatten. Een ondergeschikte heeft destijds echter verklaard hem vermoord te hebben en zit sindsdien gevangen.

In het toilet van een chauffeurscafé worden de dode lichamen van een kwartiermeester en een oude kennis van Nick gevonden.

Bij het beroven van een bank van de marine wordt alleen een stuk van de buitenmuur gestolen.

Bij opruimwerkzaamheden in een natuurgebied wordt een dode man in het water gevonden. Hij blijkt bij leven onderzoek te hebben gedaan naar in Afghanistan gesneuvelde soldaten. Het tijdstip van zijn overlijden komt ruwweg overeen met dat van zijn contactpersoon op locatie.

Het team schaduwt een vrouw die vrijkomt na een gevangenisstraf van drie jaar voor het inbreken in het huis van een admiraal, in de hoop erachter te komen wie haar medeplichtige was en de buit te localiseren.

Een veteraan wordt dood gevonden in het steegje achter de daklozenopvang waar hij als vrijwilliger werkte. Als het team een verdachte thuis opzoekt, trekt deze een vuurwapen en begint te schieten – en wordt daarop zelf doodgeschoten. In zijn woning treft het team een zuigeling aan.

In een ruimte waar 20 lichamen liggen te wachten tot ze gebruikt worden tijdens een medisch congres, ligt een extra lijk – van iemand die met chloorgas om het leven is gebracht. Als het team het bevel van de minister van Defensie om het onderzoek te beperken naast zich neerlegt, dreigt deze met juridische stappen en ontslag.

Een marine-luitenant in beschermde hechtenis wordt vermoord en een oude familievriend pleit samen met Gibbs voor een roadtrip om een vermiste armband voor militaire ID's te zoeken.

In een opslagruimte wordt een jong meisje gevonden dat vertelt ontsnapt te zijn uit een kelder waar ze zo lang ze zich kan herinneren samen met haar moeder opgesloten heeft gezeten. DNA-onderzoek wijst uit dat haar moeder een marinier is die tien jaar eerder spoorloos verdween.

Een gevonden dode en een inbraak in Tims woning leiden naar de computerlessen die Tim op de middelbare school volgde.

Tijdens het Neptunusritueel wordt het lichaam van een kwartiermeester in zee gevonden. Het ziet eruit alsof hij overboord is gevallen en verdronken, maar daar hij zelf reddingszwemmer was, is dat niet erg waarschijnlijk.

In een natuurgebied wordt het dode lichaam van een kwartiermeester gevonden. Het lijkt er in eerste instantie op dat hij is gedood door een beer, maar schijn bedriegt.

Een getraind duiker verdrinkt tijdens een oefening. De onderzeeër waarop hij diende, verdwijnt plotseling onder water – met Gibbs en Bishop aan boord. Ducky maakt zich klaar om met pensioen te gaan.

Nadat Torres wakker wordt op een vervallen vissersboot bedekt met bloed, helpt het team hem de laatste 12 uur te reconstrueren.

Het team zoekt naar een actieve schutter na een lockdown in een zeekliniek.

Het team onderzoekt de moord op een marinier van wie geloofd wordt dat hij is omgekomen bij de aanslagen van 9/11 op het Pentagon nadat menselijke resten op een bouwplaats zijn ontdekt.

Kasie lost een 30 jaar oude moordzaak op, maar een maas in het rechtssysteem zorgt ervoor dat de verdachte vrijkomt. McGee bezoekt een elite technologiebedrijf dat hem een ​​goedbetaalde positie aanbiedt.

Nadat NCIS een geheime bankrekening van de overheid heeft gevonden die een landelijk netwerk van burgerwachten beloont, moet het team bepalen wie als rechter en jury optreedt.

Een neergeschoten marinesergeant die enkele jaren eerder betrokken was bij de gevangenname van een terroristenleider wordt van een viaduct gegooid. Gibbs worstelt met een geheim uit zijn verleden.

Voormalig FBI-agent Tobias Fornell smeekt Gibbs om de drugsdealers in de buurt aan te pakken. Dit nadat zijn dochter in het ziekenhuis is opgenomen na een overdosis drugs.