Sam, Clover et Alex, envoyées enquêter par Jerry sur une curieuse fréquence qui semble manipuler les esprits et émane d'un lieu proche du campus universitaire, finissent par découvrir que c'est Telly Hardwire, le créateur du réseau social, qui est à l'origine de tout. Cherchant à se venger de Mandy qui a autrefois refusé d'être sa "cyber-amie" à l'époque du lycée.

D'étranges événements se déroulant un peu partout dans le monde poussent Jerry à envoyer les filles sur place. Elles découvrent alors que quelqu'un (ou quelque chose) transforme petit à petit la planète en ce qui ressemble à un paradis pour chats ! Alex se retrouve affectée par le sérum d'ADN félin expérimental conçu par Féline, et se transforme progressivement en chat.

Lorsque des développeurs de jeux vidéos se mettent à disparaître un peu partout dans le monde, nos espionnes sont sur le coup. Mais leur enquête semble être au point mort lorsqu'elles découvrent qu'un "abominable homme des neiges" pixélisé serait à l'origine des enlèvements.

Pour Sam, Alex et Clover, pas question de rater leur émission de danse préférée. Mais juste au moment où l'émission va démarrer, Jerry les informe que trois des plus grands danseurs au monde sont portés disparus ! Les filles mènent l'enquête et mettent la main sur un indice curieux qui semble indiquer que le méchant n'a qu'une jambe !

Lorsque quelqu'un s'introduit par effraction dans le Laboratoire Expérimental du WOOHP, Sam, Alex et Clover enquêtent et découvrent qu'un sérum rajeunissant ultra secret a disparu ! Sur le sol du labo, les filles ramassent un drôle d'indice : un diadème serti de diamants, avec un cheveu roux resté accroché dessus.

Une série d'agressions et d'enlèvements mène nos espionnes à travers le monde. Après une "explication" avec un robot tyrannique et complètement siphonné, les filles découvrent que les personnes kidnappées sont retenues dans un ancien parc d'attractions désaffecté au Japon. Une fois sur place, elles sont capturées par le robot.

Une cérémonie de mariage bat son plein lorsque la robe de la mariée connaît de "graves dysfonctionnements", et se met à semer la panique partout sur son passage. Jerry met les filles sur le coup, et ces dernières ne tardent pas à découvrir qu'il ne s'agit pas d'un cas isolé. Il semblerait que quelqu'un s'amuse à piéger les robes des mariées afin de leur gâcher leur "grand jour" !

Lorsque Jerry envoie les filles enquêter sur une série de holdups commis dans diverses banques du monde, elles découvrent quelque chose d'étrange : dans les banques concernées, personne n'a tenté de s'interposer pour arrêter les malfaiteurs !

D'étranges événements se déroulant à Beverly Hills poussent Jerry à y envoyer Sam, Clover et Alex. Une fois sur place, nos espionnes constatent que deux hommes qui semblent tout droit sortis d'un autre monde se livrent bataille dans les rues, cherchant l'un comme l'autre à mettre la main sur un objet légendaire, le "Cœur de Grentoïd".

Lorsque le WOOHP est informé que plusieurs célèbres chiens de concours ont disparu dans divers endroits du monde, Jerry envoie les filles mener l'enquête. Ces dernières débarquent alors dans un appartement situé dans un immeuble new-yorkais afin de surveiller un chiot lauréat prénommé Mr. Billingsworth, mais s'aperçoivent qu'il est trop tard : le chiot a déjà été enlevé !

Toujours en quête de fortune et de célébrité, Mandy décide de lancer une ligne de figurines à son effigie, les Poupées Mandy ! Bien que les filles soient surprises du succès que remportent immédiatement les poupées, elles sont encore plus choquées de constater que des méchants insaisissables semblent décidés à se débarrasser d'elles !

Dans différents endroits du monde, on retrouve des personnes emprisonnées dans des blocs de glace ce qui pousse Jerry à envoyer les filles enquêter. Tandis que ces dernières suivent la piste du coupable, elles découvrent que la personne derrière ces agressions est une jeune fille qui aspirait autrefois à devenir patineuse.

Lorsque de célèbres designers d'intérieur disparaissent un peu partout dans le monde, Jerry met les filles sur l'enquête. Ce faisant, nos héroïnes découvrent que les endroits où travaillaient les designers avant de disparaître sont à présent truffés de déco ultra-kitsch.

Lorsque Jerry prévient les filles qu'elles vont embarquer à bord du WOOHPtanic, elles sont ravies. Mais les choses tournent mal lorsque leur navire est soudain attaqué par Salty Schooner, un pirate mal intentionné qui compte s'approprier le bateau ! Si Sam et Alex parviennent à s'échapper, Clover n'a pas cette chance et se retrouve captive, mais aussi objet de l'affection de Salty.

Alors que les filles sont occupées à appréhender un "scorpion" méchant et ridicule, Trent les surprend sans le vouloir et assiste à la scène. En tentant d'effacer sa mémoire, Jerry administre accidentellement à Trent l'ADN du scorpion. Soudain, Trent devient le mec le plus cool de Mali U, et se transforme aussi en homme scorpion !

Jerry apprend que plusieurs merveilles du monde subissent des phénomènes étranges : par exemple, le Grand Canyon et le Mont Everest se retrouvent "bétonnés". Les filles doivent s'en charger, et ne tardent pas à découvrir qu'un homme équipé d'un drôle d'engin high-tech est à l'origine de tout.

Lors d'une visite de routine à la Prison du WOOHP, Jerry fait une expérience pour le moins inattendue : le Dr Gray utilise un gadget de sa fabrication pour échanger son corps avec celui de Jerry, et par là-même s'échapper de la Prison du WOOHP !

Dans plusieurs pays, on retrouve des gens arborant un maquillage de clown délirant qui se comportent comme des professionnels du cirque. Jerry envoie les filles sur place, et Sam, Clover et Alex ne tardent pas à s'apercevoir que ces personnes ont toutes quelque chose en commun : elles ont utilisé la même marque de maquillage.

Partout dans le monde, les marées semblent se dérégler, et Jerry demande par conséquent aux filles de mener l'enquête. Elles découvrent que le responsable du phénomène est un rayon provenant de l'espace, dirigé vers la Terre à des fins maléfiques.

Lorsque Jerry convoque les filles, ces dernières pensent qu'elles vont de nouveau devoir s'occuper d'un quelconque criminel loufoque. Mais elles ne tardent pas à découvrir que cette fois, la nature de leur mission est toute autre. Jerry veut qu'elles utilisent le dirigeable du WOOHP pour convoyer trois méchants vers WHOOP Island.

Une nature luxuriante mais agressive se met à envahir divers endroits de la planète, ce qui pousse Jerry à rappeler les filles parties en vacances afin qu'elles aillent voir ce qu'il en est. Ce faisant, nos espionnes doivent affronter des plantes qui semblent avoir "jeté leur dévolu" sur elles.

Lorsqu'un présentateur d'émission pour enfants est enlevé en pleine émission, les filles sont envoyées sur le terrain. Lorsqu'elles retrouvent la personnalité en question, elles se rendent compte que quelqu'un veut l'obliger à exécuter une terrifiante cascade et à braver la mort devant toute une foule de spectateurs mais contre son gré.

Le jour où Jerry informe Sam, Clover et Alex qu'elles ne travailleront désormais plus en équipe mais en solo, les filles sont sous le choc et se retrouvent sans tarder chacune sur une mission différente, chargées de retrouver des agents secrets qui ont disparu ! Il ne leur faut pas longtemps pour découvrir que les agents ont été kidnappés, ce qui leur arrive à leur tour !

Lorsque Sam, Clover et Alex apprennent qu'elles, ainsi que toute la classe de stylisme du Professeur Plunkett, ont gagné un voyage à Versailles et sont invitées à un défilé de mode présentant les habits de Marie Antoinette, elles sont surexcitées. Mais Jerry revient sur sa promesse et leur demande de mener l'enquête sur une infraction commise au Palais du Luxembourg tout proche.

Nous revoici à Versailles où Sam, Clover et Alex, bien que saines et sauves, ont compris que quelque chose clochait. Non seulement elles ont été attaquées par un être mystérieux qui laisse de drôles d'empreintes de pas, mais elles découvrent aussi que plusieurs étudiants de leur classe ont disparu !