애나는 '콘코르디아'라는 이름의 새로운 도시 계획을 발표하여..인간들에게 또 다시 장밋빛 미래를 열어 주겠다고 약속한다. 그리고 이 계획을 공식적으로 발표하는 큰 행사를 열기로 결정한다. 애나는 전남편인 조를 만나 V들의 음모와 그들이 타일러에게 한 짓을 설명하고 타일러를 설득하기 위해 다시 돌아와 달라고 부탁한다. 일라이 콘은 애나가 여는 행사의 경호를 에리카가 담당하게 되자 애나를 죽일 수 있는 절호의 기회라고 설득한다. 결국 에리카와 나머지 팀원들은 일라이 콘과 손을 잡고 한 번뿐인 기회를 놓치지 않기 위해 철저한 계획을 세우는데...

제5군단에 대한 복수심에 가득찬 애나는 라이언을 불러 딸의 모습을..보여 주며 일라이 콘을 죽이라고 협박한다. 하지만 라이언은 오히려 일라이 콘에게 붙잡히는 신세가 되고 제5군단은 배신의 대가로 그를 죽이기로 결정한다. 한편 V의 제보로 일라이 콘의 위치를 알게 된 FBI가 현장에 출동하자 일라이와 함께 있던 에리카는 인질로 잡힌 척한다. TV를 통해 에리카가 잡혀 있는 모습이 생중계되고 잭과 에리카의 전남편 조도 현장으로 달려오자 애나는 모두를 한꺼번에 죽이기 위해 음모를 꾸미는데...

타일러는 마음에 큰 상처를 입고 에리카와 연락을 끊은 채 V의 비행선으로.. 올라가 파일럿이 되기로 결심한다. 애나는 타일러의 몸 상태가 자신의 계획에 잘 들어맞지 않을 경우를 대비해 리사에게 다른 남자를 만나 관계를 맺으라고 강요하고 이미 타일러를 사랑하게 된 리사는 심한 마음의 갈등을 겪는다. 에리카는 일라이의 뒤를 이어 제5군단의 지도자가 되고 전 세계에 흩어져 있던 다른 제5군단들과 접촉을 시도한다. 그리고 애나가 지구에 온 목적을 알기 위해 오래전 타일러를 임신했을 때 자신을 담당했던 의사를 찾아 홍콩으로 갔다가 그곳에서 놀라운 사실을 알게 된다.

애나의 의도를 알게 된 에리카는 공격을 준비한다. 근처 연구소에서.. 독감 바이러스를 빼낸 뒤 DAN의 생식 기능을 파괴하는 역할을 하도록 조작하여 비행선에 올라가게 될 인간들에게 주입함으로써 애나가 수집하고 있던 모든 DNA를 망치는 것이 그녀의 계획. 한편 일라이 콘의 죽음으로 제5군단에 대한 경계를 늦추고 있던 애나는 자신들이 번식에 이용하려고 계획하고 있던 남자아이들이 얼굴에서 피를 쏟으며 이유 없이 죽어 가자 다른 대책을 강구하기 시작한다.

애나는 최초의 블루 에너지 반응기를 가동하기로 결정한다. 블루 에너지를 연구하던 시드는 그 반응기가 창출하는 어마어마한 전력량을 계산한 뒤 이것이 침략을 위한 도구라는 사실을 알아챈다. 에리카와 제5군단은 이 반응기를 공격해 건설 자체를 막으려는 계획을 세우지만 리사로부터 이 소식을 전해 들은 다이애나는 이 계획을 반드시 막아야 한다고 말한다. 한편 애나는 인간의 감정을 통제하려는 계획이 쉽지 않자 V에게만 내리던 축복을 인간에게도 시도한다. 그러나 처음으로 인간에게 축복을 주던 애나는 갑자기 눈에서 피를 흘리며 힘겨워하는데...

애나 이전의 여왕인 다이애나가 지구인과 손을 잡고 애나의 딸인 리사와 함께 애나를 암살할 계획을 실행으로 옮기면서 지구인의 승리가 눈 앞에 보였으나, 애나는 지구인을 철저하게 패배시킨다. 그리고 반란을 꾀하던 자신의 어머니인 다이애나 여왕을 모든 외계인 앞에서 죽이고 딸인 리사를 감옥에 넣어 진압하게 된다. 이 모든 것은 철저하게 계획을 한 애나의 완벽한 승리였다.