Cuando a Piper se le estropea el coche es atacada por una criatura que arranca los corazones a sus victimas, y se entera que ella es la única superviviente. Andy y una agente del FBI. intentan dar caza a la bestia. Prue contrata a Phoebe como su ayudante en la casa de subastas, pero al tocar una pulsera tiene una premonición del pasado en la que ve como un coche se precipita por un barranco, lo que hace que vaya a buscar a una niña pequeña que resultó ilesa en el accidente.

Tuatha, una bruja asesina de brujas buenas, es liberada por accidente de la cueva en la que ha estado encerrada doscientos años. Leo le explica a las Halliwell que el único que la puede vencer es El Elegido, un chico llamado Kyle, que es el único capaz de usar la varita de Tuatha en su contra. Mientras, Piper tiene que decidir entre Leo y Dan.

Prue y Phoebe llegan al rescate de Darryl justo antes de que un mortal (a su vez protegido por un ser sobrenatural conocido como Guardian) intentara asesinarlo. A pesar de que planean derrotar al Guardian, las chicas deben mentirle a Cole Turner, un asistente del fiscal de distrito, para mantener el secreto familiar, lo cual deja libre al asesino mortal. Mientras, Piper preocupa a sus hermanas porque ha estado alejada con Leo en la tierra de los Guías Blancos por un mes, sin dar señales y dejando a Prue y Phoebe intranquilas.

Piper y Phoebe se enteran de que Paige aún se culpa por la muerte de sus padres y no puede superarlo. Leo sugiere que Paige utilice las habilidades del Fantasma del Pasado para viajar en el tiempo para ayudarla a descubrir la causa por la cual murieron sus padres realmente. En el pasado, Paige intenta usar la oportunidad para cambiar los hechos y salvar a sus padres del accidente automovilístico mortal. Mientras, dos fantasmas poseen a Phoebe y Cole para completar cierta tarea que luego Piper y Darryl descubren: contraer matrimonio.

Desde que La Fuente fue derrotada, el empleo de Phoebe como columnista le ha dado un alto grado de notoriedad en la ciudad, Piper y Leo se preparan para el nuevo bebé y Paige se ha lanzado a la cacería de demonios. Las chicas pronto se encuentran teniendo que ayudar a Mylie, una sirena que intenta encontrar amor verdadero poniendo como garantía su propia inmortalidad en manos de la Bruja de Mar, quien se quedará con ella si Mylie no consigue que su novio mortal le declare su amor. Por ota parte, la Bruja de Mar le ha prometido a Necron, un demonio esqueleto, la inmortalidad de Mylie a cambio de que éste perdone su vida. Mientras tanto, Phoebe intenta obtener un rápido divorcio, pero Cole resurge del Páramo y desea probar que ya no es malvado para poder volver junto a Phoebe. Piper comienza a sufrir ataques de pánico cuando el peligro crece y quiere que el novio de Mylie simplemente confiese su amor en lugar de pelear con la Bruja de Mar. Como ese plan falla, Paige crea un hechizo para descubrir el escondite de la Bruja, que termina convirtiendo a Phoebe en una sirena. Phoebe, eligiendo permanecer como sirena luego de vencer a la Bruja de Mar, se convierte en presa de Necron cuando éste descubre que la Bruja de Mar ya no podrá conseguirle la inmortalidad de Mylie. Paige y Leo buscan desesperadamente a Phoebe, sin saber que ella está en peligro, mientras Piper continúa luchando con sus ataques de pánico. Piper decide invocar un hechizo antitemores, para sobreponerse a sus episodios de pánico, pero poco después es capturada por Necron. Mientras tanto, Paige rechaza la oferta de Cole para ayudarla en su empleo pero luego piensa que él podría ser el único capaz de regresar a Phoebe a su forma humana y solicita su ayuda para salvar a Phoebe de una vida en el mar.

Luego de que el plan de Paige para derrotar a Cole por sí misma falla, Cole decide unirse a los Avatars con el propósito de viajar hacia el pasado y evitar que Paige se conozca con sus hermanas, con la esperanza de recuperar a Phoebe. Mientras Cole descubre que su relación con Phoebe en el pasado modificado ha fallado, la gripe de Paige le permite a ésta orbitar hacia la realidad alternativa en donde intenta deshacer el hechizo de Cole para poder regresar todo a la normalidad.

Cuando los problemas maritales causan que los poderes de Piper se vuelvan fuera de control, Phoebe arregla una cita con un consejero marital para ayudar. Durante la sesión, Piper realiza un hechizo de la memoria para acelerar el proceso, pero éste causa que Phoebe y Paige viajen en el tiempo para ser testigos de los recuerdos de Piper y Leo. Un hechicero también cae prisionero de los recuerdos mientras intenta asesinar a una bruja inocente que busca la ayuda de las hermanas.

A pesar de que Leo se ha ido, Piper se encuentra sorprendentemente de buen humor, lo que lleva a Paige a sospechar que Leo podría haber alterado los recuerdos de su esposa. Sin embargo, el hechizo de Paige para recuperar los recuerdos de Piper, causan accidentalmente amnesia total. Al llamar a Leo para que las ayude, Phoebe y Paige descubren que éste se encuentra cautivo en la Isla de Valhalla, un lugar mítico gobernado por guerreras. Intentando cubrir su implicación en la desaparición de Leo, Chris, el nuevo Guía Blanco de las chicas, las ayuda a disfrazarse como Valquirias y orbitar hacia la isla. Al ver a Leo, el dolor de Piper comienza a fluir nuevamente, incitándola a permanecer en la isla mientras los demás escapan. Las Valquirias siguen a Paige y Phoebe a través de las dimensiones hasta San Francisco y causan estragos en la ciudad. Mientras, Phoebe descubre que tiene un nuevo poder y Paige toma un trabajo como paseadora de perros y se asombra cuando uno de sus perros se convierte nuevamente en hombre.

A pesar de que Leo se ha ido, Piper se encuentra sorprendentemente de buen humor, lo que lleva a Paige a sospechar que Leo podría haber alterado los recuerdos de su esposa. Sin embargo, el hechizo de Paige para recuperar los recuerdos de Piper, causan accidentalmente amnesia total. Al llamar a Leo para que las ayude, Phoebe y Paige descubren que éste se encuentra cautivo en la Isla de Valhalla, un lugar mítico gobernado por guerreras. Intentando cubrir su implicación en la desaparición de Leo, Chris, el nuevo Guía Blanco de las chicas, las ayuda a disfrazarse como Valquirias y orbitar hacia la isla. Al ver a Leo, el dolor de Piper comienza a fluir nuevamente, incitándola a permanecer en la isla mientras los demás escapan. Las Valquirias siguen a Paige y Phoebe a través de las dimensiones hasta San Francisco y causan estragos en la ciudad. Mientras, Phoebe descubre que tiene un nuevo poder y Paige toma un trabajo como paseadora de perros y se asombra cuando uno de sus perros se convierte nuevamente en hombre.

Después de vencer al demonio Manticore, las embrujadas adoptarán al hijo de éste después de haber quedado huérfano. Chris les aconseja que se deshagan del bebé por lo peligroso que puede ser en el futuro.

Con el propósito de enviar a Chris al futuro, Gideon crea una entrada que lleva a Chris y Leo a un mundo donde el mal prevalece. Phoebe y Paige viajan al universo paralelo para rescatarlos.

Phoebe y Paige hacen que Piper y Barbas asistan a una boda hindú, donde reciben inesperadamente los poderes de sus dos famosos amantes: Shakti, la diosa de la creación, y Shiva, el dios de la destrucción. Para salvar al universo del caos, Phoebe debe evitar que Piper y Leo consumen su amor. Mientras tanto, Leo se obsesiona con derrotar a Barbas y desenmascararla.

Con el Libro de las Sombras en su poder, Zankou planea abrir el Nexo Espiritual y tomar el poder de La Sombra. Para alejar la atención de Zankou del Nexo, Piper, Phoebe y Paige consiguen que vaya tras ellas. Usando un hechizo del Libro de las Sombras, Zankou roba el poder de premonición de Phoebe, lo que le permite anticipar y estropear sus ataques.

Supuestamente muertas, las hermanas Halliwell comienzan su existencia libre de demonios con nuevas identidades creadas a través de un hechizo que alteró su apariencia para el mundo externo pero no para aquellos más cercanos a ellas. Phoebe, emocionada por comenzar una nueva vida, se sorprende al ver a Dex Lawson, un guapo artista que apenas conocía, en su funeral y se sorprende aún más cuando tiene una premonición en la que ve que se casará con él. Ahora, capaz de tener una vida familiar normal, Piper se obsesiona con la idea de que los demonios descubrirán que las hermanas siguen con vida. Al asistir a su funeral disfrazada de la supermodelo Janice Dickinson, Paige se da cuenta de que ha pasado demasiado tiempo en el mundo mágico, pronto comprende que no puede escapar a sus instintos como luz blanca y responde ante la llamada de un nuevo cargo - una joven bruja llamada Billie.

La nueva teoría de Billie acerca de que el secuestro de su hermana fue una conspiración demoníaca la lleva a contactar con las víctimas de varios secuestros mágicos, incluido Dalvos, socio de una poderosa compañía que resulta ser, sin que Billie lo sepa, un demonio haciéndose pasar por humano. Con el estrés de intentar encontrar a su hermana mientras sus padres están de visita, Billie descubre su poder de proyección cuando involuntariamente transforma a sus padres en asesinos a sangre fría, quienes son contratados por Dalvos para asesinar al CEO de la companía. Mientras tanto, Piper trata de hacerse a la idea de que Leo se ha ido; Phoebe es víctima de falta de inspiración; Paige finalmente conecta con Henry; y Billie descubre que sus padres nunca finalizaron la búsqueda de su hermana.

Piper y Leo viajarán al futuro para determinar el presente. Allí, se encontrarán con ellos mismos a los 70 años, quienes les darán las instrucciones necesarias para fijarlo todo. Los viejos Leo y Piper les dan pistas para arreglar las cosas, pero no pueden ayudarles directamente (para evitar la alteración en el tiempo), pero mayoritariamente les ilustran con la vida feliz que está reservada para ellos si todo va bien...El capitulo final de Embrujadas abarca 80 años de la vida de las chicas, desde la decada de 1970 hasta el 2050, aproximadamente, con numerosas paradas entre medias.