传说中的魔王降临了创界山，夺走了彩虹的光芒，世界陷入一片黑暗中，神龙带着传说中的勇士（龙神丸）来到了人间寻找传说中的救世主，随后神龙消失在小镇上的龙神湖中……除了精神和体力之外毫无优点的小学生战部渡又一次迟到了，虽然心里在害怕小渡还是从龙神湖上前往学校，在发生了诡异的事件后他还是迟到了。在手工课上小渡根据自己内心的印象做出了奇特的三头身机器人而大受欢迎，看着自己的杰作小渡脑海中浮现出神龙的影像决定将他命名为“龙神丸”。就在小渡洋洋得意的时候，龙神湖发出了光芒神龙将小渡带到了创界山。村子的村民称小渡为救世主希望他能够拯救创界山，穿上代代相传的战士装备的小渡还来不及高兴，从创界山出现了坏蛋和魔神毫不留情向小渡发起了攻击，但是只凭肉身的小渡完全不是对手。危急时刻小渡听到了龙神丸的声音，随着小渡的呼唤粘土变成巨大的魔神出现在他面前，乘上龙神丸的小渡与坏蛋展开了激烈的战斗，在登龙剑的斩击中敌人的魔神化为了飞灰。小渡在大家的祝福下和龙神丸一起乘上彩虹向创界山进发……

穿越彩虹后出现在龙神丸和小渡眼前的是广阔的第一山界，龙神丸将小渡带过瀑布之后离开了他。独自展开旅行的小渡在路上与长得像河马的武士剑部武一郎相遇，两人虽然有所争执但还是决定结伴而行，他们的目标是传说中双龙岩的宝珠。一度失败的舒华辛力加在古路治的命令下向小渡发起袭击，一筹莫展之际小渡和武一郎被奇怪的忍者火美子所救。双龙岩的宝珠如果不能同时拿到的话就会被龙咬住，无从下手的舒华辛力加决定使用武力夺取宝珠，在夕阳下小渡从影子总看出同时取得宝珠的关键。拿到手的宝珠合二为一成为为强力的道具“怪奇球”，小渡更是一举打伤了魔神战斗猩猩2号，凭借龙神丸的力量将战斗猩猩再次打败。看着夕阳下的创界山，小渡暗暗发誓一定要拯救这个世界。

得知救世主出现的多恶达决定派遣部下古拉玛成为小渡的同伴刺探他们的消息，更是下达命令给各山界的BOSS誓要将小渡一行人扼杀在萌芽之中。武一郎使出小把戏让小渡认为他拥有神乎其神的剑术，大开眼界的小渡决定拜他为师而一路纠缠。来到高低镇的小渡发现这里只要大喊就会令地形产生变化，就在小渡等人因为地形变化而陷进地里的时候遇上了自称是万事通的古拉玛，虽然大家都不喜欢他死要钱的性格但为了找到古路治却需要他的帮助，这时自大的布鲁杉达为打败小渡一行人来到了他们面前。直升战机轻松打败了没有飞行能力的战神丸，龙神丸与敌人战斗时却被突然出现的空神丸打断，但古拉玛救下布鲁杉达之后就离开了，直升战机最终在小渡和武一郎两师徒的协力下被击破。战斗结束后古拉玛出现在小渡面前要免费带他们到古路治的城堡，小渡一行人的队伍更加热闹了……

小渡因为漫长的旅行而变得饥肠辘辘，武一郎试图用修行不足提点他却也被小渡抓住破绽教训了。古拉玛以寻找食物为名把小渡的行踪告诉了古路治，无聊的等待让大家只能靠钓鱼打发时间，在无聊的等待中大家与被魔兵追杀的少女纱由莉相遇了。纱由莉所在的加拉加拉村被性格古怪的达古加所统治，在高压统治的同时他强迫大家不断吃胖借以嘲笑大家，为了帮助村民小渡等人也参加了晚会，所有的食物在胃口近乎无限的火美子面前被统统吃光，眼看计划失败的达古加恼羞成怒地向大家开火。双发唤出了魔神展开战斗，空神丸的介入让战神丸命悬一线，这时达古加因为蟑螂的出现而胡乱开火，小渡看准时机用登龙剑将其击败。战斗结束后小渡从村民口中得知“神部之笛”就在天空之城中，他们的下个目的地就在那里！

小渡的连战连胜让古路治受到了责难，就在他大为火光时古拉玛带来了小渡等人的消息。在古拉玛的诱导下小渡等人解开奇怪的谜题来到了天空之城，想要用陷阱消灭小渡的古拉玛反倒自食恶果吃尽了苦头，就连自以为万无一失的唤兽笛也在火美子的忍术下失败。一路闯过要塞内部的机关小渡等人最终来到了要塞的核心部分，但古路治却利用要塞的机关不断变更地形让大家陷入了苦战，瞄准敌人大意的机会龙神丸抓住了敌人的魔神与他一起飞向天空，古路治再次犯了得意的错误撞到天顶导致喷射器失灵最终被打败。打败了敌人的龙神丸却也因为没有飞行能力而往下掉，这时突然出现了一部青色的魔神救下了龙神丸和大家。战斗结束后小渡吹响了神部之笛，在清脆的笛声中第一层山界恢复了原貌，无色的彩虹也恢复了原有的色泽。小渡等人向第二层山界进发……

进入第二层山界的小渡一行人很快掉进了水里，随后他们发现他们正在一个颠倒的城市中，连生物的生态也与常识中的完全不一样，从村民口中得知这个相反镇是因为多恶达的部下反转博士的关系一切都变得相反了，大家连基本的生活日常都无法保障……死神和古拉玛为了寻找能够让第二层山界恢复原状的“真实之镜”而拜访了反转博士，就在这时小渡一行人也为了解决大家的麻烦来到了研究所，陷入困境的小渡打算放弃一切时感受到龙神丸对自己的鼓励而振作起来，活用自己特点的小渡战胜了战斗机器人。误打误撞闯进控制室的武一郎和火美子意外地听到了真实之镜的消息，研究所最终被火美子无意间破坏了，龙神丸在力量上完全输给了弗兰肯但凭借新必杀技“龙牙拳”停止了敌人的动作，看着天上的彩虹小渡向龙神丸发誓自己绝对不会再放弃了。

小渡给大家讲了“浦岛太郎”的故事，就在火美子兴致冲冲要去龙宫的时候却出现了乌龟欺负小孩子的现况，救下少年后大家跟着少年来村子里却发现人正在做动物该做的事情，而人们为了平息狼人的愤怒不得不向他供奉圆形的物体。谢德里蒙听到海龟们的对话袭击了村子，不愿伤害动物的小渡等人被抓进牢里，在牢里思考的小渡察觉到谢德里蒙在看到圆形后会变得心灵平静。在库拉玛的帮助下小渡等人来到狼人的巢穴，但是却因为不是圆月之夜而与动作敏捷的狼人展开了激烈的战斗。玄月让狼人变得狂暴，火美子使用忍术将月亮变成满月令狼人的斗志大减，更使用碧纱笼炎龙拳打伤了它，但库拉玛却利用馒头分散火美子的注意力令忍术失效，小渡利用对方的弯刀能够组成圆形的特点最终打败了狼人，人类和动物之间恢复了原本的状态。

小渡一行人艰难地攀爬着，他们的目标是在山顶上的都市，这个都市这时却因为吸血鬼的统治而成为犯罪者的天堂，清晨来到这里的小渡等人却发现大家都在睡大觉，从唯一的正常人小樱口中得知了事情真相的大家顿时毛骨悚然，但小渡确认为可以利用吸血鬼的弱点轻松打败他。冬奇拉拉利用小樱要求与小渡对战，但到了晚上小渡等人却要面对被吸血鬼所控制的普通人，而自以为有用的十字架和大蒜却对他完全不起作用，但小渡等人的搞怪却惹怒了冬奇拉拉，而心生畏惧的小渡令龙神丸的力量也减少了，登龙剑也无法斩开吸血十字鬼。受到龙神丸的提醒小渡发现吸血十字鬼的弱点，利用光线打败了他。事件结束后村民们感觉到自己会过上正常的生活，却在阳光照射到他们身上时睡着了，看着因为异变而变得昼夜颠倒的村民，小渡发誓自己一定要尽快找到真实之镜。

经过反复的失败实验，反转博士终于将真实之镜的探测器完成。武一郎在旅行途中不断强化对小渡的训练，但让武一郎不满的是小渡终究没有开启自己的心眼，这时一个爱恶作剧的老太婆让大家吃下了辣椒丸子，在需找水的过程中大家赫然发现水都浮在空中。接连失败让死神变得焦急起来，跟着探测器古拉玛也来到了村子中，大家估计爱恶作剧的蜜婆婆在湖底找到的镜子应该就是大家一直在寻找的真实之镜。再次与龙神丸交手的弗兰肯2号说起了方言，但龙神丸却展现出更为娴熟的语言技巧，恼羞成怒的博士发起了攻击。弗兰肯2号发出无法预测轨迹的攻击，束手无策的小渡在龙神丸的提醒下体悟了心眼的真髓，攻击轨迹被看穿的弗兰肯2号倒在登龙剑的光芒下。就在大家为得打真实之镜而高兴的时候死神从天而降将真实之镜砸碎，让第二层山界恢复原貌的希望已经破灭了吗？

希望的破灭让大家都非常失落，但被龙神丸鼓励的小渡却并没有放弃希望，从镜子碎片所照出的影像中小渡发现被打碎的其实是照出相反事实的镜子，真正的真实之镜其实是村子附近的镜湖的化身，另一方面被上司责骂的死神和古拉玛也知道真实之镜并没有被破坏。随着对湖底的挖掘大家发现了一个能够影响镜面物体的奇怪机器，虽然不明原理但是却能够映照出与事实相反的影像，小渡与视图抢夺机器的死神交战却无法伤他分毫，眼看局势不妙的死神操纵魔神夺取了机器逃跑，龙神丸却因为不能飞行无法追击。青色的神秘机体再次出现将骷髅鸟打碎，落到地面的骷髅鸟完全不是龙神丸的对手。随着机器机能的解除，湖水回到了地面，随着世界的倒影在湖水中清晰映现，第二层山界恢复了原貌，原来镜湖就是真实之镜。小渡一行人继续踏上了旅途。

出现在大家面前的第三层山界放眼望去是一片耸立着火把的炽热沙漠，随后他们在沙漠中见到了强迫村民们在炎热中做运动的魔兵们，救下村民的武一郎对村民百合一见钟情，在与敌人的干部剑作单挑过后武一郎最终因为体力不支倒下了。剑作向武一郎发来了挑战书，但武一郎的体力却无法支撑这场艰苦的决斗，小渡自动请战，被小渡的意志感动的武一郎对他进行了严酷的训练。决战前夕古拉玛偷走了勇者之剑，心里没底的小渡惴惴不安地赶往战场，但凭借过人的努力小渡战胜了剑作。不甘失败的剑作唤出魔神打算杀死小渡，在火美子的帮助下小渡拿回了勇者之剑，面对拥有强力探测器的魔神，小渡凭借心眼和新必杀技“龙雷拳”取得了胜利。战斗结束后武一郎打算向百合告白，结果自然是好无悬念地在开始之前就失败了......

因为炎热的影响小渡和武一郎都变得疲惫不堪，火美子倒是完全不受影响依然精神。小渡等人来到一个铺满铁板的城镇，火美子误打误撞成为了城市的统治者玛莉亚妮的朋友，不过这个看似亲切的美人其实是因“消毒”知名随便加热地面让大家深受困扰的麻烦人物。古拉玛希望玛莉亚妮直接烧死小渡等人，但她却只顾着和火美子一起嬉戏全无斗志。小渡等人利用高跷走进了城堡，满身灰尘的两人终于激怒了玛莉亚妮，小渡的口不择言更是火上浇油，随之而来的是猛烈的火焰。没有心机的玛莉亚妮打坏了自己的城堡，越发愤怒的她甚至打飞了龙神丸的炎龙拳，小渡最后凭借技高一筹的本事获得了胜利。事件结束后小渡等人在玛莉亚妮的奶奶的解说下了解到极寒之剑和炽热之盾的故事。

持续饱受炎热折磨的小渡一行人快来到了海边，但是展现在他们眼前的是熊熊燃烧的火海，前往附近的村子想要讨水喝的大家却看到正在强行推销会辣死人饮料的马之介，火美子喝下饮料安然无恙让马之介大感意外，知道一行人就是小渡等人的马之介抓走了火美子。长老知道小渡的身份后告诉他前往炎岛的方法，但是武一郎却无法打开关键的盖子。小渡在擂台上被单方面打得几乎趴下，小渡最终凭借马之介对数学苦手的弱点反败为胜，而打开瓶盖的关键“开瓶器”豁然也在马之介驾驶的熔岩金刚手上。不断使出卑鄙手段的马之介将小渡打翻在地，有了龙神丸的力量小渡终于在摔跤上赢了马之介，熔岩金刚的力量再强也败在龙神丸的剑下。打开瓶盖后汹涌的海水喷向天空，小渡一行人乘着水浪向炎岛进发

小渡一行人在穿着鞋子也难以前进的热岛上艰难前进着，库拉玛设下的陷阱再次把自己也牵扯了进去，依靠机智和道具小渡闯过了一个又一个难关，打败了组成小队的魔神小渡得到了一颗发出光芒的宝珠，随着神部之笛的乐声响起被多恶达封印的百人仙人被释放了。百人仙人告诉小渡。加莲岛的勇者阿萨姆像上的极寒之剑和炽热之盾正是维持第三层山界冷热平衡的关键，但在极寒之剑不知所踪的现在小渡只能前往第二城寨打败索也索也。在武一郎的逼问下大家从古拉玛口中得知极寒之剑在第四层的山界消息。活用新必杀技“飞龙拳”小渡与索也索也战斗得不分上下，但是没有极寒之剑的话是无法拯救第三层山界的，百人仙人使出自己全部的力量让小渡获得炽热之剑并将他和龙神丸送往第四层山界，掉落到第四层山界的小渡在暴风雪中昏迷了……

古拉玛因为泄露了机密而惶恐不安，没能完成任务的索也索也恼怒地抓走了惶恐的古拉玛、火美子和武一郎，不能忍受连续失败的多恶达派遣心腹摩羯三兄弟来到第三层山界，面对死亡的威胁古拉玛再一次妥协了，但看着来救自己的武一郎和火美子库拉玛又犹豫了。差点被冻僵的小渡只能看着用尽力量的龙神丸只能无能为力，昏迷前龙神丸告诉小渡必须要找到传世中的火龙，再次独自上路的小渡在路上救下被魔神追击的少女小雪，她所在的城市被冰龙冰冻，为了拯救大家她需要找到传说中的火龙与消毒结伴而行。传说中的火龙因为多恶达的诅咒变成了受人控制的冰龙，与它交战的小渡凭借火龙之鳞将它唤醒，苏醒的火龙发出温柔的光芒将冰冻的城市恢复原貌更唤醒了陷入沉睡的龙神丸，在火龙的帮助下小渡和小雪为了寻找极寒之剑向野野谷进发。

野野谷是被人们所恐惧的诅咒森林，前往那里的小渡在路上遭到猛犸象的攻击，以为走投无路的决定战斗的小渡结识了第四层山界的守护者千人仙人，猛犸西莫斯对小渡的亲近让仙人确定了他就是救世主的身份，千人仙人开始述说关于第三四层山界关键的传说。在遥远的古代，神和人类一起居住在创界山的时代，掌管季节的神亚撒姆和胡娜拉因为相恋而导致时间诶失去了季节的变化，被爱的女神强行分离的两人化为了石像分别放到第三和第四层山界，想要取得极寒之剑只有在两人千年一次的相会时才有可能拿到。东杰何狄想利用雪崩解决小渡一行人却被西莫斯破坏了计划，小渡含恨打败想要杀死西莫斯的东杰何狄，在西莫斯的帮助下向极光的所在进发。受到魔界残兄弟要挟的古拉玛出卖了武一郎和火美子，看着向他求助的两人古拉玛惭愧地逃走了。

在暴风雪中艰难前行的小渡和小雪很快因为多多高斯摩的影响分离了，小渡更是受到幻境的影响差一点掉进万丈深渊，最后在龙神丸的提醒下才幸免于难，不甘心失败的多多高斯摩派出大量部队前去抹杀小渡，小渡却凭借机智化险为夷更一举让追兵全部掉落到冰层下。穿过层层阻碍的小渡和小雪沿着极光来到了胡娜拉的石像面前，然而仔细研究过龙神丸的多多高斯摩却驾驶着魔神阻挡在小渡面前，无法行动的龙神丸在西莫斯的帮助下战胜了敌人。再次成为阶下囚的武一郎不断抱怨库拉玛的背叛，但火美子却相信他并不是坏人。但是无论使出怎样的攻击都无法打破冻结胡娜拉的冰块，在真实之镜的帮助下看到亚撒姆的胡娜拉解开了自己身上的冰封，就在小渡要取得极寒之剑的时候，空中出现魔界残兄弟的影像，他们威胁小渡如果拔出极寒之剑就要烧死武一郎和火美子……

武一郎虽然尽力表现出一幅大义凛然的样子，但是在死亡面前他还是退缩了，古拉玛思考再三还是不愿放弃将自己视为同伴的武一郎和火美子，他最终背叛了多恶达驾驶空神丸将两人带走（之后又马上后悔了），眼看计划失败的魔界残兄弟决定亲手收拾小渡。被小雪感动的胡娜拉流下了泪水将极寒之剑交给了小渡，小渡和龙神丸通过胡娜拉打开的空间通道回到了第三层山界救下了差点被索也索也杀死的同伴，在极寒之剑的帮助下龙神丸使出了极寒登龙剑打败了索也索也，但大家依然要面对古拉玛是叛徒这个事实。武一郎砍下古拉玛的头发表示原谅了他。小渡用极寒之剑的力量来到亚撒姆的石像面前，虽然返还了极寒之剑第三层山界却没有恢复原状，在古拉玛的提醒下小渡把胡娜拉的眼泪放入炽热之盾中，亚撒姆的石像发出冲破天际的光芒，在亚撒姆和胡娜拉互相拥抱的幻象中第四层山界恢复了原状。

为了给残兄弟留下好印象，多多高斯摩派出擅长易容的短枪郎扮成小雪接近小渡偷取炽热之剑，在“小雪”的带领下小渡一行人陷入了种种危急中，“小雪”刻意将大家引向危机的举动让古拉玛心生怀疑，但是大家都不愿去怀疑小雪。气愤的古拉玛离开了大家，在路上与真正的小雪偶遇的古拉玛和她一起回到小渡身边与“小雪”对峙。但小渡也无法识别谁才是真正的小雪，最后使用小雪曾经受伤涂过火美子的药来识别出真正的小雪，眼看计划失败的短枪郎唤出了魔神。短枪郎和多多高斯摩挟持了小雪作为人质，为了就小雪龙神丸掉下了深渊中，在空神丸的帮助下龙神丸拥有了飞行能力一举打败了短枪郎，眼看情况不妙的多多高斯摩逃走了。武一郎惭愧得向古拉玛道歉，大家乘着西莫斯向胡娜拉的神殿进发。

已经走投无路的多多高斯摩设下了最后的陷阱，小渡一行人遭到大量魔神的攻击，这时武一郎显露出他强悍的一面——用断线的电话唤来了战神丸，使用凌厉的连续攻击将魔神军团一一击破，更是使出了必杀技打败了多多高斯摩，大家兴高采烈地继续前进。魔戒残兄弟出现在胡娜拉的神像前向小渡等人发起猛烈的攻击，实力悬殊的众人在西莫斯的帮助下才击退了它们，但魔界残兄弟无间的联协战斗技巧却令大家陷入了苦战，最后更是合体为巨大的合体魔神，合体达拥有压倒性的力量连登龙剑都被折断了。龙神丸释放自己的全部力量使出了必杀技“火炎登龙剑”打败了合体达，但它也因此力竭倒下，试图阻止小渡的魔界残兄弟在亚撒姆和胡娜拉的帮助下被驱逐了，随着炽热之剑放回胡娜拉的手中，第四层山界也恢复了原貌，但龙神丸却将自己的生命燃烧殆尽。失去力量的龙神丸向小渡告别变成了龙の玉，大家流下了痛苦的泪水，胡娜拉告诉小渡只要在第五层山界取得复活圣水的话就能再次唤醒龙神丸，小渡带着被注入冰与火力量的王者之剑和龙蛋向第五层山界进发了。

魔界残兄弟为杀死了龙神丸而洋洋得意，但魔界四天王的领导者东哥罗却警告他们别太得意了，这时多恶达的孩子虎王受不了无聊的皇宫生活，驾驶爱机邪虎丸来到了下界。通往第五层山界的彩虹在半空断了，坠落的小渡等人来到了向日葵村被这里的空气呛到不行。向日葵村是被西杜罗纳支配的城市，原本是充满自然生态的美丽山村现在却因为高度的工业化而变成污烟污水横流的泥潭，村民米诺因为收藏了一只虫蛹而险遭处刑，赶到的小渡在千钧一发之际将他救下，但也难免地要面对工厂内被大量生产的魔神们。魔神部队在战神丸和空神丸的协同作战下被悉数击破，但却不是布鲁奇的对手，没有了魔神的小渡却没有放弃战斗，布鲁奇最后撞上燃料罐而自取灭亡。诞生的蝴蝶让大家重拾找到西里露之森的希望，大家觉得跟着蝴蝶一起出发。

小渡一行人跟着蝴蝶来到了西里露之森，大家却因为老虎而和火美子走散，跟老虎玩捉迷藏的火美子遇上了私自外出的虎王，第一次遇上那么有趣的女孩让虎王决定让她成为自己的新娘，虎王因为小渡碰了火美子而和他大打出手，最后虎王担心被抓回去而先跑了。与森林的守护者交谈的众人得知绽放的西里露之花才能诞生复活之水，但是没有阳光的话花蕾是不会绽放的，主动请缨的古拉玛驾驶空神丸穿越乌云打开了一道贯通太阳的通道，但是却遭到西杜罗纳的攻击，为了让龙神丸复活空神丸不惜用自己的身体挡下敌人的攻击。在复活圣水的力量下龙神丸复活了但空神丸却被破坏了，新生的龙神丸和小渡的情感唤起了新的力量，本已死亡的空神丸与龙神丸合体变味了拥有究极力量的强大魔神“龙王丸”，拥有强大力量的龙王丸使出必杀技“凰龙剑”将将敌人击败。身受重伤的库拉玛在复活圣水的力量下获得新生连诅咒也解除了，天空似乎也在为库拉玛的重生而感到高兴，但库拉玛为了解除自己村子的同伴的诅咒决定与大家分道扬镳，但是大家的心确是联结在一起的……

摩沙村的老爷爷和老婆婆难得清闲地喝茶吃团子，看着已经恢复过半的创界山彩虹他们想起了前去讨伐多恶达的火美子的父亲。小渡等人依然困难地在糟糕的空气中前行在，这天他们来到了被严重污染的伊达罗村，整天非常精神的火美子因为怪花的毒而不断发高烧。只有长在河流上游的万人草能够救下火美子，为了能在强酸的河中前行大家用不思议树的树心做成小舟向河中岛进发，虽然遭到偷袭小渡一行人却反反倒找到了万人草，但是却遭到古沙也的袭击，万人草遭到飞弹的攻击。利用不思议树做成的小舟离开河底的龙神丸变身成龙王丸，在拥有飞行能力的龙王丸面前杰兹号被击破了。战斗将万人草全部损坏，就在大家为火美子的病情着急时从幻神丸的驾驶舱中走下一只猴子解除了火美子的毒，原来他就是火美子的父亲幻龙斋。

大家根据幻龙斋的情报来到了跑跑村，这时大家看到一个看似暴走族的魔神正在追逐村民，更是不分缘由开始竞速比赛，村民告诉小渡这都是因为巴特密斯的关系大家都经常没来由要进行比赛，拜此所赐大家都无法进行耕作。活泼的火美子很快和村中的小孩成为朋友，看到这一幕的虎王醋劲大发驾驶邪虎丸来到了跑跑村大吵大闹起来，不过巴特密斯却坚持要以竞速来一份胜负。这场奇怪的比赛开始了，大家使尽了浑身解数比赛最后变成了3人赛跑，不甘落后的巴特密斯唤出了魔神。虎王拿出自己的身份证命令巴特密斯务必要阻止小渡获胜，卑鄙的巴特密斯在凰龙剑的攻击下败北了。小渡和虎王竭尽全力朝终点冲刺，但是最后获胜的却是四处乱跑的火美子，两人虽然互相看对方不顺眼，但是友情的种子却在悄悄萌芽……

在旅行中小渡等人遇上了不断投下垃圾的工厂，在碎石平原过夜的小渡等人醒来后却发现他们被一群小人包围住了，亮出自己是救世主身份的小渡才知道原来这里就是哥罗加地之乡，而知道神圣木所在的格罗米已经被空中工厂的主人抓走了。幻龙斋使用宝物缩小锤把大家变小决定乘纸飞机前往空中工厂，但是在救出格罗米的时候却因为火美子贪吃而被新郎子发现了，大家趁着新郎子发狂的时候逃走，但是小渡却要面临身体缩小无法操纵龙神丸的问题。小渡最终乘上了缩小了的龙神丸与敌人战斗，实力的悬殊让小渡不得不绞尽脑汁与敌人周旋，掉落地面的龙神丸恢复原形变成龙王丸一举击破了因为狂乱而无法行动的合体魔神。在格罗米的预知能力帮助下，大家知道他们下一个目的地就是Dragon City。

小渡一行人来到一个满是管道的城市，支配这个城市的污烟古鲁每天不断向城市喷发垃圾，向他发出挑战的小渡一行人反倒被大量垃圾掩埋堆在垃圾山底下，借助火美子的忍术逃过一劫的大家从村民的口中得知，原来这里就是Dragon City。神圣木的秘密就在Dragon City垃圾山下的神秘石碑上，这时一直监视小渡一行人的虎王为了带走火美子再次向小渡发起挑战，但是找到石碑后大家却发现上面的文字无法解读，虎王自告奋勇回家去取字典，拉不下老脸的幻龙斋则胡扯说“乌鸦才能看见绿龙”。污烟古鲁发现小渡等人的举动后率领魔神发动了袭击，吹开漫天的尘沙龙王丸变成凤凰在天空翱翔时小渡发现了城市的秘密，击败污烟古鲁让Dragon City恢复原貌的小渡一行人乘上幻神丸看清城市的全貌，朝着龙口所指的南方前进。

顺着绿龙的指引大家来到了污烟工厂，原来为了阻止小渡等人种下许愿之种邪恶古鲁早已将整个圣地用坚硬的合金覆盖，救下被强迫做劳工的村民，火美子和武一郎分头去找可种下种子的泥土，小渡被金波斯抓在了手中命悬一线，龙神丸利用猜拳救下了小渡。一直观察火美子的虎王也跑来凑热闹，但是专心找泥土的火美子压根就不理会他，眼看回家的时间已经到了虎王给了火美子一堆零食就离开了。小渡使出浑身解数打败了金波斯，但是却找不到土地而变得非常失落。大家顺着搬运零食碎屑的蚂蚁，在污烟古鲁的高尔夫球场中找到了仅存的地面，随着许愿之种的投下，参天的树木贯穿了制造污染的工厂，因为污染严重而变成灰色的土地和天空重新焕发生机，将第五层山界恢复原状的小渡一行人继续前往下一层山界。

第五层山界的回复让多恶达大为光火，他的怒火让创界山各处都发生了异变，魔界四天王在他面前颤颤巍巍地发誓一定会解决小渡一行人，来到第六层山界的小渡等人发现这里因为多恶达的诅咒变成了魔法的世界，而支配这层老巫婆早已在残兄弟的指示下开始行动了。来到一个男性受到诅咒而沉睡的村子了解到大家遇上的问题后，大家决定参加王子举办的舞会。来到城堡的小渡等人因为是男性的关系而无法参加舞会，这时老巫婆跑来用魔法给他们换上了女装，带走了大家的武器，并强调魔法在00:00的时候会被解除。王子对女装的武一郎一见钟情，小渡在火美子的帮助下取回了宝剑，龙王丸与巨象号的战斗最后连同城堡也一起破坏了。村子的诅咒被解除了，但是大家对解救第六层山界还是毫无头绪，在老巫婆的建议下大家决定向狮子瀑布进发。

小渡等人来到了狮子瀑布，更让人奇怪的是连木筏也准备好了，就在大家乘着木筏顺流而下的时候遇上了为了火美子而出现的虎王，两路人马为了争夺火美子而闹得不可开交，这时他们看到木筏不知为何来到了瀑布前，原本想离开的虎王被火美子的钩爪拖下了水。瀑布的狮子石像发出光芒将大家变成了动物，原来这一切都是老巫婆的阴谋。悄悄离开的虎王被东哥罗斥责教训，而小渡和武一郎却因为变成了动物而无法唤出魔神，大家在火美子的忍术下侥幸逃走，不甘被隶役的小渡和变成动物的村民打算一起去讨伐斯斯加巴布。火美子将幻龙斋当成炮弹打中了斯斯加巴布，最后唤出幻神丸把魔神带到狮子瀑布将斯斯加巴布变成了动物，他说出的解除咒文将大家都变回了人类，一直把村民变成动物戏耍的坏蛋最终受到了惩罚，小渡一行人也朝着下游的目的地的进发。

顺流而下的小渡一行人看到了长着脸的森林，原来这的村民因为居住在魔神墓场的圣杰马卓而变成了无法行动的树木，大家来到阴森恐怖的魔神墓场，本想让小渡大吃一惊的圣杰马卓反倒因为火美子的忍术笑到差点动弹不得，恼羞成怒的圣杰马卓决定使出自己的底牌。曾经被小渡打败的魔神怨灵被圣杰马卓一一唤醒，实体的武器无法对幽灵造成伤害小渡唤来了龙神丸，召唤出魔神的圣杰马卓利用魔神的魔力增幅机能让原本已经死去的魔神们合而为一，合体魔神拥有极为恐怖的力量，幻神丸和战神丸在瞬间就被打倒在地。小渡在龙王丸的提醒下冲进合体魔神内部与巨象2号交战，分离成2台魔神在凤凰的攻击下被打败。还未享受胜利的喜悦小渡等人却被老巫婆变成了树，被封印在阿里婆婆的突然出现解开了魔法高数大家只要夺走老巫婆身上的千光腕轮就能让第六层山界恢复原状。

小渡等人来到一个全是小孩子的城镇里，冲村民的口中大家得知小镇的人们因为支比多利的魔法都变成了小孩子，在迷宫里前进的小渡等人见到了糖果屋，大家和虎王一起吵架一边吃着糖果全然忘了村民的警告，等大家注意到的时候发现自己已经变成了小孩子。无力反抗的小渡等人被关进儿童游乐场，大家的头脑随着时间的逝去逐渐退化成小孩的程度，老巫婆开心地向残兄弟邀功的时候却被告知小孩之中有一个正是魔界王子虎王，了；老巫婆想用酸梅解除魔法反倒在争执中让小渡恢复原状，大家趁机恢复了原状。不愿交出千光腕轮的老巫婆唤出了魔神，龙神丸在战神丸的帮助下变身成龙王丸将敌人的魔神打败，和魔神一起被炸飞的虎王也和邪虎丸离开了。村民们在酸梅的帮助下恢复原状，大家在村民的提醒下决定前往风之森林。

前往第七层山界的彩虹受到多恶达的魔法攻击开始消失，被雷劈中的小渡一行人掉落到第七层山界和第六层山界之间的魔幻城，他们遇上了看守这里的魔婆婆婆，她告诉大家只有穿过魔幻地狱的重重考验才能离开，武一郎等人成为人质让小渡不得不硬着头皮出发了。进魔道门的小渡睁开双眼后发现自己正身处在熟悉的教室中，而他似乎忘记了什么重要的东西……一切都是那么熟悉，轻松愉快的日常生活、温柔的父母，连自己一直暗恋的由美也和自己的关系迅速升温，虽然内心感到奇怪，但是小渡却沉浸在这舒适的气氛中。挣脱束缚的火美子来到了小渡所在的幻境里，小渡却完全不认得她，看到活蹦乱跳的小渡回想起了一切，虽然对一切都恋恋不舍但这并不是真实，眼前的一切都化成了泥土和飞灰，和龙王丸一起打败魔道门的守护者拾起钥匙的小渡向魔风门进发。

武一郎和幻龙斋因为干枯的等待而变得焦躁，这时火美子从魔道门中跑出来告诉他们小渡现在的进度，随后又风风火火跑回小渡身边，两人一阵喧闹后火美子吹散了魔风门前的浓雾，但是小渡和火美子却被一道看不见的空气墙所阻挡，这道门的守护者是马鹿。马鹿的要求是小渡和火美子要通过三道难题才能放行，第一个难题“在蜡烛面前唱歌”难倒了小渡，不过火美子唱出一首“a.chi-a.chi （アドベンチャー）”轻松过关；第二道难题“给摇摆中的针穿线”马鹿虽然在一旁捣乱，小渡却凭借难题的漏洞顺利通关。第三道难题是用绳子“捕获风”，这明显是难为人的难题却被小渡以肥皂水吹出的泡泡通关了，眼看失败的马鹿开始逃跑并喊来了魔神。打败魔神的小渡和火美子拔下马鹿的尾巴取得了钥匙，也解救了被石化的人。继续前进的小渡并不知道危险正在等着他们……

小渡被突然出现的魔婆吓了一跳，受不了刺激的小渡冲向魔天门最后却在魔天门内的石林中掉到了一个魔天门的最底层，引路人迪布鲁告诉小渡想要离开这里的话只能设法爬到天上的出口，而在水池附近毫无生气的人们都是曾经想要打败多恶达却被困在这里的人。小渡和火美子没有放弃希望，而这时平地突然升起一座高山直通天际，在半路吃过丸子稍作休息的小渡却掉到了起点，再接再厉的小渡遇上了落石、闪点，费尽心思爬到山顶的小渡在天梯上再一次放弃了，醒来之后小渡发现自己掉到了更深的谷底……接连的失败让小渡变得沮丧，小渡理解到这个世界只要自己的内心放弃的话就会掉到谷底，相反只要心中决不放弃的话就会有希望出现在眼前，强烈的意志让小渡回到了魔天门，打败守门的魔神小渡取得了第三把钥匙，小渡也获得了决不放弃的意志……

魔幻地狱的最后一道门魔界门内部是一条有着无法计数的鸟居的走廊，走过鸟居的小渡察觉到自己受到了恶魔的低声呢喃，在穿过鸟居之后小渡已经不是曾经的自己了，明王兄弟的低声细语让小渡觉醒了邪恶之心，和明王兄弟臭气相投的小渡在村子里大肆破坏。甚至看到魔时计的时候反倒在一旁吃零食，不耐烦的小渡加快了魔时计的走向，迟钝的火美子终于觉察到小渡不正常的地方，回想起自己小时候做坏事时被婆婆教训的事情，火美子掐醒了小渡，为了救下武一郎和幻龙斋小渡用剑阻挡了剑的走向。无法阻止魔时计继续行走的小渡向魔婆发起攻击，打败明王兄弟之后集齐4把钥匙的小渡根据门上的提示打开了魔界门，魔幻城之匙发出的光芒将魔幻城恢复了原状，而魔婆也现出了她原本的模样——神部七龙神之一的紫龙。紫龙恳请小渡去解救创界山的主人圣龙妃和她的孩子翔龙子，另外更嘱咐小渡一定要找到龙王剑，只有这把剑才能将多恶达真正打败，同时他要从第七层山界的底部找到白龙取得龙神之盾，拥有它才能避免受到多恶达的魔法影响

总集篇，由小渡和火美子讲述至今所发生的全部冒险故事。

因为找不到小渡而焦急的魔界残兄弟在各地发出了通缉令，维持他雇佣了欠债高达99990000的赏金猎人佐罗尼，在地底找寻不到白龙的小渡一行人遇上了机械蚂蚁的袭击，关键时刻他们被尾随的虎王所救，虎王得意地向小渡炫耀地底是自己的游乐场。当被小渡问及白龙的所在时，哑口无言的虎王只能跑回家问东哥罗，意识到小渡正在寻找白龙的东哥罗脸色大变驾驶魔神冲进地底。小渡遇上了在地底避难的葫芦伯伯，从地底遗迹的画板上得知白龙的存在，这时一直侦查小渡等人的赏金猎人也来到了地底遗迹。小渡为了村民的安全束手就擒，但佐罗尼还是卑鄙地破坏了火山，看着喷涌而出的熔岩小渡使用紫龙赠予的光之玉救下大家，眼看状况不妙的佐罗尼丢下自己的搭档逃跑了。经过熔岩的侵蚀神殿露出了它隐藏的另一面——通向水晶洞窟的秘密地图。

多恶达的怒火引起地下世界的地震，东哥罗焦急地想要寻找小渡却发现自己携带的地图已经被虎王涂鸦到无法识别的程度。穿过满是热蒸汽的地下区域小渡等人在水晶之森反现了一个温泉湖，火美子毫无廉耻地直接下湖洗澡，连一向大胆的虎王也被她吓到了。小渡和虎王卷进激流中被困在一个密室中，看着渐渐上升的水平面，小渡和虎王决定寻找脱出的出口，在这个过程中小渡救下险些被落石压倒的虎王，看着为了自己而受伤的小渡虎王认定他是能够与自己交心的真正朋友，在佐罗尼的帮助下大家脱困了。收拾了前来追击的佐罗尼，虎王却依然昏迷不醒，按下虎王给自己的求救装置赶来的东哥罗却向大家揭露了残酷的真相，了解到一切的虎王脸上露出憎恨的表情向小渡拔刀相向，小渡不愿向虎王出手而一直处于被动挨打的状态，在最后一刻小渡回想起自己的使命不得不拿剑反击，两人最后因为火山喷发而停止动手，但是两人的关系已经彻底破裂了。

小渡因为与虎王决裂而心情失落，武一郎为了给小渡打气让大家一起高喊口号反倒引起了落石，看到影像中这一幕的虎王却越发愤怒，他发誓一定要杀死小渡。佐罗尼因为梦想幻灭而自暴自弃，就在这时他看到水晶洞窟，误以为是钻石的他兴奋不已。佐罗尼在发现“钻石”其实是水晶的时候因为再次的打击向小渡发起猛攻，险些被双重假面击败的龙神丸得到邪虎丸的帮助将敌人打败，但是虎王确是为了与小渡在一对一的战斗中决一胜负，赶来想要支援虎王的东哥罗则与幻神丸和战神丸开始交手。东哥罗杀死了幻神丸和战神丸，而龙王丸和邪虎丸也展开了激烈的交战，战斗的爆炸在水晶洞窟中不断爆闪，凤龙剑VS猛虎剑——蕴含了小渡和虎王两人最强的一击在互相的碰撞中唤醒了白龙，白龙看穿了小渡和虎王的因缘将邪恶的魔神放逐。明白事情缘由的白龙赐予了小渡龙王之盾并告诉他他将要面临的道路将会前所未有的惊险……

获得龙王之盾的小渡兴奋不已，但是武一郎和幻龙斋却为战神丸和幻神丸的死心痛不已，白龙虽然没有能力让魔神复活将他们变成了宝玉。白龙告诉大家创界山的起源、魔神与众神和救世主渡的故事，为了龙王剑小渡终于来到了第七层山界。第七层山界时充满了危险和诅咒的不祥之地，小渡在一座山丘上看到了龙王之剑，但是他却无法将已经石化的剑从地上拔出，就在大家苦恼的时候虎王再一次出现向小渡挑战，战斗中虎王因为失足掉落山崖，救他上来的火美子惹恼了虎王，想要打她一巴掌的虎王被挡在他面前的幻龙斋愣住了……龙王丸与邪虎丸的战斗再次展开，在邪虎丸处于下风的时候东哥罗加入了战场，连残兄弟也驾驶着尚未修复完毕的合体达出现。看到这一幕的武一郎和幻龙斋为自己的无力焦急不已，这时他们身上的宝玉化成了卡片和项链，战神丸和幻神丸以战王丸和幻王丸的姿态重生了，三对三的战斗即将开始，这时第七层山界却因为多恶达发生了异变，藏在黑暗中的魔神殿终于显露出他的真面目……

眼看自己的目标就在眼前，小渡不顾一切变身为凤凰冲向魔神殿，虎王在魔神殿面前拦下了小渡，一心向前的小渡打飞了邪虎丸，东哥罗也因为双眼被蒙而没法拦下小渡。战王丸和幻王丸拦下了合体达却不是它的对手，千钧一发之际古拉玛驾驶着空王丸赶到了。战王丸、幻王丸、空王丸的无间合作打败了合体达，失败的残兄弟向多恶达求助却反被他杀死，大家彻底被多恶达激怒了。在魔神殿内到处寻找的小渡最终来到了谒见厅门前却再次遭到虎王的阻挠，战斗波及到了虎王最终打开了谒见厅的大门。龙王丸与空王丸的连协战斗打伤了东哥罗却无法将它杀死，，对眼前这出好不精彩的无聊把戏多恶达发出攻击杀死了魔神·东哥罗，更是决定将虎王也一起杀死，挡下这道致命攻击的小渡愤怒的对王座呼喊，在谒见厅的暗黑龙头骨上多恶达终于现身了……

出现在大家面前的多恶达是个面目狰狞的巨人，看到向他攻来的魔神们多恶达仅凭魔王剑的一击就将众人击退，四魔神的必杀技无法对多恶达造成任何伤害，大家却要面对多恶达恐怖的全方面攻击，大家破开他的护罩之后多恶达甚至躲进了影子里，集中大家力量所发出的光芒划破了黑暗，眼见不妙的多恶达唤醒了暗黑龙。受到致命一击的东哥罗奄奄一息近乎，火美子能够治愈一切的万能药却对坏人无效，做了和虎王一起在和平的创界山上生活的东哥罗在虎王的眼泪中醒来，东哥罗为了保护虎王倒在了宫殿的碎石下，临终前他告诉虎王暗黑龙的弱点就在第六根骨头上。告别了自己心爱的火美子，虎王义无反顾的乘上了邪虎丸……暗黑龙拥有的力量实在太过强大，连四台魔神的全力一击也无法对它造成伤害，连赶来的邪虎丸也被他打倒，龙王丸使出自己的全部力量挥出了最强力量的凤龙剑却也无法伤他分毫，用尽全力的龙王丸变成了石头，虎王为了救下小渡向暗黑龙的弱点发起攻击，却也被暗黑龙一口咬下，邪虎丸身死虎王生死不明……朋友的受伤再次刺激了小渡，龙王丸也明白最后的战斗即将开始，神龙的真身金龙从龙王丸的躯壳中飞出，救世主小渡VS魔王多恶达，一直被人们传颂的古老传说即将在现在再次上演…..

在同伴们的鼓励下最终的战斗开始，小渡和多恶达展开了近乎悬殊的战斗，小渡虽然拥有龙王盾能够挡下多恶达的攻击却无法对他造成伤害，王者之剑在多恶达的攻击下被折断了，在暗黑龙的紧逼下小渡从山丘上拔出了龙王之剑。在龙王剑的召唤下，神部七龙纷纷现身来到第七层山界，七条神龙在龙王剑的号召下合为一体，巨大的光龙挡下了暗黑龙的攻击，多恶达和暗黑龙的攻击在龙王之剑面前失去了威力，在龙王剑的必杀攻击下多恶达被砍成两半发出不甘的怒号消失了……随着多恶达的死亡，第七层山界恢复了原状，连幻龙斋身上的诅咒也解除了，但是虎王却慢慢合上了双眼，看着死在自己眼前的虎王火美子也痛哭起来，就在这时创界山的主人圣龙妃让虎王恢复了原状——创界山的王子翔龙子。小渡接受圣龙妃的褒奖和大家一起回到摩沙村，分离的时刻终于到来，挥泪告别了一路陪伴自己的同伴，小渡在龙神丸面前泪流不止，但他最终还是与龙神丸约定即使它不再身边自己也会快乐地生活下去，乘上青龙的小渡回到了人间界的龙神湖。醒来的小渡身边是带着勾玉的龙神丸粘土玩偶——这一切都不是梦！

返回人间界的小渡在某天收到了一卷录影带，火美子突然从播放影像的电视中出现，原来这卷录像带是她为了小渡而拍的，创界山恢复和平后大家都过上了普通而愉快的日常生活，看着一张张熟悉的面孔小渡感慨万千，最后是大家对小渡加油助威，录像带完结后火美子也回到了创界山，想要和大家一起分享这个秘密的小渡却发现，原来这是卷一次性的录像带，但是这个秘密将会一直深藏在他心中……