Cuando una mujer que parece ser una asesina roba un microchip secreto que contiene información confidencial, un posible espía intenta usar a Zack y Cody para recuperarlo. Pero cuando Cody se lo dice a Bailey, ella se pregunta si puede confiar en él.

Después de un espectáculo de magia, Londres se lleva al mago, y Zack intenta salir con Cody y Bailey, lo que interfiere con su relación. Desesperados, logran que Woody se lleve a Zack para un próximo concurso de música.

Después de que el mal comportamiento de Zack se salga de control, se le asigna ser vigilante de pasillos. Pero él lleva las cosas un poco demasiado lejos, y las cosas comienzan a irse de las manos. Esto no ayuda a Cody y Bailey, que están tratando de encontrar más tiempo para verse; pero con Zack al acecho y Bailey consiguiendo un trabajo, comienzan a separarse.

Bailey se pone celosa cuando Cody llama la atención de otras chicas después de que se convierte en profesor sustituto de labores del hogar. Mientras tanto, London intenta vender los "cuadros" de Zack, que son cosas que tenía en la boca cuando estornudó.

Después de que Bailey y Cody intenten que London sea inteligente para una apuesta, London se vuelve inteligente con un perfume. Mientras tanto, la broma de Zack para Woody sale mal cuando accidentalmente empuja a una luchadora.

London visita a su abuela en Tailandia. Mientras tanto, Zack le pide a Cody que vaya a una cita doble con él.

Cuando Zack entrega uno de los viejos trabajos de Cody como propio, la Sra. Tutweiller cree que le tienen miedo a los plátanos. Mientras tanto, London sufre de abstinencia cuando le quitan sus teléfonos móviles en clase.

Después de que comienza un nuevo semestre, Zack, Cody, Woody, Bailey y London están a bordo de un bote salvavidas cuando se aleja del S.S. Tipton, y flota a la deriva en el mar. Cody y Bailey discuten sobre quién es mejor en todo, y London se vuelve loca, pensando que está en un lujoso hotel, y Bailey la ayuda a cumplir sus alucinaciones. De vuelta en el barco, el Sr. Moseby y la Sra. Tutweiller se dan cuenta de que los estudiantes están desaparecidos e intentan encontrarlos, también se quedan aislados.

Después de que comienza un nuevo semestre, Zack, Cody, Woody, Bailey y London están a bordo de un bote salvavidas cuando se aleja del S.S. Tipton, y flota a la deriva en el mar. Cody y Bailey discuten sobre quién es mejor en todo, y London se vuelve loca, pensando que está en un lujoso hotel, y Bailey la ayuda a cumplir sus alucinaciones. De vuelta en el barco, el Sr. Moseby y la Sra. Tutweiller se dan cuenta de que los estudiantes están desaparecidos e intentan encontrarlos, también se quedan aislados.

Zack se sorprende al saber que tiene un nuevo compañero de camarote que solía ser un famoso rapero hasta que llegó a la pubertad y su voz se hizo más grave.

Jordin Sparks viene a bordo del S.S. Tipton y Zack, Cody y Marcus intentan escribirle una canción. Mientras tanto, como uno de los concursos de "¡Bien por Mí!"de London, una de sus fanáticas pasa un par de días con ella en el barco, pero la admiradora de London está un poco loca.

Zack y Cody reciben un cheque de 200$ de sus padres por su cumpleaños número 16, pero tienen una discusión sobre cómo gastarlo. Durante la discusión, los dos desean ser hijos únicos y una vez que el barco se adentra en el Triángulo de las Bermudas, su deseo se hace realidad.

Zack, Marcus y Woody crean un falso concurso de belleza para que puedan conocer chicas. Cuando el Sr. Moseby se entera de sus planes, los castiga obligándolos a llevarlos a cabo. Mientras tanto, Bailey entra en el concurso para intentar vencer a London y contrata a Cody como su entrenador, pero se enfada con él cuando se vuelve demasiado controlador.

Zack y Cody hablan con el alcalde Ragnar cuando el barco atraca en Suecia, y se sorprenden al enterarse de que sus antepasados eran canallas y no héroes como pensaron originalmente los gemelos. Mientras tanto, Moseby recibe ayuda de Marcus para encontrar el tornillo que falta para su mesita de noche, pero accidentalmente se quedan atrapados en una tienda de muebles.

Esteban sube a bordo del barco para casarse, sin embargo, su madre no aprueba a su futura mujer.

Cody crea una red de mentiras para cubrir el hecho de que no hizo los deberes y se le sale de las manos. El Sr. Moseby y Zack son esposados juntos cuando su pelea empeora.

Después de que Moseby prohíbe a la pandilla jugar al fútbol, se interesan en el fútbol de fantasía.

Cody trata de averiguar quién robó un libro valioso.

Mientras busca en un sitio arqueológico en América del Sur, Zack despierta el espíritu de una antigua princesa.

Cuando el padre de Londres le da un millón de dólares para encontrar un invento en el mercado, ella le pide a sus amigos que inventen un invento único y les ofrece el dinero en efectivo como premio. Al principio, todos tienen sus propias ideas, pero luego combinan sus recursos, causando estragos en la nave con su robot multifuncional.

La pandilla tiene sueños de ser personajes en tres cuentos de hadas diferentes; Hansel y Gretel, Blancanieves, y Jack y las Habichuelas Mágicas.

Una asignación de clase requiere que los estudiantes simulen el matrimonio para aprender los desafíos que enfrentan las parejas casadas en la vida cotidiana. Cody se casa con Bailey, Zack se casa con London y Woody se casa con Addison. Sin embargo, cuando la "Ruleta de la vida" le da a Cody una lesión, él y Bailey comienzan a pelear.

Cody quiere comprar pendientes para Bailey, pero Zack insiste en que negocie con el vendedor por un mejor precio. Mientras tanto, London, Bailey, Marcus y Woody descubren una lámpara mágica que contiene un genio dispuesto a conceder deseos, lo que hace que discutan sobre qué deseos deberían otorgarse.

Cody y Bailey se encierran en la sala de máquinas, junto con Zack y Woody, y apagan los motores de la nave cuando descubren que un grupo de ballenas en peligro de extinción se encuentra en su camino. ¿Pueden aguantar el tiempo suficiente cuando Kirby y el Sr. Moseby intentan arreglar las cosas?

Mientras producen un programa de noticias para la clase de la Sra. Tutweiller, cada uno de los chicos encuentra su propio conjunto de problemas. Zack y Bailey se enfrentan como copresentadores, Cody hace un descubrimiento sorprendente vinculado a London durante su informe de investigación, Kirby recuerda los buenos días, mientras que London está teniendo problemas con la pantalla verde.

La pandilla avanza en el tiempo cientos de años hasta la Nave espacial Tipton, donde deben volver a poner a la nave en rumbo después de que el descendiente de Zack la puso en un curso acelerado para Planet Bikini.

Con una gaviota cazando a Cody, intenta que Zack y Marcus lo ayuden a atraparla. Mientras tanto, London toma asesoramiento después de que ella apuesta a Bailey para que pueda pasar una semana sin insultar a nadie.

El barco atraca en París, y Bailey disfruta de la compañía de un guapo joven pintor prodigio. Cuando Cody ve esto, inmediatamente se pone celoso, pero quiere preguntarle a Bailey qué está haciendo. Pero cuando ella encuentra a London en sus brazos durante una cita de ensayo, los dos discuten y se separan.

Mientras tanto, Zack y Woody están siendo perseguidos por ladrones de arte, y la identidad de Marcus es robada por un niño llamado Dante.

El barco atraca en París, y Bailey disfruta de la compañía de un guapo joven pintor prodigio. Cuando Cody ve esto, inmediatamente se pone celoso, pero quiere preguntarle a Bailey qué está haciendo. Pero cuando ella encuentra a London en sus brazos durante una cita de ensayo, los dos discuten y se separan.

Mientras tanto, Zack y Woody están siendo perseguidos por ladrones de arte, y la identidad de Marcus es robada por un niño llamado Dante.