Cinq ans après le départ de leurs parents, Taylor et Hayley trouvent un Jaeger d'entraînement... qui attire vite les foudres d'un Kaiju sur leur village.

Quand l'énergie d'Atlas Destroyer s'épuise, Taylor et Hayley fouillent les ruines d'une ville voisine en quête de batteries, et multiplient les découvertes surprenantes.

En se déplaçant à pied, Taylor, Hayley et Boy tombent sur un campement nomade, base d'un dangereux trafic. Son chef peu recommandable tente de découvrir leur secret.

Lorsqu'un Kaiju approche rapidement, Shane oblige Taylor à copiloter Atlas Destroyer avec Mei pour le mettre hors de danger, mais Taylor ne l'entend pas de cette oreille.

Pour reprendre Atlas Destroyer et sauver Hayley et Boy, Taylor se lance dans une manœuvre risquée, le "mode fantôme". Joel et Mei font un choix fatal.

Le mystère du passé de Boy s'épaissit encore quand Taylor et Hayley le trouvent au milieu de Kaijus morts et de Jaegers détruits, en compagnie de la créature responsable.

En répondant à un signal de détresse, Taylor et Hayley reconnaissent le Jaeger de leurs parents, puis affrontent le Kaiju qui les suivait. Sous les yeux ébahis de Boy...