밑바닥 인생을 살던 프리터 타케미치는 중학교 시절 사귀었던 인생에서 유일한 여자친구 타치바나 히나타가 범죄조직 '도쿄 만지회'의 항쟁에 휘말려 죽었다는 것을 알게 된다. 갑작스러운 비보에 놀라면서도 변함없는 일상을 보내던 타케미치였지만 역 플랫폼에서 누군가에게 떠밀려 선로로 추락한다. 다가오는 열차를 보며 죽음을 각오했지만 눈을 떠보니 어째서인지 12년 전으로 타임 리프해 있었는데...

히나타의 동생 타치바나 나오토와 악수한 순간 현대로 돌아온 타케미치는 형사가 된 나오토와 재회한다. 도쿄 만지회를 범죄 조직으로 만든 중요 인물인 사노 만지로와 키사키 텟타의 만남을 타임 리프해서 저지하고 히나타를 구해달라고 부탁하는 나오토. 하지만 미래를 바꾸기 위해 다시 12년 전으로 돌아간 타케미치를 기다리고 있던 것은 도쿄 만지회의 멤버인 키요미즈 타카마사에게 노예처럼 괴롭힘당하는 나날이었는데...

몸이 약한 야마모토 타쿠야를 지키고 도망치기만 했던 자신을 바꾸기 위해 키요마사에게 무모하게 도전하는 타케미치. 일방적으로 공격당하면서도 무릎을 꿇지 않고 엉망이 된 몸으로 큰소리를 치는 모습에 키요마사는 동요한다. 그리고 그곳에 훌쩍 도쿄 만지회의 총장 사노 만지로(마이키)와 부총장인 류구지 켄(드라켄)이 나타나는데...

중학생 시절의 히나타와 과거에서 행복한 시간을 보내던 중 현재로 돌아온 타케미치. 12년 전의 마이키를 생각하면 마이키가 도쿄 만지회를 극악 집단으로 만들었다는 사실을 믿을 수 없다고 나오토에게 말한다. 마이키에게서 직접 이야기를 들으려고 하지만 경찰인 나오토조차도 마이키의 소재를 알아낼 수 없었다. 마이키에게 연결되는 단서를 찾던 중 불량배 시절 친구였던 센도 아츠시(앗 군)가 도쿄 만지회의 간부가 됐다는 것을 알게 되는데...

12년 전 도쿄 만지회에서 '마이키파'와 '드라켄파'의 내부 항쟁이 일어나 드라켄이 사망했다는 것을 알게 된 나오토. 나오토의 보고를 들었지만 마이키와 드라켄이 싸우는 일은 있을 수 없다고 믿는 다케미치는 항쟁의 진짜 원인을 찾고, 드라켄을 구하기 위해 다시 과거로 돌아간다. 결의를 새롭게 다지고 타임 리프한 타케미치였지만 눈을 뜨니 그곳에는 속옷 차림의 처음 보는 여성이 있었는데...

도쿄 만지회 3번대 대장 하야시다 하루키(파칭)의 친구가 습격당한 것을 계기로 도쿄 만지회와 신주쿠를 지배하는 뫼비우스의 항쟁이 시작되려 하고 있었다. 나오토의 조사에 의하면 드라켄이 사망한 원인은 뫼비우스와의 항쟁이 아니라 도쿄 만지회의 내부 항쟁일 터였다. 그날 정말로 무슨 일이 일어난 것일까. 뫼비우스의 총장 오사나이 노부타카에게서 그날의 진실을 듣기 위해 타케미치는 현재로 돌아오는데...

뫼비우스의 습격 이후로 대립 중인 마이키와 드라켄은 타케미치의 병문안을 왔다가 서로 대면하고 둘은 싸우기 시작한다. 날뛰는 두 사람에 의해 타케미치의 소중한 추억이 깃든 물건들이 차례로 부서져서 타케미치는 격노한다. 앗 군과 다른 친구들의 제지를 뿌리치고 둘에게 달려드는가 싶더니 두 사람과 도쿄 만지회에 대한 자신의 마음을 울면서 말하는 타케미치. 그 말이 마이키와 드라켄의 마음을 움직이면서 둘을 화해시키는 이번 미션은 성공한 듯했는데...

나오토에게 들은 정보에 의지해 드라켄이 죽은 장소로 추정되는 주차장으로 달려간 타케미치. 그곳에는 혼자서 뫼비우스와 싸우고 있는 드라켄이 있었다. 타케미치와 미츠야는 고군분투하는 드라켄을 발견하고 가세하려고 하지만 적의 수가 너무 많아 압도당한다. 그러던 중 달려온 마이키의 앞에 '드라켄 사냥'을 계획한 흑막이 모습을 드러내는데...

도쿄 만지회와 임시 총장 한마 슈지가 이끄는 뫼비우스의 대난투 속에서 드라켄이 키요마사의 칼에 찔려 쓰러졌다. 마이키는 중상을 입어 움직일 수 없게 된 드라켄에게 달려가려 했지만 한마의 방해해 가로막혀 타케미치에게 드라켄을 부탁한다. 그러나 구급차의 도착을 기다리던 타케미치의 앞에 키요마사와 그의 동료들이 나타난다. 타케미치는 드라켄을 지키기 위해 악연으로 얽힌 키요마사에게 두 번째 대결을 신청하는데...

타케미치가 집념으로 키요마사와의 대결에서 승리했고 앗 군과 친구들이 몸을 던져 키요마사 일당을 저지하면서 구급차가 도착하기 전까지 드라켄을 지켜냈다. 하지만 드라켄은 의식 불명의 중태에 빠진다. 그리고 그때 도만과 뫼비우스의 난투도 끝을 맞이하려 하고 있었다. 마이키와 호각으로 싸우던 한마는 이제 곧 관동에서 가장 흉악한 폭주족 연합 '발할라'가 탄생하고 자신은 부총장이 될 거라고 말하고 그 자리를 떠난다...

드라켄의 목숨을 구한 타케미치가 현대로 돌아와보니 앗 군은 미용사가 된다는 꿈을 이루었고, 히나가 휘말려 사망했던 도쿄 만지회의 사건도 일어나지 않았다. 재회한 나오토에게서 히나가 살아 있다는 소식을 들은 타케미치는 나오토와 함께 히나를 만나러 가지만 지금의 자신은 아무것도 변하지 않았다는 것을 부끄럽게 생각해서 만남을 거부하고 돌아가려 했는데...

히나타의 장례식에서 기도하며 자포자기한 나오토에게 자신의 결의를 전하는 타케미치. 마이키의 옆에 드라켄이 있는데도 똑같은 미래가 된 것은 어째서인가. 드라켄을 만나 진실을 확인하야 한다고 생각한 타케미치였지만 이 세계에서 그는 도만 소속이 아니었고 사형수가 되어 있었는데...

도쿄 만지회의 새로운 3번대 대장의 임명식이 열리고 전 뫼비우스였던 키사키가 3번대 대장에 임명된다. 일부 멤버들이 불만 의사를 표시했지만 마이키는 신흥세력인 발할라와 싸우기 위해 키사키의 힘이 필요하다고 설명하며 불만의 목소리를 잠재운다. 하지만 키사키 때문에 도만이 거악화하고 히나와 앗 군이 희생된다는 것을 알고 있는 타케미치는 결국 참지 못하는데...

마이키로부터 됴쿄 만지회를 탈퇴하고 발할라에 들어간 전 1번대 대장 바지 케이스케를 데려와 달라는 부탁을 받은 타케미치. 마이키와의 약속으로 성공하면 키사키를 도만에서 내보낼 수 있게 되었지만 '실패하면 죽는다'라고 마이키에게 협박도 당했다. 바지와 접촉하기 위해 불량배에 대해 박식한 야마기시에게 발할라의 내부 사정 등을 배우던 중 발할라의 넘버3인 하네미야 카즈토라가 타케미치의 앞에 나타나는데...

2년 전 마이키, 드라켄, 바지, 미츠야, 파칭, 카즈토라 6명은 같은 특공복을 만들고 카나가와로 투어링을 떠났다. 총장 마이키만 '호크마루'라고 이름붙인 스쿠터를 탔다. 우연히 조우한 그 지방의 폭주족과 시비가 붙지만 마이키는 자신보다 연상인 폭주족들에게 '내 호크마루에 손가락 하나라도 대면, 죽는다?'라고 경고하는데...

바지와 카즈토라의 과거 이야기를 듣고 바지를 도만에 데려가는 것이 어렵다는 것을 알게 된 타케미치. 다음날 마이키와의 약속을 지키지 못할 것 같아 실의에 빠져있던 타케미치의 앞에 바지의 부하로 1번대 부대장을 맡고 있는 마츠노 치후유가 나타난다. 치후유는 바지가 발할라에 들어간 것은 도만을 밟기 위해서가 아니라 발할라에 잠입해서 키사키의 꼬리를 잡기 위함이라고 믿고 있었는데...

도만과 발할라의 결전의 날 '피의 핼러윈'에서 카즈토라가 바지를 죽였고, 이에 격노한 마이키가 카즈토라를 죽였다는 사실을 현재의 드라켄에게서 들은 타케미치. 그 결과 마이키의 마음은 타락했고 발할라에 빼앗긴 도만은 키사키를 필두로 한 극악무도한 거대 조직 신생 도쿄 만지회로 변모한 것이었다. 바지를 지키고, 비극을 막는다는 새로운 미션을 수행하기 위해 타케미치는 다시 과거로 돌아가는데...

도만이 발할라에 흡수되어 변모하는 계기가 된 '피의 핼러윈'이 시작됐다. 한마를 비롯한 수많은 발할라의 멤버들과 대치하던 드라켄은 동료들을 지키면서 싸우느라 고전을 면치 못했다. 하지만 이 항쟁을 끝내서 바지와 마이키를 구하고 싶은 마음으로 분투하는 타케미치의 모습이 도만 멤버들의 마음에 불을 붙이게 되는데...

'피의 핼러윈' 난투 중 특기인 자유로운 움직임을 봉인당한 채 3대1로 싸우던 마이키는 카즈토라가 휘두른 쇠 파이프에 맞아 그 자리에서 주저앉는다. 움직이지 못하는 '무적의 마이키'를 끝장내기 위해 발할라의 멤버들이 달려든다. 드라켄과 타케미치는 마이키를 구하려고 하지만 가까이 갈 수조차 없었다. 그때, 절체절명의 위기에 처한 마이키의 앞에 나타난 것은 예상치 못한 인물이었는데...

발할라에 잠입했던 바지는 격렬한 항쟁 중에 키사키를 몰아붙이지만 갑자기 피를 토하며 주저앉는다. 그것을 본 마이키는 한마를 순식간에 처리하고 카즈토라를 가차 없이 패 죽이려 한다. 그 광경은 타케미치가 미래에서 사형수가 된 드라켄에게 들은 그대로였다. 이대로는 마이키가 카즈토라를 죽이고, 키사키가 도만을 차지하게 되는 비극적인 미래가 찾아올 뿐이다. 그것을 막으려고 하는 타케미치였지만 마이키의 분노는 무시무시했는데...

2년 전 카즈토라가 사는 지역의 폭주족 '블랙 드래곤'과 충돌한 것을 알게 된 마이키는 블랙 드래곤과 싸우기로 결심하지만 폭주족을 상대로 싸우기 위한 대의명분이 필요하다고 생각했다. 그리고 그때 바지가 팀을 만들자고 제안하고 한 명 한 명이 모두를 위해 목숨을 걸 수 있는 팀으로 만들고 싶다고 말한다. 결성을 기념하며 다 같이 돈을 모아 교통안전 부적을 하나 산 그날의 약속을 지키기 위해서 바지는 혼자서 싸웠던 것이었는데...

'피의 핼러윈'이라고 일컬어지는 도만과 발할라의 항쟁은 도만이 승리했지만 바지가 죽고, 카즈토라가 체포되는 비참한 결과로 막을 내렸다. 타케미치는 아무것도 할 수 없었던 것을 후회했지만 마이키가 카즈토라를 죽이는 것은 회피할 수 있었다. 타케미치는 드라켄과 함께 카즈토라를 만나러 갔다 돌아오는 길에 드라켄의 집을 방문하게 되는데...

처음으로 도만의 특공복을 입고 집회에 참가한 타케미치는 마이키의 옆에 서 있는 발할라의 부총장 한마와 치후유를 보게 된다. 도만에게 패배한 발할라가 도만의 산하로 들어오게 된 것이다. 게다가 그들의 사이를 중재한 것은 키사키 텟타였다. 타케미치는 바지가 목숨을 걸어 도만을 지키려고 했음에도 아직 미래를 바꾸지 못했다는 것에 절망한다. 그러던 중, 치후유가 어떤 말을 하는데...

현재로 돌아간 타케미치는 자신이 도만의 간부가 된 사실을 알고 놀란다. 그러나 키사키는 타케미치를 배신자로 몰아 그를 죽이려고 하는데...

과거로 돌아간 타케미치는 핫카이와 시바를 만나 우호적인 유대를 형성한다. 그러나 시바의 집으로 가는 길에 블랙 드래곤과의 우연한 만남이 폭력적인 사태로 변하는데...

타이쥬는 타케미치를 일격에 쓰러뜨린다. 타케미치를 구하기 위해 핫카이는 도만을 그만두겠다고 선언하는데...

핫카이가 도만을 떠나고 블랙드래곤에 합류하겠다고 말한 상황. 그러나 미츠야는 핫카이가 도만을 떠나는 것을 허용하지 않고 타이쥬와 싸우는데...

키사키와 한마는 핫카이를 구하고 블랙 드래곤을 쓰러뜨리려는 타케미치와 치후유에게 도와주겠다고 한다. 타케미치와 치후유는 이 상황에서 결정을 내리는데...

각자의 동기에 이끌려 크리스마스 밤에 교회로 향하는 타케미치, 치후유, 키사키, 한마. 그들을 기다리는 것은 터무니없는 사건이었는데...

타이쥬에게 향한 유즈하의 기습 공격은 실패하고 만다. 타케미치는 유즈하가 미래를 바꾸는 열쇠임을 깨닫고 다시 전투에 참여하는데...

미츠야는 교회에 도착했지만 기습 공격으로 중상을 입는다. 위기에 처한 타케미치는 결집하여 블랙 드래곤의 미래에 대해 과감한 선언을 한다. 타이쥬는 계속해서 그를 때려눕히지만 타케미치는 계속해서 일어나는데...

자신의 비밀을 고백한 핫카이는 동생에 대한 두려움을 극복하고 다케미치와 함께 타이쥬를 공격한다. 패배가 임박했을 때 익숙한 자전거 엔진 소리와 함께 마이키가 교회에 도착한다. 그런데 마이키의 상태가 뭔가 이상해보이는데...

블랙 드래곤을 물리친 후 타케미치는 마이키에 의해 히나의 집으로 끌려가 바로 전날 헤어진 그녀와 마주하게 되는데...

도쿄만지회의 올해 첫 회의에서 블랙 드래곤에 대한 승리를 선언한 마이키는 예기치 않은 발표를 하게 되는데...

자신이 미래를 바꾸었다고 확신한 타케미치는 현재로 돌아온다. 하지만 그가 돌아온 현재는 그 어느 때보다 최악의 상황이 되어 있는데...

타케미치는 그 어느 때보다도 끔찍한 현재를 바꾸기 위해 다시 과거로 돌아간다. 치후유를 만난 후 타케미치는 자신이 해야 할 일을 깨닫게 되는데...

요코하마의 '천축'이 도쿄 만지회를 치러 시부야로 쳐들어온다. 타케미치를 비롯한 미조 중학교 5인방과 치후유는 천축 멤버와 마주쳐 기습을 당하게 되는데. 머릿수가 압도적으로 부족한 상황에서, 천축 특공복 차림의 키사키에 이어 천축 사천왕인 모치즈키 칸지(못치)도 나타나며 상황은 절망적으로 흘러간다.

4번대 대장 카와타 나호야(스마일리)와 부대장 카와타 소우야(앵그리)의 도움으로 위기에서 벗어난 타케미치 일행은 천축의 아지트에 쳐들어간다. 그곳에는 타케미치의 소꿉친구인 카쿠쵸가 있었는데. 천축에 대한 정보를 모으기 위해 도만은 긴급 집회를 열지만, 타케미치는 카쿠쵸의 조언과 키사키의 음모가 신경 쓰인다.

현대로 돌아온 타케미치는 시바 타이쥬와 만나 현 도만의 실질적 리더가 쿠로카와 이자나라는 사실을 듣는다. 갑작스러운 이누이 세이슈(이누피)와 코코노이 하지메(코코)의 습격을 피해 도망가던 타케미치와 나오토는 키사키와 카쿠쵸의 총에 맞고 마는데. 두 사람은 마지막 힘을 쥐어짜 악수를 하고, 타케미치는 다시 과거로 타임 리프한다.

타케미치는 현대의 나오토가 죽었다는 사실을 알고 낙담하지만, 히나타가 건넨 말에 다시 힘을 낸다. 마이키와 이자나를 연결하는 정보를 얻은 뒤 1번대 멤버와 작전을 짜려던 타케미치는 갑자기 나타난 5번대 대장 무토 야스히로(무쵸)에게 납치당한다. 타케미치가 눈을 뜨자 엉망진창인 모습의 이누피와 코코도 보이는데.

S62 세대이자 천축의 창설 멤버였던 무쵸의 목적은 돈을 벌어들이는 능력이 뛰어난 코코였다. 압도적으로 불리한 상황에서 타케미치는 코코를 지키기 위해 싸우고, 그 모습을 본 이누피는 타케미치에게 11대 블랙 드래곤 총장이 되어 달라고 부탁한다. 한편, 무쵸의 배신을 보고받은 마이키는 결기 집회를 연다.

갑자기 바이크로 돌진해 온 키사키가 야구 배트를 휘두르고, 이에 맞은 에마는 마이키의 등에 기댄 채 숨을 거둔다. 타케미치는 마이키와 도만이 어둠에 물드는 계기가 에마의 죽음이라는 걸 깨닫지만, 이미 과거에 일어난 일이기에 구할 수 없음을 알고 절망한다. 영안실에 누운 에마 앞에 드라켄은 망연히 서 있는다.

마이키와 드라켄이 빠져 리더가 없는 상태로 천축과의 결전에 나서는 도만. 승산 없는 싸움에 머뭇거리는 도만 멤버들을 독려하고 선두에 선 사람은 바로 타케미치였다. 한편, 천축은 사천왕과 도만 출신인 무쵸까지 함께 요코하마의 부두에서 도만을 기다린다.

타케미치가 키사키에게 가는 길을 열기 위해 분투하는 1번대. 이누피는 코코와 대치하던 중 천축에 들어오라는 제안을 받지만 단호하게 거절한다. 이누피가 '아카네'라는 이름을 입에 올리자 코코는 흥분하며 분노를 드러내는데.

마이키와 드라켄 부재의 영향으로 타케미치를 비롯한 도만 멤버들은 극악의 세대가 이끄는 천축에게 고전을 면치 못한다. 화려한 연계를 펼치는 천축의 사천왕 하이타니 형제. 그에 맞서는 핫카이와 카와타 소우야(앵그리)는 형의 후광을 입었다는 조롱에 막내 동맹을 맺고 맞서 싸운다.

앵그리의 각성으로 반전됐던 상황은 카쿠쵸에 의해 다시 뒤집힌다. 도만의 주력 멤버들이 연이어 쓰러지는 중에도 타케미치는 몇 번이고 다시 일어나며 옛 친구의 본심을 캐묻는데. 갑자기 끼어든 키사키가 타케미치에게 총구를 들이밀지만, 타케미치는 꺾이지 않고 똑바로 키사키를 바라본다.

실의에 빠져 있을 터였던 마이키와 드라켄이 부두에 나타난다. 타케미치는 타임 리퍼이며, 지금껏 모두를 살리기 위해 싸웠다고 말하는 히나타. 마이키와 드라켄은 지금껏 보았던 타케미치의 행동을 떠올리며 그 사실을 믿어 준다. 마이키가 형인 이자나와 대치하며, 도만의 총장과 천축 총장 간의 대결이 시작된다.

총장 간의 대결에서 우세한 듯 보였던 이자나는 결국 마이키의 발차기에 당한 대미지가 축적되어 패배한다. 악에 받친 이자나는 키사키의 총을 빼앗아 마이키에게 겨누지만, 카쿠쵸로 인해 총을 떨어뜨리고 만다. 다시 총을 든 키사키는 이자나를 설득하려던 카쿠쵸를 계획에 방해된다며 쏴 버리는데.

카쿠쵸를 감싸고 키사키의 총에 맞은 이자나는 마이키 가족과 혈연관계가 아님을 고백하고 숨이 끊어진다. 천축 간부들이 상황을 정리하던 중에 도주하는 한마와 키사키. 놓치면 다시 타임 리프를 할 거라 생각한 타케미치는 드라켄과 함께 키사키를 쫓는다. 눈 내리는 거리에서 타케미치는 키사키를 궁지에 몰아넣는데.