At Deep Space Nine, a space station located next to a wormhole in the vicinity of the liberated planet of Bajor, Commander Sisko and crew welcome alien visitors, root out evildoers and solve all types of unexpected problems that come their way.

Nick Fury fica a saber de uma invasão clandestina da Terra por uma facção de Skrulls transmorfos. Fury junta-se aos seus aliados, incluindo Everett Ross, Maria Hill e o Skrull Talos, que prosperou na Terra. Juntos terão de correr contra o tempo para impedir uma iminente invasão dos Skrulls e salvar a humanidade.