Omega se snaží přežívat v imperiálním vězení, ale každodenní rutina není zrovna nejpříjemnější. Volné chvilky tráví se Střelcem, který útěk ze základny již vzdal. Nala Se se snaží vybraným jedincům zvednout počet M-částic v těle a Omega jí u tohoto záhadného projektu asistuje.

Zbytek Vadné Várky se dostane k cenné informaci, kde by se mohl nacházet doktor Hemlock. Informace je sice správná, ale imperiální laboratoř byla bohužel přemístěna. Tým se pokouší zjistit kam a v mezičase narazí na další dva mladé klony, kteří na planetě uvízli.

Vracíme se na planetu Weyland, kde Nala Se kontaktuje Omegu, ať okamžitě uteče. Pokud se její krevní vzorek dostane do rukou Impéria, bude v nebezpečí. Omega se tak zoufale vydává na útěk, zatímco na planetu dorazí císař Palpatine, který jde osobně dohlédnout na svůj záhadný projekt.

Omega a Střelec ztroskotají na planetě Lau, která je pod imperiálním dohledem. Oba se snaží vydělat si nějaké kredity v hazardu tak, aby mohli bezpečně planetu opustit. Když ale Omega obere jednoho z imperiálních důstojníků, dostane se se Střelcem a Varčdou do problémů.

Stará parta se dává opět dohromady, když se k týmu přidává i Echo. Lovec a Střelec se pokusí zamazat staré rány, ale nebude to úplně až tak lehké. Vadná Várka se pokouší odhalit pravou lokalitu Tantissu, k čemuž by mohl dopomoci datapad Naly Se, ale je nutné vyrazit na imperiální základnu.

Na planetě Pantora se tajně setkává senátorka Riyo Chuchi s Avim Singhem, aby společně projednali kroky proti Galaktickému Impériu. Jejich rozprava je ale narušena klonovým speciálním vojákem X. Rex oba senátory zachrání a zjistí, po kom dalším tato jednotka pátrá – po Omeze.

Zatímco se Vadná Várka vypořádává se záhadným klonem CX-2, na scénu dorazí komandér Wolffe, který je stále ve službách Impéria. Poprvé od konce Klonových válek se tak setkává Wolffe s Rexem, kteří toho spolu hodně zažili. Jejich konfrontace je tak velice napínavá.

Vadná Várka si dělá starost o Omegu. Nejdříve ale musí přijít na to, proč po ni Impérium jde a co vlastně znamenají záhadné M-částice. Tým se vydává za Fennec Shand, která by mohla vědět, oč se jedná. Samozřejmě se cenná informace neobejde bez vedlejší mise a prácičky.

Vadná Várka stále nepřišla na to, co jsou to M-částice, ale zničehonic si je vyhledá jistá Asajj Ventress, která chce otestovat Omegu. Mladou dívku podrobí celkem třem zkouškám, při kterých se chce ujistit, zda by Omega mohla mít dostatečný počet midichlorianů a mít vlohy k Síle.

Emerie Karr si konečně získává důvěru Impéria a Royce Hemlock ji zasvětí do projektu Nekromant. Emerie to bere jako obrovskou poctu, ale brzy začíná litovat. Dozvídá se totiž, že Impérium vězní několik dětských jedinců, které průběžně testuje na počet M-částic.

Speciální klonový voják X dokázal pomocí svých kontaktů vystopovat Omegu a Vadnou Várku. Okamžitě se jí pokusí zajmout. Když se dva členové týmu dostanou do smrtelného nebezpečí, Omega se rozhodne k zoufalému činu – vzdát se Impériu. Střelec to bere jako výzvu.

Omega se vrací do Mount Tantiss, kde ji doktor Hemlock okamžitě otestuje na počet M-částic. Vadná Várka netuší, jak Omegu najít. Lovec ale přijde se zoufalou myšlenkou na dávno zapomenutého imperiála, která by je mohl do Mount Tantiss dovést. Jenže ten je ve vězení.

Omega vymýšlí plán, jak se opět dostat z vězení a pomoci uvězněným dětem. Vadná Várka se od Ramparta dozvídá, jak přesně se dostat na Mount Tantiss. Nebude to ale vůbec jednoduché. Tým se nejdříve musí dostat na orbitální dráhu Coruscantu a tam získat cenné informace.

Vadná Várka se konečně dostává do Mount Tantiss, jenže Impérium již o nich ví. Omega tuší, že se v základně něco děje, a tak podnikne další kroky k útěku. Tech se setkává s Emerie, u které nachází potřebné sympatie. Rodí se tak spolupráce na záchranu dětí z Mount Tantiss.

Omega a Vadná várka bojují s imperiálními silami za svou svobodu.