Quand sonne minuit, Yoyo, Gluglu et Bibou enfilent leurs pyjamas spéciaux. Ils deviennent les Pyjamasques et déambulent dans la nuit, au lieu d'être dans leur lit.

Alors qu'il fait beau et que les enfants jouent sous les jets d'eau, l'eau s'arrête soudainement de couler et de mystérieux nuages sortent des tuyaux d'arrosage, obligeant les enfants à arrêter leur jeu. Les Pyjamasques vont devoir affronter Sorceline, et Yoyo sa peur de l'eau pour que les choses rentrent dans l'ordre.

Il est arrivé quelque chose d'étrange à la bibliothèque : les livres ne sont plus remplis d'histoires, mais de photos de Roméo; les Pyjamasques vont tout faire pour déjouer le plan.

Le musée vient de réouvrir après des travaux. Il y a une nouvelle salle d'exposition dédiée aux sciences, mais le mur de cette salle est déjà fissuré. Les enfants se doutent bien que c'est Roméo qui est derrière tout ça. Ce dernier veut en effet voler le propulseur qui est exposé et s'en servir pour devenir le maître du monde.

Le matériel de sport a disparu; nos trois héros vont bientôt s'apercevoir que Ninjaka l'a volé pour entraîner ses Ninjazouaves.

Un ptérodactyle géant a disparu.

Sacha est content, il est enfin assez grand pour utiliser les jeux des grands ! En arrivant au parc, lui et ses amis ont une mauvaise surprise : les jeux sont devenus minuscules. Dans la ville aussi, les choses se mettent mystérieusement à rétrécir. Les Pyjamasques vont essayer de découvrir qui se cache derrière tout ça.

Alors que les enfants jouent au football, un énorme ballon apparaît et aspire tous les jouets sur son passage; les Pyjamasques vont devoir unir leurs forces pour déjouer le plan de Sorceline.

Sacha aimerait aller voir les lions et les tigres, mais Greg et Amaya l'entraînent malgré lui voir les papillons. Arrivés sur place, ils découvrent que les papillons ont disparu. C'est Sorceline qui les a tous enlevés pour remplacer ses Papi-nuits qui ne lui donnaient plus satisfaction. Les Pyjamasques doivent retrouver Sorceline et ramener les papillons chez eux !

Les enfants font une partie de basket, mais le sifflet de Cameron disparaît; les Pyjamasques ne vont pas tarder à découvrir que Sorceline est derrière tout ça et qu'elle utilise le sifflet pour entraîner ses Papi-nuits à voler des jouets.

Lorsqu'il doit réciter un poème devant toute sa classe, Greg est très embarrassé et se trompe dans sa récitation. L'instituteur lui propose de retenter l'exercice le lendemain. Plus tard dans la journée, une boîte à voix aspire la voix de Greg. Ses compères et lui se lancent à la poursuite de Roméo, l'inventeur de cette terrible boîte à voix.

Sacha est fan de l'émission de Maître Fang, le maître du Kung Fu ! L'épée de ce dernier a disparu ; il ne peut donc plus faire son émission. Sacha est très énervé. Qui a bien pu voler l'épée de Maître Fang ?

Amaya et Greg disparaissent lors d'une partie de frisbee. Sacha enquête et découvre que Roméo les a capturés et a fabriqué un robot-hibou et un robot-lézard, identiques à Bibou et Gluglu ! / C'est la journée Un élève, un objet à l'école. A cette occasion, Amaya a prévu de présenter la statue du Hibou du Partage que lui a offerte sa tante, et qu'elle doit offrir à son tour.

C'est la journée Un élève, un objet à l'école. A cette occasion, Amaya a prévu de présenter la statue du Hibou du Partage que lui a offerte sa tante, et qu'elle doit offrir à son tour. A l'école, les objets de tous les autres élèves ont disparu. Les Pyjamasques décident de mener l'enquête. Ils découvrent que Sorceline est derrière tout ça. Cette dernière veut réunir les plus beaux objets pour son nouveau repaire lunaire.

Greg a hâte de fêter son anniversaire et veut montrer à ses amis la décoration de sa salle, mais lorsqu'ils arrivent sur place, tout a été saccagé ! Heureusement, les traces de pas des Ninjazouaves les mènent sur la bonne piste : Ninjaka a volé le gâteau d'anniversaire lézard de Greg pour organiser sa propre fête.

Le spectacle de marionnettes de l'école est annulé : les marionnettes ont mystérieusement disparu. Les Papi-nuits mènent les Pyjamasques sur la trace de Sorceline. En partant en mission, ces derniers croisent Cameron, somnambule, dans la rue. Alors que les Pyjamasques tentent de le ramener chez lui, Sorceline décide d'en faire une marionnette.

Greg n'a pas envie d'être traité comme le plus petit qu'il faut toujours aider; cette nuit, pour retrouver le bus scolaire qui a disparu, Gluglu veut affronter Ninjaka seul, et prouver qu'il n'a besoin de personne.

Nos trois héros font la rencontre d'un ninjazouave pas comme les autres : il est tout petit et semble vouloir jouer avec les Pyjamasques. Gluglu et Bibou sont attendris mais Yoyo se méfie car, pour lui, c'est forcément Ninjaka qui envoie ce mini ninjazouave !

Yoyo n'a que deux places pour le spectacle de son chanteur préféré, et doit choisir lequel de ses meilleurs amis l'accompagnera au concert. / Gluglu perd sa Reptilo-Mobile au pire moment : il en aurait bien besoin pour empêcher Roméo de bombarder la ville d'oeufs puants.

Gluglu perd sa Reptilo-Mobile au pire moment : il en aurait bien besoin pour empêcher Roméo de bombarder la ville d'oeufs puants; cependant, plutôt que d'avouer à ses amis qu'il a perdu sa voiture, Gluglu les entraîne de mauvais plan en mauvais plan.

Yoyo reçoit une trottinette en cadeau, offerte par une tante qu'il ne connaît pas. Ça sent l'entourloupe, mais Yoyo ne résiste pas à la tentation de s'en servir quand il découvre que la trottinette décolle et peut lui permettre de voler ! Hélas pour lui, c'est en réalité Sorceline qui est à l'origine de ce cadeau empoisonné...

Gluglu est pris de crises d'éternuements et ses amis lui recommandent de ne pas quitter le QG le temps de se remettre sur pieds; notre héros sort malgré tout, permettant involontairement aux Papis-nuits de s'introduire dans le repaire.

La veille de Noël, quelqu'un a volé toutes les décorations du sapin; les Pyjamasques enquêtent et découvrent que Sorceline déballe tous les cadeaux de Noël.

Les Pyjamasques découvrent que la glace a recouvert la majeure partie de la ville : tout le monde glisse et dérape. Ils se rendent vite compte qu'une fois de plus, c'est Roméo qui est responsable de toute cette pagaille...

Roméo conçoit un laser de l'espace afin de graver son visage sur la lune, et les Pyjamasques ainsi que Sorceline essaient de l'en empêcher. Entre le rayon laser, Roméo et son robot, Sorceline et ses Papi-nuits qui sèment tous la pagaille à tout-va, Gluglu se sent trop dépassé pour arriver à sauver la situation.

Roméo se sert d'une nouvelle invention pour rendre tout le monde tellement maladroit que personne ne pourra l'empêcher de régner sur la Terre entière; Yoyo est le premier à être frappé par les effets de l'invention.

Roméo a un nouveau robot, baptisé Robette, mais suite à une défaillance mécanique celle-ci décide d'aller conquérir le monde pour en devenir elle-même la maîtresse. Heureusement, Yoyo et Gluglu sont là pour l'arrêter. Malheureusement pour Bibou, ces deux derniers sont trop occupés à faire semblant d'être deux experts en arts martiaux pour penser à l'inclure dans leur jeu.

Au QG, Bibou trouve un oiseau et décide qu'il fera le parfait animal de compagnie, mais quand notre héroïne découvre qu'il n'est pas si facile de s'occuper d'un animal, l'oiseau délaissé se laisse alors convaincre par Sorceline de transformer le QG en Aimant-Lune géant.

Ninjaka se crée sa propre forteresse imprenable en empilant des cars de ramassage scolaire les uns sur les autres. Le méchant compte se servir de son nouveau QG pour annexer celui des Pyjamasques. Malheureusement pour ces derniers, Bibou est tellement épatée par la forteresse de Ninjaka qu'elle en oublie que son QG à elle est tout aussi épatant.

Alors que Roméo va frapper avec une nouvelle invention, Gluglu n'arrive pas à l'arrêter à temps; s'il veut espérer arrêter le méchant et sa machine, notre héros va devoir apprendre qu'il y a toujours plus d'une solution à un seul problème.

Roméo conçoit une télécommande lui permettant de prendre le contrôle d'un Pyjamasque à la fois, avec pour but de les forcer à l'aider à créer une super-télécommande, laquelle lui permettra de contrôler tout le monde sur Terre à la fois ! Les Pyjamasques vont devoir déjouer les plans du méchant mais, pour ça, Yoyo va devoir apprendre à suivre des idées qui ne sont pas les siennes.

Quand Ninjaka casse l'oeuvre d'art réalisée par Bibou (une statue à l'effigie de Zoé Zap), notre héroïne décide de se venger en cassant le chef-d'oeuvre du méchant : une statue géante de Ninjaka lui-même. Lorsque sa vengeance menace de détruire le musée, Bibou comprend qu'on ne doit pas guérir le mal par le mal.

Roméo a une nouvelle invention qui doit lui permettre de mettre les Pyjamasques et leur QG en lévitation, et de les chasser pour de bon au gré du vent ! N'ayant ni le pouvoir de voler, ni celui de bondir dans les airs, Gluglu se sent impuissant à arrêter le méchant...

Roméo vole les super-véhicules de nos super-héros, obligeant les Pyjamasques à le poursuivre à vélo ! Dommage que Yoyo estime qu'un vélo n'est pas digne d'un super-héros, car s'il utilisait son Yoyo Rapido pour pédaler, il pourrait bien coiffer Roméo au poteau et sauver la situation...

Tous les instruments de musique de l'école ont disparu, et Bibou et Gluglu sont sur le coup pour les récupérer. Yoyo, en revanche, n'est pas si pressé : il va d'abord falloir qu'il surmonte son trac de jouer de la musique en public s'il veut aider ses amis et accomplir sa mission !

Yoyo et Gluglu imaginent une nouvelle technique de super-héros capable de maîtriser n'importe quel méchant, mais Bibou ne parvient pas à l'exécuter. Plutôt que de reconnaître qu'elle n'y arrive pas, notre héroïne refuse carrément de s'y essayer, laissant ainsi le champ libre à Roméo et à ses manoeuvres maléfiques.

En s'introduisant en secret dans le QG des Pyjamasques, Roméo découvre que l'endroit est capable de se transformer en fusée. Nos héros ont intérêt à vite regagner leurs pénates s'ils veulent empêcher le méchant de décoller ! Hélas, Bibou se fie davantage à sa tablette tactile qu'à ses propres capacités pour arrêter Roméo, ce qui cause des ennuis à l'équipe...

Quand Ninjaka se vante auprès des Pyjamasques de préparer le coup le plus maléfique qu'un méchant ait jamais fait, Yoyo rétorque aussitôt qu'il va contrer Ninjaka à l'aide de l'action la plus spectaculaire qu'un super-héros ait jamais accomplie ! Yoyo va devoir apprendre que le panache importe peu, du moment que la mission est réussie.

Roméo parvient à répliquer les pouvoirs de Bibou pour se doter lui-même - ainsi que Gluglu et Yoyo - du pouvoir de voler ! Maintenant que tous autour d'elle en sont capables, Bibou a le sentiment d'avoir perdu ce qui faisait d'elle une personne unique. / Un défilé de chars se prépare en ville pour le carnaval, mais Ninjaka décide d'en faire sa propre 'Ninja Parade'.

Un défilé de chars se prépare en ville pour le carnaval, mais Ninjaka décide d'en faire sa propre 'Ninja Parade'. Il mène ses Ninjazouaves tambour battant - à l'aide d'un tambour volé à Yoyo - pour leur faire repeindre chars et fanions. Pour sauver le défilé, Yoyo va devoir prouver qu'il est plus à même que le méchant de mener le cortège - même sans son tambour volé...

Que fera Yoyo, lui qui n'en fait toujours qu'à sa tête, quand il se retrouvera confronté à des clones de lui-même créés par Roméo ? Face à une ribambelle de Yoyo bis qui n'en font tous qu'à leur tête, le méchant risque bien d'avoir enfin le champ libre pour conquérir le monde...

Ninjaka met les Pyjamasques au défi de remporter une partie de capture du drapeau contre lui. Si nos héros perdent, le méchant gagnera leur QG ! Lorsque Gluglu se persuade que ses super pouvoirs ne suffiront pas à gagner la partie, il s'en imagine un nouveau, lequel risquerait bien de coûter la victoire à son équipe !

Cameron prête une petite voiture à Greg, mais notre héros n'en prend pas suffisamment soin et finit par la perdre. Les choses se corsent encore quand l'objet réapparaît la nuit, entre les mains de Sorceline ! Refusant de reconnaître ses torts, Gluglu persiste dans une erreur qui pourrait bien lui coûter la victoire.

Sorceline se sert de son rayon lunaire pour créer une fleur de lune; quand celle-ci viendra à éclore, elle dispersera des graines à travers toute la ville; refusant de reconnaître son ignorance en matière de botanique, Bibou joue le jeu de Sorceline.

Gluglu va devoir apprendre à ne pas se laisser distraire pour empêcher Roméo de conquérir la Terre à l'aide d'un rayon ralentisseur qui fait aller tout le monde à la vitesse d'un escargot...

Sorceline abat un dôme géant sur le QG des Pyjamasques, emprisonnant ces derniers dans leur repaire; elle profite d'avoir le champ libre pour voler tous les objets de la fête de l'école, histoire d'être la seule à danser et à s'amuser.

Ninjaka menace de détruire la ville avec une pierre de toute puissance : si le méchant parvient à fendre en deux cet énorme rocher, il prouvera qu'il est le plus fort de tous ! Les Pyjamasques doivent contrer les plans de Ninjaka, mais malheureusement Gluglu est un peu trop occupé à essayer de broyer le rocher en premier pour prouver que c'est lui, le plus fort...

Dotés de pouvoirs particuliers grâce à leurs pyjamas spéciaux, les Pyjamasques vivent la nuit des aventures extraordinaires au lieu de dormir dans leur lit.

Ninjaka vole des avions au salon aéronautique pour prouver qu'il est le plus grand pilote de tous les temps. Bibou échoue une première fois à arrêter le méchant, un échec qui lui fait perdre confiance. Notre héroïne va devoir croire à nouveau en elle pour sauver la mise aux Pyjamasques...

Ninjaka a volé la coupe des super-champions. Il met les trois héros au défi : celui qui remportera trois épreuves pourra gagner la coupe. Yoyo veut tellement l'avoir qu'il prend tous les risques.

Sorceline vole le caillou fétiche de Gluglu et s'en sert pour rendre son Aimant-Lune encore plus puissant. Pour éviter le désastre, Gluglu va devoir apprendre à ne pas trop s'attacher aux choses.