Kirk zit achter aliens aan, die Spock's hersenen hebben gestolen.

De bemanning van de Enterprise komt terecht op Romulan gebied en wordt al snel omsingeld.

Een mysterieus buitenaards apparaat wist Kirk's geheugen, waarna hij een nieuw leven start op een andere planeet.

De Enterprise landt op een planeet waar het wetenschappelijke team zelfmoord heeft gepleegd, met uitzondering van hun kinderen, die zich vreemd gedragen.

De Enterprise heeft een buitenaardse ambassadeur aan boord die in een speciale zwarte kist vervoerd moet worden, omdat iedereen die hem ziet, gek wordt.

Kirk en zijn bemanning worden gedwongen tot een duel met de bevolking van een planeet.

Wanneer de Enterprise Klingon gevangenen aan boord neemt, hitst een buitenaards wezen beide partijen tegen elkaar op.

De Enterprise moet de koers van een asteroïde veranderen, die een planeet dreigt te raken. Al snel ontdekken ze dat dit niet zomaar een asteroïde is.

Kapitein Kirk zit vast tussen twee dimensies wanneer de Enterprise in een energie zuigend web terecht is gekomen.

Kirk en zijn bemanning zijn in de handen van aliens met een krachtige wil, die de Enterprise gebruiken voor pervers entertainment.

Onzichtbare aliens, wiens tijd sneller loopt, nemen de Enterprise over met als doel de bemanning te gebruiken om hun eigen ras te redden.

Kirk, Spock en McCoy komen in de handen van twee aliens die ze gebruiken als labratten in een bizarre reeks testen.

De Enterprise vervoert een buitenaardse prinses naar haar bruiloft, maar ze wordt verliefd op Kirk.

Kirk en Spock onderzoeken een psychiatrische inrichting waar een oud Starfleetkapitein is opgenomen.

De Enterprise bergt twee aliens van dezelfde planeet, die een intense haat voor elkaar hebben.

Kirk gaat naar een planeet voor een diplomatieke missie, maar komt terug op een Enterprise waar de bemanning is verdwenen en alleen een mysterieuze vrouw rondloopt.

Kirk, McCoy en Sulu zijn gestrand op een dorre planeet waar een mysterieuze vrouw probeert ze één voor één te vermoorden, terwijl de Enterprise het halve sterrenstelsel door moet reizen om ze te redden.

De Enterprise komt in aanraking met lichaamsloze, wolkachtige aliens die de bevolking van een planeet hebben uitgeroeid. Ze dreigen ook te moorden op de Enterprise, wanneer die hen niet van lichamen voorziet.

Kirk en Spock zijn op zoek naar een medicijn tegen een gevaarlijke koorts aan boord van de Enterprise.

Kirk moet een conflict oplossen in de wolkenstad van Stratos, om medicijnen te vergaren om een plaag te bestrijden.

Kirk en Spock ontmoeten Abraham Lincoln en Surak van Vulcan. Ze moeten in gevecht met enkele verschrikkelijke schurken uit het verleden.

Kirk, Spock en McCoy komen vast te zitten in het verleden van een andere wereld.

De Enterprise is in gevaar wanneer Janice Lester, één van Kirk's vroegere geliefden, zijn lichaam steelt.