Durante una missione per sradicare un prete vampiro e i suoi servi, Alucard è costretto a prendere una decisione difficile quando incontra una donna ferita. Più tardi Alucard incontra un misterioso guerriero del Vaticano.

Due audaci fratelli vampiri guidano una violenta incursione negli edifici dell'organizzazione Hellsing. La carneficina è grande, ma Alucard e la compagnia riescono a ottenere un'informazione chiave mentre stanno cambiando le sorti della battaglia.

L'organizzazione di Hellsing ricorre al reclutamento di mercenari sulla scia di un attacco devastante al quartier generale, vengono confermati i sospetti di Integra (direttrice dell'organizzazione Hellsing e l'attuale Master di Alucard) riguardo alle origini del loro nemico.

Un incontro importante tra Hellsing e la Regina è interrotto dalla notizia di un imminente guerra. Nel frattempo, Alucard viene inviato a trattare con i responsabili del dirottamento di una portaerei.

La formidabile unità di combattimento vaticana viene mobilitata in preparazione alla battaglia. Alucard tornato nel cuore di Londra, la Hellsing Mansion viene attaccata e i Wild Geese rappresentano l'ultima linea di difesa contro i non morti.

Quando i suoi ricordi vengono violati, Seras Victoria rimane intrappolata in un'illusione che la costringe a rivivere i momenti più terrificanti della sua vita. Al risveglio dall'incubo, il vero dolore inizia mentre la battaglia si avvicina alla sua fine.

La straziante conclusione di Hellsing Ultimate include l'epico ritorno di Alucard e la volontà di Integra di liberare il suo vero potere sui loro nemici!

Alucard si confronta con padre Anderson. Nel frattempo, il Maggiore inizia a mettere in moto le sue ultime parti del suo piano.

E ora il finale. Londra è in rovina, la crociata di Enrico ha fallito, il capitano Pip Bernadotte e Alexander Anderson sono caduti e Walter ha disertato in Millennium. Mentre inizia lo scontro tra Alucard e Walter, Seras e Integra combattono attraverso lo zeppelin Deus Ec Machina e affrontano gli ultimi soldati rimasti di Millennium. Attendendo i leader Millennium: il Maggiore e il misterioso capitano, l'uomo che Walter temeva di affrontare e che sta per rivelare la sua vera natura ...