Tras la misteriosa muerte de su tío, Alex Rider comienza una búsqueda de respuestas que lo lleva a un mundo oscuro de secretos y espionaje. Se da cuenta de que su tío no era el hombre que pensaba que era, y que se espera que Alex siga sus pasos.

Aún recuperándose de la revelación de que su tío era un espía del gobierno británico, Alex es secuestrado e interrogado por un grupo desconocido de agentes paramilitares. Se necesitarán todas sus habilidades ocultas para darle la vuelta a sus captores.

Alex se ve arrojado al mundo desconocido de los ultra ricos mientras lucha por perfeccionar su identidad encubierta, pero corre el riesgo de alienar a su mejor amigo al mantener la misión en secreto.

A medida que avanza su investigación encubierta de Point Blanc, Alex descubre que ha quedado vulnerable. El Departamento parece estar acercándose al agente doble en sus filas, pero Yassen llega primero.

Consternado al darse cuenta de que el Doctor Greif está cambiando misteriosamente a los estudiantes en Point Blanc, Alex recluta a Kyra y James en un plan para escapar. Blunt encabeza una investigación sobre Parker Roscoe.

Tom aterriza en el punto de mira de la conspiración detrás del asesinato de Ian Rider. Alex y Kyra encuentran evidencia del plan secreto del Dr. Greif.

Alex lidera un escuadrón de las Fuerzas Especiales dentro de Point Blanc en una misión sigilosa para rescatar a sus amigos y detener los planes de Greif.

El Departamento finalmente resuelve el misterio de la muerte de Ian y se da cuenta de que un viejo y letal enemigo ha resurgido. Alex se enfrenta a su propio duplicado en una batalla desesperada para salvar a las personas que ama.

Alex intenta pasar página y olvidar lo ocurrido en Point Blanc surfeando en la costa de Cornualles. Allí conoce a Sabina, pero también se reencuentra inesperadamente con un viejo enemigo.

Decidido a localizar a Blunt y advertirle sobre el regreso de Yassen, Alex, sin saberlo, se pone en curso de colisión con el Departamento, que simultáneamente está cazando a un peligroso ciber-terrorista.

Alex se niega a alejarse de su investigación sobre el ataque a Ed Pleasance. Con la ayuda de Sabina y Tom, descubre una nueva pista que lo conecta con el hackeo del Pentágono, poniéndolo en la mira de un hacker conocido como 'Smoking Mirror'.

Alex está convencido de que Damian Cray no es trigo limpio, así que decide infiltrarse en el evento de presentación del videojuego para acercarse al multimillonario magnate. Pero sus conclusiones le alejan de Sabina.

Para desvelar los secretos de "La serpiente emplumada 2", Alex busca la ayuda de un viejo aliado. Pero su propia investigación se empieza a descontrolar y Alan Blunt podría intervenir para detener esta peligrosa misión.

Alex, Tom y Kyra vuelan hasta Ámsterdam para infiltrarse en la operación de Damian Cray, mientras el Departamento se centra en el próximo encuentro de Cray con el presidente de EE. UU.

Para escapar de Ámsterdam y poder aportar pruebas al Departamento, Alex pide ayuda a Jack, pero esto pone en juego el futuro de su tutora. El presidente de EE. UU. está a punto de aterrizar en Reino Unido. ¿Será demasiado tarde para detener a Cray?

El lanzamiento de "La serpiente emplumada 2" se hace efectivo y el plan de Cray sale a la luz. Alex intenta evitar una catástrofe a contrarreloj.