Początek XVI wieku. Leonardo da Vinci zostaje oskarżony o zamordowanie swojej muzy, Caterine da Cremony. Podczas przesłuchania snuje opowieść, w której ujawnia historie stojące za swoimi kolejnymi dziełami.

Sława Leonarda rośnie. Uznanie, na które tak ciężko pracował, może jednak zniszczyć jedna ryzykowna decyzja. Artysta otrzymuje wsparcie, ale i tak musi zapłacić za swoje czyny.

Leonardo wyrusza do Mediolanu. Zamierza przyjąć ofertę księcia Ludwika Sforzy, który chce zostać jego patronem. Szybko orientuje się jednak, że praca dla regenta odbiega od jego wyobrażeń.

Książę Ludwik prosi Leonarda, by stworzył rzeźbę, która upamiętni jego ojca. Artysta podchodzi do tego zadania niezwykle ambitnie. Ostatecznie czeka go jednak wyścig z czasem i podjęcie trudnej decyzji.

Po śmierci żony Ludwika Leonardo pracuje nad nowym dziełem. Ojciec Luca Pacioli uświadamia mu, że potrzebuje wsparcia przyjaciół. Efektem eksperymentów z nową techniką jest 'Ostatnia wieczerza'.

Po powrocie do Florencji Leonardo zmaga się z brakiem weny. Zgadza się namalować portret Lisy Gherardini. W ten sposób powstaje słynna "Mona Lisa". Artysta bezskutecznie próbuje naprawić swoje relacje z Cateriną. Udaje się do Imoli na spotkanie ze swoim zleceniodawcą, Cesarem Borgią.

Leonardo, znów mając u boku Caterinę, oddaje się pracy. Jest jednak zazdrosny o sukces młodego Michelangelo, którego sława wciąż rośnie. Niebawem przyjmuje nowe zlecenie i tworzy 'Bitwę pod Anghiari'.

Stefano chce ocalić Leonarda, ale nie ma dowodów potwierdzających jego niewinność. Inspektor wie, że musi szukać pomocy. Zbliża się czas egzekucji i nadzieja na ocalenie artysty gaśnie z każdą chwilą.