近未来を迎えた。謎の武装集団、秘密結社パンサー・クローによって破壊活動が行われ、東京はパニックに陥っていた。警官隊や機動隊が追い回すものの、いろいろな場所に出没する悪党どもを捕らえるのは困難だった。

ハニー対コバルト・クローの激戦と、スカーレット・クローのたくらみによって、街のいたる所が破壊された。報道機関は「ハニーのせいで街が破壊された」と伝え、世間ではハニーに怒りの矛先を向ける者も現れる。

最愛の父・如月博士の仇討ちで、キューティーハニーはパンサー・クローと戦い続けていた。彼女の前に立ちはだかるのは、四天王最後の1人、ブラック・クロー。ハニーは満身創痍になりながらも打ち負かしたが…。