Drie jaar nadat de Bone Collector zijn carrière beëindigde, werkt rechercheur Lincoln Rhyme samen met NYPD-officier Amelia Sachs om een reeks moorden te onderzoeken die de terugkeer van de moordenaar suggereren en een onwaarschijnlijk team wordt geboren.

Lincoln en Amelia bundelen hun krachten om een moordenaar te vinden die is geïnspireerd door de Griekse mythologie en die live-stream moorden uitvoert. Ondertussen bereidt de Bone Collector een angstaanjagend cadeau voor om Lincoln's terugkeer naar het werk met zijn nieuwe partner te vieren.

Wanneer een jonge vrouw uit een insulaire Russische gemeenschap die getuige is van een moord naar Lincoln en Amelia komt voor hulp, neemt de zaak een schokkende wending wanneer de mysterieuze moord verband houdt met een koude zaak - de tragische verdwijning van een tienermeisje. Ondertussen wordt het 'geheim' van de Bone Collector ontdekt.

Een bizarre moord op een onderzoekslocatie van een universiteit duwt Amelia en Kate in de wereld van post-mortem forensisch onderzoek. Lincoln verkent nieuwe mogelijkheden met de hulp van Sellitto's vriend.

The Bone Collector daagt Lincoln, Amelia en het team uit met een trifecta van slachtoffers in New York City. Maar terwijl ons team zich haast om de clue trails op te lossen voordat het te laat is, moet Lincoln het echte doel van de Bone Collector - zijn eigen ego - onder ogen zien.

Lincoln en het team jagen op een seriemoordenaar die perfecte moorden ensceneert door op briljante wijze verdachten in te lijsten in schijnbaar open en gesloten zaken. De jacht raakt thuis wanneer een van Lincoln's beste vrienden wordt beschuldigd.

Lincoln, Amelia en het team hebben de taak om een anonieme bommenwerper op te sporen die zich richt op een reeks gebouwen in heel Manhattan. Ondertussen bereikt het huwelijk tussen The Bone Collector en zijn vrouw, Danielle, een angstaanjagend kruispunt.

Wanneer de tienerdochter van een politicus wordt ontvoerd voor losgeld, racen Lincoln, Amelia en het team tegen de klok om haar te redden voordat het ondenkbare gebeurt. Ondertussen doet het team een verrassende ontdekking: de ware identiteit van The Bone Collector...

Deel één van een tweedelige finale, de naam en het gezicht van The Bone Collector zijn overal in het nieuws. The Bone Collector blijft ons team een stap voor en voert zijn ultieme wraakplan uit door zich te richten op degenen die het dichtst bij Lincoln staan, waaronder Amelia.

In de angstaanjagende conclusie van het eerste seizoen wordt Lincoln gedwongen zijn zoon Camden te redden door zichzelf in gevaar te brengen en The Bone Collector te confronteren in een dodelijk gezicht, een op een.