Een briljante oudheidsexpert en een sluwe kunstdief werken samen om een meedogenloze terrorist te vangen die zijn aanvallen financiert via een gestolen schat.

Danny doet zich voor als wapenhandelaar Aiden Shaw om informatie over de locatie van terrorist Karim Farouk te verkrijgen van een tussenpersoon die Shaw-geld verschuldigd is. Farouk krijgt ook een idee van de locatie van de sarcofaag van Cleopatra en Lexi krijgt een band met pater Chuck wanneer ze zijn hulp zoekt om gecodeerde informatie te ontcijferen.

Een essentiële aanwijzing leidt Danny en Lexi naar een Oostenrijks kasteel waar de Duitsers tijdens de Tweede Wereldoorlog de sarcofaag van Cleopatra hebben verborgen. Fabi redt ook de ontvoerde assistent van Dr. Castillo, Max en Hardwick, en onthult informatie aan Fabi en Gwen over anderen die op zoek zijn naar Cleopatra.

Een onwaarschijnlijke bondgenoot onthult Lexi dat een Egyptische functionaris bestanden heeft die haar naar Farouk kunnen leiden. Maar om bij de informatie te komen, moet ze Danny inschakelen voor een gevaarlijk plan terwijl ze tegen hem liegt over de bron van haar voorsprong. Farouk neemt ook het risico om de voorwerpen die hij heeft gestolen terug te krijgen van de piramides, die hij nodig heeft om zijn activiteiten te financieren.

Danny en Lexi volgen een aanwijzing naar de bergen van Spanje op zoek naar een verloren treinwagon die mogelijk de sarcofaag van Cleopatra droeg toen deze verdween. Lexi kruist ook paden met antiquiteitenhandelaar Simon Hardwick, die haar nieuwe informatie over de Brotherhood of Serapis biedt.

Danny en Lexi moeten improviseren om in leven te blijven en uit de gevangenis te blijven wanneer ze vastzitten in Casablanca met zowel wetshandhavers als hun vijanden op de hielen. Bovendien brengt het persoonlijke onderzoek van Hardwick naar de Brotherhood of Serapis hem in een gevaarlijke situatie.

De FBI biedt Danny en Lexi informatie die hen zal helpen bij hun zoektocht naar Cleopatra, maar alleen als Danny zijn opgesloten vader, Patrick, zover kan krijgen dat hij de locatie opgeeft van schilderijen die hij twintig jaar eerder heeft gestolen. Farouk kampt ook met een los eind en zet een grote stap voorwaarts in zijn masterplan.

Danny en Lexi zoeken een beroemde nazi-jager wiens onderzoek hen naar Montreal leidt, waar ze vermoeden dat de laatste nazi's die met Cleopatra zijn ontsnapt, mogelijk nog in leven en ondergedoken zijn. Ook komen de spanningen tussen Gwen en Fabi tot een hoogtepunt.

Na Farouk bijna te hebben gevangen in een steekoperatie, schakelen Danny en Lexi Hardwick in om zijn onderwereldcontacten aan te boren in de hoop Farouk in de bochten te nemen voordat hij weer verdwijnt. Ook Gwen, die de tactieken van Danny en Lexi beu is, arresteert vader Chuck omdat hij hen heeft geholpen.

Het spoor van de sarcofaag van Cleopatra leidt Danny en Lexi naar de Bermudadriehoek, waar een contactpersoon van Shaw hulp biedt bij het opsporen van een smokkelaarsvliegtuig dat jaren eerder is verdwenen. Ook trekt Gwen ongewenste aandacht wanneer ze een verdachte overboeking onderzoekt.

Terwijl Hardwick Danny en Lexi helpt de Broederschap te slim af te zijn, leert Danny schokkende onthullingen die alles wat hij dacht te weten over zijn verleden kapot maakte.

Er worden geheimen prijsgegeven, het lot is bezegeld en het leven van Danny en Lexi zal nooit meer hetzelfde zijn nadat Farouks masterplan is uitgevoerd.

Als Danny en Lexi klaar zijn met het opsporen van de laatste antiquiteiten van Farouk op de zwarte markt, beginnen ze plannen te maken voor hun toekomst. Maar hun plannen ontsporen wanneer het Vaticaan wordt aangevallen door terroristen. Een persoon uit Danny's verleden keert terug en leidt hen op een nieuwe jacht om een ​​van de grootste verloren schatten van Azië terug te vinden, de Spirit Banner van Genghis Khan.

De zoektocht naar Kate Reece voert Danny en Lexi naar Vietnam, waar ze herenigd worden met niemand minder dan Aiden Shaw. Lexi's vechtkunsten worden op de proef gesteld als het team infiltreert in de gevaarlijke Black Lotus - een ondergrondse vechtclub - waar ze leren over een gemene nieuwe terrorist.

Een bezoek met Simon in de gevangenis levert nieuwe informatie op over de laatste verblijfplaats van de Spirit Banner, waardoor het team naar Rusland wordt gestuurd.

Danny en Lexi bundelen hun krachten met Levchenko's bende op hun reis naar Mongolië. Levchenko hoopt de Spirit Banner voor zichzelf te vinden, zelfs met de horde van de Grote Khan op de hielen.

Op zoek naar de Spirit Banner probeert Simon een deal te sluiten, niet wetende dat Lexi, Danny en Shaw hem op de hielen zitten. Wat ze ontdekken leidt hen naar Hong Kong, terwijl Danny zich steeds meer zorgen maakt over Violets controle over Lexi.

Met een spoor van nieuwe aanwijzingen reizen Danny, Lexi en Violet door een gevaarlijke chemische woestenij in Kazachstan naar Aralsk-7, een verlaten fabriek voor biowapens. Ondertussen begint Chuck met zijn onderzoek naar hoe het Vaticaan en de Spirit Banner met elkaar verbonden zijn.

Danny schakelt zijn vervreemde vader Patrick in bij hun zoektocht naar de Spirit Banner. Patrick leidt hen naar een geheime basis in Laos, waar hij een verrassende bekentenis doet aan Lexi over het geheim dat hij voor zijn zoon verbergt.

Na een noodlanding in de oerwouden van Laos, raakt Lexi ernstig gewond, waardoor Danny en Patrick gehaast hun toevlucht moeten zoeken. Ondertussen onthult Chuck nieuwe informatie over de relatie tussen het Vaticaan en de CIA.

Terwijl hun team de locatie van de Spirit Banner nadert, wordt Danny gedwongen partij te kiezen tussen Lexi en Kate.

De vertaling van de gevonden boekrol brengt Danny, Lexi, Kate en Violet naar de besneeuwde toendra van Mongolië, met dodelijke gevolgen.

Lexi wordt ontvoerd na een schokkende ontdekking. Shaw gebruikt een contactpersoon uit de onderwereld om hem en Danny te helpen haar locatie te ontdekken en het op te nemen tegen de onderling verbonden bende criminelen van de Khan.

De stukjes van het eindspel van de Khan vallen op hun plaats als Danny en Lexi hun meningsverschillen opzij moeten zetten om de Khan en Simon te stoppen voordat het te laat is.

Beseffend dat ze het lokaas van de Khan hebben gegrepen - en het leven van miljoenen in gevaar hebben gebracht - komen Danny en Lexi oog in oog te staan ​​met de Khan in een laatste gevecht boven Hong Kong.