W przeddzień największego kryzysu w dziejach ludzkości, kongresmenka Jennifer Brown ściera się z prezydentem. Jej dzieci, Yorick i Hero stają na emocjonalnym rozdrożu. Żadne z nich nie wie, że za chwilę ich życie zmieni się nieodwracalnie.

Po katastrofie, która unicestwia wszystkie istoty z chromosomem Y, prezydent Jennifer Brown stawia czoło kryzysowi. Yorick obawia się, że jest jedynym ocalonym. Hero próbuje naprawić swój błąd.

Jennifer i Yorick znów są razem. Agentka 355 przedstawia plan. Córka zmarłego prezydenta, Kimberly, próbuje rozgryźć tajemnicę Jennifer. Tymczasem Nora Brady wraz z córką Mack żegna się ze swoim domem.

Yorick i agentka 355 szukają dr Allison Pan w rozdartym wojną Bostonie. W Waszyngtonie Jennifer ukrywa prawdę o Yoricku przed politycznymi rywalkami.

Yorick, agentka 355 i dr Pan napotykają przeszkodę w drodze do San Francisco. Gdy poszukiwania agentki 355 nabierają tempa, Jennifer ściera się z byłą sekretarz Reginą Oliver, która przygląda się poczynaniom prezydent. Hero jest pod wrażeniem charyzmatycznej liderki, Roxanne, podczas gdy Sam i Nora próbują wywalczyć sobie miejsce w niebezpiecznej grupie.

Kimberly odkrywa sekret. Agentka 355 i Allison dochodzą do porozumienia. Yorick trafia do tajemniczego miasta, gdzie nic nie jest takie, jakie się wydaje.

Napięcia w Pentagonie sięgają zenitu. Jennifer mierzy się z nowym, zaskakującym zagrożeniem. Tymczasem Amazonki ruszają w drogę.

Gdy Amazonki docierają do Marrisville, Nora przechodzi przemianę. Yorick nawiązuje więź, a 355 mierzy się ze swoją przeszłością.