År 1327 får franciskanermunken William av Baskerville i uppdrag att utreda ett dödsfall på ett kloster. En munk har antingen fallit eller blivit knuffad från hög höjd. Med sig har William lärljungen Adso, sonen till en tysk general som har flytt undan krigets grymheter. Duon tar sig an fallet, och snart inträffar ytterligare dödsfall under oklara omständigheter.

Efter att ha blivit överfallen i biblioteket frågar Adso bibliotekarien, Broder Malachias, om en bok som avhandlar kättaren Fra Dolcino. Under tiden är Vatikanens delegation på väg mot klostret, och den lämnar död och förödelse efter sig.

Den påvliga delegationen anländer med nyheten att storinkvisitorn är på väg till klostret. Vid en undersökning av Berengers kvarlevor upptäcker William likheter med Venanzios dödsfall.

Storinkvisitorn lämnar över en dyrbar present till abboten från påven. Anna hittas skadad och medvetslös i skogen av den fattiga flickan.

Anna anländer till klostret och frågar efter sin fars brev hos Remigio. Men Remigio befinner sig vid brottsplatsen för ytterligare ett mord, och blir förhörd av storinkvisitorn.

Remigio ställs inför Bernardo Gui, som försöker få fram ett erkännande. William oroas över att Bernardo försöker blanda in Franciskanerorden i de kätterska brotten.

Adso ber om Williams hjälp för att rädda flickan från att bli bränd som häxa. Bernardo verkar obekymrad över det faktum att Malachias död inträffade trots att Remigio suttit inlåst.