Shinomiya Kaguya et Shirogane Miyuki sont à la tête du bureau des élèves de la prestigieuse académie Shûchiin. Ils ont chacun des sentiments pour l'autre, mais sont trop fiers pour l'avouer. Fujiwara Chika leur donne des billets pour aller voir un film, mais refusant de prendre l'initiative d'inviter l'autre, ils préfèrent se lancer dans une bataille psychologique pour forcer l'autre à le faire.

Shirogane Miyuki a enfin acheté un smartphone grâce au stratagème de Kaguya, mais chacun refuse de demander les coordonnées de l'autre. Ils vont aussi se battre au sujet de leur futur voyage en été, et Shirogane va donner des conseils en amour. Kaguya en apprendra-t-elle plus sur les sentiments qu'il lui porte ?

Le B.D.E. doit se débarrasser d'un magazine jugé compromettant pour l'éducation des élèves. Un tiers des élèves aurait déjà eu leur première fois et Kaguya semble en faire partie. Kaguya propose à Shirogane de vérifier s'il la connaît bien, puis elle élabore un stratagème pour faire le chemin jusqu'au lycée avec lui.

Le B.D.E. organise une fête pour accueillir des élèves français. Chika pense que se cosplayer serait une bonne idée. Les membres du B.D.E. vont aussi jouer à un jeu pour décider qui ira faire les courses pour la fête, et Shirogane vivra un grand moment de solitude le jour de la réception.

Une élève demande à Kaguya des conseils en amour, mais Chika décide de mettre son grain de sel. Shirogane tente par tous les moyens de dissimuler une de ses lacunes. Et enfin, Kaguya et Shirogane veulent profiter d'un jour de pluie pour rentrer ensemble sous un même parapluie, mais leur fierté leur permettra-t-elle d'y arriver ?

Ishigami Yû, veut quitter son poste de trésorier du B.D.E., car il se sent menacé par Kaguya. Chika a emprunté un test psychologique à la bibliothèque et veut voir comment vont répondre les autres membres du B.D.E. Et enfin, Hayasaka, essaye de convaincre Kaguya de se vernir les ongles pour paraître encore plus mignonne.

Shirogane doit donner des conseils en amour pour la deuxième, il en profite pour essayer de pousser son camarade à travailler avec lui. Ishigami se plaint des membres des clubs sportifs qui ont des petites amies, et Chika découvre comment faire rire Kaguya.

Kaguya rencontre la petite sœur de Shirogane et compte bien devenir comme une grande sœur pour elle. Kaguya et Shirogane se battent pour avoir la première place aux examens, et Ishigami se retrouve forcé de réviser pour éviter le redoublement, au péril de sa vie.

Shirogane ne peut pas rentrer chez lui en train à cause d'un typhon, Kaguya complote donc pour qu'il lui demande de le ramener en voiture. Kaguya est tombée malade, Chika propose donc de jouer à un jeu pour décider qui du B.D.E. lui rendra visite.

Kaguya et Miyuki veulent que l’autre mange la dernière part de gâteau. Un incident dans le lit de Kaguya va les brouiller, ils demandent alors conseil à des amis. Enfin, Miyuki espère passer l’été avec Shinomiya.

Ai ne demande qu'à prendre un bain, mais elle doit composer avec Kaguya et sa maîtrise hasardeuse de la technologie. Chika mange des ramen devant un connaisseur qui regrettera de l'avoir prise de haut. Miyuki se languit de Kaguya. Kaguya dévoile les dessous de sa famille.

Kaguya n'est pas autorisée à assister au feu d'artifice avec ses amis. En apprenant la nouvelle, elle enrage, mais finit par renoncer. C'est alors qu'Ai arrangera les choses à sa façon. À la fin des vacances d'été, Miyuki et Kaguya ont du mal à s'adresser la parole à cause de quelques instants… embarrassants.

Hayasaka Ai doit empêcher quiconque d'entrer dans le BDE. Shirogane doit encore donner des conseils en amour. Tout le BDE essaye un jeu créé par le club de jeux de société de Chika. Et Kaguya veut fêter l'anniversaire de Shirogane.

Kaguya fait du lèche-vitrine avec la petite sœur de Shirogane et les sœurs Fujiwara. Elle veut profiter de cette sortie pour savoir quoi offrir à Shirogane pour son anniversaire.

Shirogane propose aux membres du BDE de contempler la lune. Le BDE est ensuite dissous. Ils décident donc de ranger le local, ce qui leur rappelle de nombreux moments passés tous ensemble.

Kaguya met Hayasaka au défi de séduire Shirogane en une journée. La campagne électorale a débuté, et Shirogane craint Iino Miko, une élève modèle.

N'étant plus le président du BDE, Shirogane peut se permettre de dormir plus chaque nuit, ce qui provoque de grands changements chez lui qui ne sont pas au goût de Kaguya. Fujiwara découvre qu'il chante l'hymne du lycée en play-back et va tout faire pour lui apprendre à chanter juste.

Le jour des élections est arrivé, et Ishigami veut écraser Iino Miko. Mais celle-ci perd pied quand elle doit faire son discours devant tout le lycée. Pour empêcher qu'elle devienne la risée de l'école, Ishigami et Shirogane décident de l'aider.

Ishigami pense que les garçons qui portent des boxers sont des play-boys. Kaguya veut donc savoir quel genre de sous-vêtements Shirogane porte. Shirogane élabore un stratagème pour faire lire un manga à l'eau de rose à Kaguya, et ainsi, la pousser à se déclarer pour vivre une romance aussi belle que celle du manga.

Iino Miko trouve le comportement de Kaguya, Shirogane et Ishigami indigne de membres du BDE. Chika lui explique alors qu'elle doit savoir se mettre à la place des gens et la pousse à enfreindre le règlement.

Iino se demande si elle ne ferait pas mieux de quitter le BDE et demande conseil à son amie. Celle-ci tente alors de l'aider à comprendre toutes les situations ambiguës avec les membres du BDE. Kaguya quant à elle, essaye de ne plus faire de malaise en voyant Shirogane.

Kaguya évite toujours Shirogane, ce qui a tendance à le déprimer. Sa petite sœur s'en rend compte, mais n'ose pas lui demander ce qu'il lui arrive. Shirogane et Ishigami s'entraînent dur pour faire de la fête du sport un succès.

La performance de l'équipe des supporters est un franc succès et Ishigami est content d'y avoir participé. Il commence à s'amuser lorsqu'il croise une ancienne camarade de classe qui lui rappelle des événements qu'il aurait préféré oublier.

Le proviseur souhaite prendre les membres du BDE en photo pour une brochure, mais Kaguya ne peut pas participer, car sa famille le lui interdit. Le proviseur propose alors de prendre une photo de toute la bande avec le portable de Kaguya.

Kaguya Darkness volume 1 : Ishigami se plaint que le manga qu'il lit n'a montré aucune culotte en 50 chapitres, une honte pour une comédie romantique selon lui. Cependant, il semblerait que le chapitre fanservice qu'il désirait tant soit enfin là... Ou peut-être pas ?

Kaguya Darkness volume 2 : Alors que Miyuki et Ishigami sont en train de parler dehors, le trésorier trouve un magazine pornographique par terre. Kaguya veut le nourrir : Pour clôturer un débat entre Miyuki et Ishigami concernant la façon de cuisiner le riz frit, un concours de cuisine est organisé.

Ishigami et Shirogane partagent un amour mutuel pour un certain manga, mais leur amitié est mise à l'épreuve par le fait qu'ils peuvent ou non admettre être des otaku. Leur vie sociale survivra-t-elle ? Une adaptation spéciale de 10 minutes du chapitre 110 du manga Kaguya-sama qui sert d'aperçu pour la saison 3.

The five cast members from the student council talk under one roof. Tokyo shines romantically tonight!

Lino oublie de mettre ses écouteurs pendant qu'Ishigami est dans la même pièce, Kaguya découvre son nouveau smartphone et un bras de fer est organisé au BDE.

Shirogane et Osaragi inventent des missions pour réconcilier Iino et Ishigami, Shirogane sort avec des amis au karaoké et Kaguya tente de s'interposer quand elle se rend compte de ce qui pourrait se passer.

Nagisa pense que son petit ami la trompe, Maki explique ses sentiments et un jeu de la pièce de 10 yens est organisé au BDE.

Kaguya tente d'aider Ishigami à avoir de meilleures notes parce que ce dernier a décidé de se faire remarquer par Tsubame, et Fujiwara va passer une soirée chez Kaguya.

À la suite de son échec au karaoké, Miyuki veut s'améliorer en rap, au désespoir de ses amis, mais Chika va tenter de l'aider. Ensuite, Maki vient demander conseil au BDE concernant son histoire d'amour impossible.

Lors des rencontres parents-professeur, les élèves discutent de leur avenir, et comme Miyuki veut aller étudier à l'étranger, il doit se dépêcher de se rapprocher de Kaguya.

Ishigami accepte de participer à l'organisation du festival Hôshin, le club de journalisme fait un reportage sur ladite organisation et le président du BDE a du mal à gonfler des ballons.

Ishigami veut rendre visite à sa sœur pendant le festival du collège, et Kaguya, en pleine introspection, tente de se convaincre qu'elle doit déclarer sa flamme lors du festival Hôshin.

Shirogane se souvient de sa rencontre avec l'ancien président du BDE, et Kaguya et Ishigami participent au festival chacun de leur côté.

Les seconde A et B ont eu quelques difficultés à créer une maison hantée réaliste, Chika essaie de convaincre sa petite sœur que le président n'est pas fait pour elle, et Tsubame montre le stand de sa classe à Ishigami.

Kaguya essaie de se faire offrir un cœur, Koyasu s'interroge avec Kaguya sur la réponse à donner à Ishigami, et Shirogane invite Kaguya à faire le tour du festival.

Shirogane annonce à Kaguya qu'il a été accepté à Stanford, Tsubame veut donner une réponse à Ishigami, et l'énigme du voleur de ballons fait réfléchir.

Kaguya découvre les vraies intentions du voleur de ballons, et il est l'heure de fêter la fin de ce festival de Shûchiin.

A look back to the series from the 1st to the 3rd season.