Grazie a Kyle, Liz scopre che la sorella Rosa non è morta in un incidente, ma è stata uccisa, forse da un alieno. La giovane ricercatrice decide di restare a Roswell per cercare l'assassino di sua sorella: è intenzionata a scoprire la verità su quanto accaduto, anche se questo potrebbe coinvolgere l'amico Max.

Liz prosegue le indagini per scoprire la verità sulla morte della sorella e incontra Frederico, uno spacciatore ex fidanzato di Rosa.

Con l'aiuto di Alex, Liz e i suoi amici mettono in piedi un laboratorio in una vecchia struttura di proprieta' del governo per provare a riportare in vita Max.

Alex, Maria, Michael, Max e Isobel si recano alla riserva Navajo dove Louise ha trascorso i suoi ultimi anni di vita in cerca di risposte.

Isobel e Rosa tentano altri viaggi nella mente di Maria per mettersi in contatto con lei. Michael, nel tentativo di trovare Kyle, cerca di capire cosa ha causato la morte dei pipistrelli, e chiede aiuto ad Alex. Probabilmente il messaggio di Kyle era una richiesta di aiuto che aveva attirato i suoi sequestratori. Alex fa analizzare i campioni di sangue trovati da Liz su una pala usata da Max per scavare una buca dove mettere la spada aliena: scoprirà che Eduardo è coinvolto nella vicenda. Liz e Rosa riescono finalmente a entrare nella mente di Maria.