Après qu'une bombe a explosé dans un restaurant du Queens, l'affaire devient personnelle pour OA, qui a souvent mangé là-bas durant son enfance. Il s'infiltre incognito afin d'empêcher un autre incident.

Après le kidnapping du fils d'une célèbre bloggeuse, l'équipe doit fouiller dans ses deux millions de followers pour trouver le coupable. Kristen continue de s'habituer à la vie d'agent de terrain avec son nouveau partenaire, Stuart Scola.

Après qu'une candidate à la présidence a été la cible d'une voiture piégée, OA et Maggie doivent trouver les coupables avant qu'ils ne recommencent. Mais les premiers éléments de l'enquête poussent l'équipe à se demander si elle est visée pour ses aspirations politiques…

Dans la foulée d'une tuerie dans un nightclub, il semblerait que le FBI ait ignoré de précédentes menaces d'un groupe local de suprématistes blancs. Kristen se bat avec son engagement au bureau et sa responsabilité vis-à-vis de sa communauté.

Jim Russo, un mari aimant et père de deux enfants, est kidnappé après avoir été mêlé accidentellement à des affaires illégales aux ramifications bien plus importantes que ce qu'il imaginait. Quant à Jubal, il doit de son côté prendre une décision difficile concernant l'ensemble des membres de sa famille et leur avenir commun.

Après le meurtre d'un investisseur de Wall Street, l'équipe est menée vers un réseau interne de traders qui utilisent des méthodes non conventionnelles pour obtenir des informations. OA peine à maintenir le secret sur sa relation naissante avec Mona.

L'équipe enquête sur l'assassinat d'un membre du conseil d'une compagnie de technologie médicale sur le point d'être lancée. Elle essaie de savoir à qui profite le plus sa mort.

En enquêtant sur les circonstances d'un accident de voiture qui a coûté la vie à un photographe, l'équipe se rend compte que tout n'est pas aussi simple qu'il y paraît. Maggie sympathise avec sa veuve, Annie Weber.

Un professeur est porté disparu, et l'équipe enquête sur tous ceux qui avaient une dent contre lui.

Une ancienne victime de kidnapping est liée à une série de meurtres, qui inclut la fille d'un détective de la NYPD. Kristen doute de ses capacités d'agent après qu'un exercice l'a mise en difficulté.

Un homme d'affaires connu en tant que délinquant sexuel est assassiné, l'équipe pense que l'un de ses accusateurs est peut-être le coupable...

Un braquage de banque mène l'équipe à un coffre-fort. Ce qu'il contient a le potentiel de détruire la sécurité nationale. Kirsten est impatiente de travailler sur le terrain, alors que les autres membres de l'équipe ont encore des doutes à son sujet.

Une explosion frappe un immeuble de New York en plein après-midi, coûtant la vie à un petit garçon. Maggie et Omar sont dépêchés sur place. Alors qu'ils entament leur enquête, une deuxième bombe, encore plus dévastatrice, explose.

Lorsqu'un avocat américain est retrouvé mort à quelques pas du corps d'une escort girl, l'équipe doit connecter ces victimes apparemment sans lien. La connexion de Jubal avec une des victimes rend l'affaire bien plus personnelle...

Après le détournement d'un camion rempli de fusils à munitions perforantes, l'équipe travaille pour découvrir qui l'a volé et à quoi les armes sont destinées.

Alors que la police a ignoré ses appels à l'aide, un père désespéré enlève la fille d'un milliardaire et se barricade dans une pièce de survie sécurisée, et prévient qu'il n'en sortira que quand on lui ramènera son fils.

Jubal saisit l'occasion de tester ses compétences de négociateur...

Sur la scène d'un meurtre, l'équipe suspecte rapidement un motif politique. Lorsqu'un second meurtre est commis, les enquêteurs doivent découvrir les éléments liant les deux affaires avant que le tueur ne frappe à nouveau.

Jess LaCroix, de la Brigade des Fugitifs, s'intéresse à l'affaire d'un bus scolaire rempli d'enfants kidnappés. Il s'avère que le suspect est un suprémaciste blanc qu'il avait appréhendé quelques années plus tôt.

L'équipe du FBI enquête sur un deal de drogue qui a mal tourné après la découverte du corps d'un étudiant. La détective Hailey Upton rejoint l'équipe temporairement, et se rend vite compte que ses méthodes habituelles d'enquête ne correspondent pas à l'environnement conservateur du Bureau.

L'équipe mène une opération d'infiltration afin de s'assurer qu'une bombe ne finisse pas entre de mauvaises mains. Une course contre la montre est lancée.

L'équipe enquête sur un jeune homme en décrochage scolaire et qui semble lié aux morts d'un officier de police et du propriétaire d'un établissement de prêt sur gage.

Alors que l'équipe enquête sur un vol meurtrier qui a permis aux tueurs de se procurer une cache d'armes automatiques, ils découvrent que l'un des criminels est un camarade de classe du fils de Jubal, qui est peu enclin à coopérer.

L’équipe enquête sur une série d’assauts brutaux tandis que OA cache des informations sur l'agression qu'il a lui-même subie. Le détective Chavez du NYPD traque également les auteurs de l'attaque contre OA.

Lorsqu'un riche comptable est abattu pour avoir témoigné secrètement contre un baron de la drogue notoire, l'enquête conduit Tiffany à demander l'aide d'un ami qui était auparavant avec le NYPD.

Alors que l’équipe essaye de secourir un enfant de 5 ans kidnappé, Scola suspecte la mère du garçon de ne pas tout leur dire quant à la raison pour laquelle son enfant a été pris pour cible.

Maggie revient d'un congé de maladie à temps pour aider l'équipe à enquêter sur deux homicides : un étudiant en droit sur le point d'aller à l'Académie du FBI et un jeune homme avec de possibles liens avec un gang. De plus, une révélation par inadvertance de Maggie fait craindre à OA qu'elle ne se précipite trop rapidement dans le travail.

Lorsqu'un cambriolage meurtrier arme les tueurs avec suffisamment de nitrate d'ammonium pour construire une énorme bombe, l'équipe découvre un lien avec un groupe terroriste que Maggie s'efforce d'infiltrer.

Un adolescent se présente au siège du FBI avec un gros sac de fentanyl, demandant la protection de l'équipe contre les hommes qui ont tué son père. Par ailleurs, Nina vient voir Scola avec une proposition qu'il hésite à accepter.

L'enlèvement d'une jeune femme ramène l'équipe à une affaire classée remontant à 18 ans, ce qui pousse Isobel à renouer avec son ancien partenaire Jake Reed pour tenter à nouveau de résoudre l'une de ses premières affaires au Bureau.

L'équipe se met en action lorsque Kelly Moran, analyste du JOC, est prise en otage.

Après qu'une mystérieuse arme biologique a fait deux morts et un blessé parmi les employés du métro, l'équipe se précipite pour déterminer qui est derrière l'attaque et l'emplacement de leur prochaine cible. Par ailleurs, les démons du passé de Jubal commencent à faire surface lorsque l'affaire sous haute pression coïncide avec la dernière alerte médicale de Tyler.

L'équipe enquête sur le meurtre d'un informateur professionnel après qu'il a été retrouvé mort devant une usine désaffectée à Red Hook. De plus, Maggie renoue avec un ancien collègue et mentor.

Après une série de vols à main armée visant diverses entreprises, l'équipe enquête sur un suspect qui les mène à quelque chose de beaucoup plus grand. De plus, OA s'inquiète pour son avenir lorsque ses investissements commencent à se dégrader.

Lorsqu'un agent de sécurité diplomatique qui n'était pas en service est tué par balle à New York alors qu'il tentait d'appréhender quelqu'un, l'équipe enquête pour savoir s'il y a un lien avec son temps de travail en Croatie.

La fusillade d'un agent correctionnel fédéral conduit l'équipe à un ex-Marine qui est devenu un voyou depuis son retour d'Afghanistan. La sœur de Tiffany se tourne vers elle pour obtenir des conseils lorsque leur jeune frère commence à se déchaîner.

Pour aider Scola dans sa mission d'infiltration pour trouver les terroristes soupçonnés d'être à l'origine de l'attaque imminente à New York, Maggie fait appel à Remy , dont le bien connecté un informateur d'un cas antérieur peut être essentiel pour faire avancer l'opération. Partie 2 d'un crossover avec FBI International S02E16 et FBI : Most wanted S04E16.

Lorsque le commandant adjoint d'une base de la Garde nationale aérienne est kidnappé et contraint de donner des codes d'accès, l'équipe doit travailler rapidement pour retrouver le suspect ainsi que les munitions volées. De plus, Scola remet en question sa propre sécurité à la suite d'une récente expérience traumatisante.

Lorsqu'un camionneur est abattu après un voyage de routine depuis le Canada, tous les signes indiquent à l'équipe un criminel notoire figurant sur la liste des terroristes les plus recherchés du FBI. De plus, Jubal se retrouve a travailler avec un vieil ami et collègue, le détective Jack Lombardo.

Un trafiquant de drogue est abattu dans un parc fédéral et l'équipe part à la recherche de son assassin. La sœur de Maggie revient à New York et complique l'affaire.

Tous les yeux sont tournés vers l'équipe lorsqu'ils tentent de découvrir qui a kidnappé l'enfant unique d'un sénateur américain de premier plan. L'enlèvement révèle également un lien potentiel avec une affaire similaire qui a été mise de côté par les autorités locales.

Après avoir trouvé un groupe d'adolescents morts d'une overdose de drogue, l'équipe se précipite pour trouver le dangereux revendeur et son fournisseur. Pendant ce temps, OA se demande où il en est dans sa foi.

Lorsqu'un médecin éminent est retrouvé mort lors d'un meurtre rituel, l'équipe doit courir contre la montre pour traquer un tueur en série aux motivations religieuses. De plus, Scola fait face à une décision de vie ou de mort.