Dr. Hynek og kaptein Quinn må etterforske en sak i West Virginia hvor en kvinne og hennes to barn blir vitner til at en UFO krasjer i nærheten av gården deres, og et romvesen stiger opp fra vrakrestene.

Hynek og Quinn følger en rekke merkelige spor som leder dem til en hemmelig gruppe som ikke bare påstår at de har vært vitner til merkelige lys under et slag kalt "Foo Fighters", men også at de har en måte å kontakte dem på.

Etter at mystiske grønne ildkuler nesten forårsaker en atomkatastrofe under en våpentest, må Hynek og Quinn etterforske hvordan dette kunne skje.

Når en film som dokumenterer en tropp under et UFO-angrep dukker opp, blir Hynek og Quinn sendt for å etterforske saken. De finner ut at soldatene lider både fysisk og psykisk etter hendelsen.

Hynek blir dratt inn i et oppdrag han bokstavelig talt ikke kan komme seg unna når en mann kommer til Blue Book-hovedkvarteret sammen med konen sin. Han påstår han har blitt bortført av romvesener, og holder Hynek og Quinn som gisler helt til de finner ut av hva som skjedde.