Hynek i Quinn jadą do Roswell w Nowym Meksyku za generałem Hardingiem. Anonimowy mieszkaniec miasta grozi, że pokaże światu dowody na katastrofę UFO, która miała miejsce sześć lat temu.

Hynek i Quinn badają sprawę żołnierza, który na terenie pustynnej bazy wojskowej został uprowadzony przez UFO. Szybko orientują się, że Strefa 51 pilnie strzeże swoich tajemnic.

Podobno w domu w stanie Kentucky zjawiają się istoty pozaziemskie. Hynek i Quinn jadą sprawdzić zgłoszenie. Trafiają na MK Ultra. To tajny program CIA, według którego ten atak może być początkiem inwazji na większą skalę.

Ubrani na czarno osobnicy porywają Hynka. Quinn, wspólnie z agentami CIA, stara się uratować mu życie.

Na planie filmu "Bliskie spotkania trzeciego stopnia" Hynek wspomina swoje doświadczenia z niesławnym panelem Robertsona. Przypomina sobie też, że poznał osobę, która przeżyła spotkanie z kosmitami.

Hynek i Quinn jadą na rancho w stanie Utah. Mają za zadanie zadać sytuację młodej rodziny donoszącej o występowaniu niewytłumaczalnych, niebezpiecznych zjawisk.

Dwóm generałom skradziono bardzo ważne materiały. Hynek i Quinn zdają sobie sprawę, że niepodważalny dowód na istnienie UFO jest bliżej, niż mogli sobie wyobrazić.

Kiedy Hynek i Quinn namierzają samolot, który zaginął w Kanadzie, wyruszają na misję, aby odzyskać jego zaginiony ładunek, stanowiący zagrożenie nie tylko dla ich Projektu, ale dla całego świata.

Kiedy niezidentyfikowane obiekty latające i pływające pojawiają się w pobliżu rosyjskich wód, gdzie prowadzone są duże manewry morskie, Hynek i Quinn muszą zapobiec wybuchowi III wojny światowej.