Após a O.S.E. ser comprometida, Gregorio reativa a Academia de Espiões para treinar os filhos e outros espiões mirins para combater os planos hediondos de Cérebro Dourado.

Carmen e Juni precisam aprender a lidar com a rotina rigorosa da Academia de Espiões se não quiserem correr o risco de expulsão.

Com os planos diabólicos da S.M.A.S.H. frustrados, Cérebro Dourado encarrega o encrenqueiro DJ Otto Tune de atrair os pequenos espiões para fora da Academia.

Após descobrir os novos planos da S.M.A.S.H., dois rivais precisam deixar as diferenças de lado para evitar que a Missão Crítica caia em uma armadilha do mal.

Com a posição ameaçada por um grupo rival, os garotos da Missão Crítica precisam provar seu valor.

Os pequenos espiões descobrem que um ex-aluno de Spurious Visage é agora agente da S.M.A.S.H.

Envergonhada, Scorpion ameaça deixar a Academia de Espiões quando seu pai, o astro de TV Fegan Floop, decide trabalhar lá.

Novo Em Folha, o artista de rua preferido de P.S.I., adota o inventor como seu protegido e pede que o ajude a projetar uma nova instalação de arte industrial.

Os líderes da equipe, Carmen e Juni, terão de encarar uma prova difícil para, mais uma vez, evitar a expulsão da Academia.

Finalmente com espírito de equipe, os garotos da Missão Crítica enfrentam sua tarefa mais difícil: a destruição da base de Cérebro Dourado.

Cérebro Dourado transforma seu técnico em um vírus de computador para destruir o mainframe da Academia.

Em busca de dinheiro, Cérebro Dourado envia ao edifício do Tesouro o roqueiro Deth Metal, dono de uma voz destruidora.

Carmen é tão supersticiosa que está certa de que se amaldiçoou! Cérebro Dourado busca uma fórmula para seu agente completar uma missão.

Ace procura o cirurgião plástico Dr. Jericho quando acha que pode deixar de ser a capa de uma revista de espiões. Mas Cérebro Dourado tem outros planos para o médico.

Carmen e Scorpion precisam aprender a deixar de lado a desconfiança mútua quando uma reunião entre Cérebro Dourado e o espião é interceptada.

Após receber uma suposta mensagem de seu crush, Carmen segue para o deserto, onde uma armadilha da S.M.A.S.H. a aguarda.

Enquanto a Missão Crítica interroga os professores com um detector de mentiras de alta tecnologia, Juni vai buscar um arquivo na antiga sede da O.S.E.

A turma da Missão Crítica flagra Floop numa atitude suspeita. Agora, Juni e Scorpion têm poucas horas para provar a inocência dele.

Os Cortezes vão à Academia para a Batalha da Melhor Família de Espiões. Juni teme que seu pai revele a identidade do criador do soro Pinnoquinox!

Com o Pinnoquinox nas mãos do Cérebro Dourado, a corajosa Missão Crítica precisa invadir a sede da S.M.A.S.H. para recuperar o soro.