奏與佳織發現一名全裸少女昏倒在舊校舍五樓，這名少女不知為何呼喚著奏的名字，其他的事卻什麼也不記得，只知道自己叫“古川結”。同一時期，校內謠傳有幽靈出現，大家議論紛紛。於是天文學會只好著手找出幽靈事件的真相…。

愛理早上醒來前，夢到與奏第一次見面的回憶，在學校不禁回想起與佳織熟識的經過。不知不覺，結的個性好像跟之前大不相同，越來越可靠了。此時柔道社與空手道社發生糾紛，於是天文學會前往解決…。

在幽靈騷動中意外得到的老式相機，讓奏著迷不已。因一句“天氣這麼好，真想野餐”，讓一行人決定下午要翹課。大夥兒來到星丘溪穀，這也是奏與佳織充滿回憶的地方。佳織不小心受傷，鞋子掉進溪裡沖走了，結卻不知為何似乎大受打擊。看著奏與結努力幫自己撿鞋子的模樣，佳織心裡酸酸的…。

天文學會蹺課的行為，果然被老師斥責了一頓。在處理社團間紛爭時，天文學會意外弄壞了學生會要在文化祭使用的電腦，凪沙答應要找到代用品，大家都一頭霧水，凪沙卻一副胸有成竹的模樣。佳織發覺結總是過於擔心她，感到是否自己讓人不放心而顯得很沒自信…。

文化祭後學生們開始思考未來的出路。奏與凪沙一同前往拿取洗好的出遊照片，但是不知道為何，感覺凪沙不想那麼早回家。就在兩人回學校的路上，一台豪華轎車停在奏與凪沙面前，一位紳士走了下來，於是凪沙向奏介紹這位先生的來歷以及與自己的關係…。

天文學會成員來到佳織與奏的家，一方面趕工完成星象儀，一方面試做咖啡廳要賣的甜點。但在女子組完成第一批甜點後，結突然提出想跟佳織單獨談談的請求。幫忙完佳織後，結轉而去幫忙奏製作星象儀，兩人聊著過往時，奏問了結是否有記起了什麼？結說她想起某個重要之人的側臉…。

佳織似乎對奏跟結兩人的互動耿耿於懷，奏感受到佳織的不對勁，卻也不知道哪裡得罪了她。終於在一次兩人的獨處，佳織對奏說出了心裡的話。隔天結跟佳織約定見面的時間到了，但佳織決定不與結見面就離開了。結著急地尋找佳織，時間分秒過去，在一連串的陰錯陽差下，竟是…。

佳織發生意外後，天文學會於是分崩離析。好幾年過去了，大家都在不同的領域各自努力著。Kenny回到美國，愛理選擇研究理科，奏為了讓佳織清醒決定學醫，不過當奏認知一件現實後，頓時感受到莫大的挫折。有一天，奏與愛理接到凪沙學姐聯絡，學姐告訴他們一個黑盒子的事情…。

結為了完成使命而不斷回到過去，試圖拯救佳織免於意外而喪生。時光一再回溯，結意識到這將造成毀滅性影響，一個差錯，自己甚至可能消失。結盡自己所能去嘗試各種方法，為的是希望讓未來的奏能重拾笑容。佳織誤以為奏跟結彼此有好感，最後忍不住跟結坦白自己很喜歡奏…。

結察覺這個時間軸的奏對她的心意，明知道自己是為了救佳織而存在的，但跟著奏走遍他與佳織共同成長的地方與回憶，讓結愈想與奏有更多的相處時光，這讓她陷入極度的苦惱。佳織發生意外的時刻即將到來，結和奏觀星時，聽奏許的願望後下定了決心，結所想出的方法竟是…。

公車意外事件後，大家對有些對話或景像有似曾相識的錯覺，愛理說“既視感”也許是真實存在於其他世界的記憶。文化祭結束後，花梨來找天文學會述說她這幾日來的經歷。在未來的時空裡，奏終於等到了他所希望的結果。在過去的時空裡，奏為了能再見到她，決定好了未來的出路…。