En dødelig virus, der spreder sig med regnen, tvinger søskendeparret Simone og Rasmus til at søge tilflugt i en underjordisk bunker og tage afsked med deres forskerfar.

Efter seks år alene finder Simone og Rasmus andre overlevende. For at holde sig i live må Simone bevise sit værd over for gruppen.

Simone og de andre begiver sig til Apollons hovedkvarter i Sverige, men deres færd gennem København er brolagt med farer.

Martin og Beatrice er glødende jaloux, mens Simone og Rasmus møder en læge med forbindelse til deres far, og Jean hjemsøges af minder.

Gruppen farer vild i skoven og opdager tilfældigt et landsted. Stedets beboere inviterer dem ind for natten, og Lea bliver gode venner med en af kvinderne.

Rasmus og Beatrice kommer tættere på hinanden, da de tilbringer tid sammen alene. De andre opdager en ny bunker – og den foruroligende hemmelighed, som den gemmer på.

En gruppe bevæbnede fremmede forsøger at presse oplysninger ud af Patrick, og Rasmus begynder at gå i spåner efter en uhyggelig opdagelse.

Gruppen ankommer til Apollons hovedkvarter, hvor Simone opdager chokerende ting om virussen, sin far og Rasmus.

Gruppen er på flugt fra Apollon-soldaterne og følger et sæt koordinater til en base, hvor oprørske forskere arbejder på en vaccine mod virussen.

Martin drager med Simone ud for at skaffe hendes fars computer tilbage. På basen falder Patrick over et skjult rum fyldt med mærkelige ting.

Mens Apollon omringer basen, kæmper Simone for at finde en kur. Rasmus' hemmelighed tiltrækker Sarah, men truer med at splitte gruppen ad.

Simone, Martin og Fie forfølger Rasmus og Sarah, der bliver tættere knyttet til hinanden under flugten. Patrick gør en ny opdagelse, og Jean forsøger at trøste Lea.

Rasmus martres af skræmmende syner og tager selv hånd om sin skæbne. Sarahs helbred forværres, og Jean og Lea deler et ømt øjeblik.

Efter deres barske opdagelse skynder Martin og Patrick sig tilbage til basen. Imens pønser en sørgende overlevende på hævn.

Rasmus, der er plaget af mareridt og bange for sine nyfundne kræfter, går frivilligt i isolation på Apollon. Imens begiver Simone sig uden for muren.

Simone møder en bror og søster, som lever afsondret fra omverdenen. På Apollon overvejer Patrick og Fie deres muligheder, og Rasmus gør en frygtelig opdagelse.

Simone nægter at tage af sted, medmindre Daniel giver hende blomsterekstraktet. Sten vil afprøve Fies teori og truer Rasmus for at sikre sig, at han vil samarbejde.

Simones gruppe nærmer sig en lejr med unge overlevende. Rasmus' magtbegær går helt over gevind, og Martin forlader Apollon for at lede efter Simone.

Mens Rasmus bliver stadig svagere, beder den bekymrede Sarah Fie om hjælp. Imens påbegynder Martin og Simone, der er blevet genforenet, den lange tur tilbage til Apollon.

En overraskende opdagelse giver anledning til nyt håb, men Simone og de andre må berede sig på en farlig konfrontation, da Rasmus nærmer sig.