Auf einer Forschungsreise werden der junge Ozeanograph Pierre Arronax und seine Begleiter von dem charismatischen Kapitän Nemo gefangen genommen, der mit seinem riesigen U-Boot „Nautilus“ die Ozeane unsicher macht.

Kapitän Nemo enthüllt Pierre Arronax seine Pläne: Er will eine riesige Stadt am Ozeanboden errichten. Dadurch würden weite Teile der Erdoberfläche überschwemmt und zerstört. Arronax und seine Freunde versuchen, den wahnsinnigen Plan zu vereiteln.