ごく普通の男子高校生・柏木空の元に、ある日、エジプトに滞在中の自称“冒険家”の父親・モクレンから大きな荷物が送られてくる。荷物の中から出てきたのは、なんと手のひらサイズの小さなミイラだった！泣き虫だけど一生懸命なミイラをほっとけない空は、「ミーくん」と名付けてお世話をすることに。でもミイラってどうやって育てるの･･･？何を食べるの･･･？？包帯の中はどうなってるの･･･？？？ミイラなのにまんまるプニプニ、寂しがり屋の甘えんぼ！そんな可愛いミーくんと空の、ドタバタゆる～い日常生活が始まる！

学校から帰るとぷにぷにのミーくんの体がしおしおになっていた！友人・他月の不安をよそに、心配になった空は、ミーくんを学校に連れていくことに。しかし、クラスメイトの茂木さんに思わぬ形でミーくんが見つかってしまう。ミーくんのぬいぐるみで誤魔化そうとした空と他月だが、茂木さんが誤ってぬいぐるみのフリをした本物のミーくんを持っていってしまい…果たしてミーくんは空の元に無事に戻ることができるのだろうか？！

風邪を引いた空は、ミーくんとカエデに風邪がうつらないよう部屋に籠ってしまう。淋しさのあまり涙でしおしおになったミーくんをほっとけず、空はミーくんをそばに置くことに。しかし、今度はミーくんが風邪を引いてしまった。ぶるぶる寒そうにしているミーくんだが、何故か外に穴を掘りだし、その中に潜ってしまった！！中々出てこないミーくんに心配でたまらない空。ミーくんは果たして…？

バイト帰りの他月の前に赤い小鬼が現れた！外でプルプル震えている小鬼を、他月は仕方なく家に泊めてあげる事に。それから毎日家にやってくる小鬼を渋々家に居候させることになった他月は、ミーくんと小鬼を会わせる為に空の家に連れてきた。最初は警戒していたミーくんと小鬼だが、すっかり仲良しに。楽しそうに遊ぶミーくんと小鬼を見た空は、他月に小鬼の名前を付けるように勧めるのだが…？

空のクラスメイトの茂木が家に帰ると、目の前にはオレンジ色の大きなトカゲ！？の姿が…トカゲが苦手な茂木は大パニック！！驚きのあまり家を飛び出し、買い物帰りに通りかかった空にぶつかってしまう。慌てて空に助けを求めたものの、部屋の中は茂木のパニックで大惨事に。しかし、そこにいたのはトカゲではなくドラゴンで…？！

ミーくんたちのことは、みんなには内緒。そうわかってても、ペットの話で盛り上がるクラスメイトの姿を前に思わずいさおの話をしてしまいそうになる茂木。そんな茂木の気持ちを汲んだ空は、日曜日に他月と茂木を家に招くことに。いさおが文字を覚えたんだ！と得意げに語る茂木に、驚く空と他月。今度はミーくんとコニーがいさおから文字を教わるのだが…！？

ある日のお昼休み。屋上へ向かっていた空は出会い頭に見知らぬ男子生徒にぶつかってしまった。そのまま倒れて寝入ってしまった男子生徒を保健室に連れていくが、なぜか入室を断られてしまう。仕方なく屋上まで連れてきたものの、どうやら悪夢にうなされている様子で…

とある知り合いにミーくんたちを預かってもらうことにする。そこでミーくんがひとりだけはぐれてしまって…！？小さな冒険が始まる！

他月の元に妹の月夜が泣きついてくる。なんでも、空が作ってくれたケーキを、度々コニーに食べられてしまっていると話す。そんなコニーを他月が厳しく怒るのだが、当のコニーは知らんぷり。だが、翌朝他月が目を覚ますと、いつもいるはずのコニーの姿がなく…

空の元に、再び父親から何かが送られてきた！カエデの置手紙には“普通の置物”だと書かれているが、ふと荷物に目をやるとガタガタと激しく動き出し、中からはうめき声が聞こえてきて…！？

クラスメイトの鈴木から見せられた画像は、普通の犬…ではなく、ケガをした子供の犬神だった。そんな犬神を心配した空たちは、バチ山まで探しに行くことに。その日は夏至。そんな山に入り込んだ空たちを待ち受けるのは…！？

ミーくんが何者かに連れ去られてしまった…！動揺する空に、他月が、モギちゃんが、立秋が、みんなで力を合わせてミーくんを助け出す！