Das Leben und die Harmonie auf Dinotopia sind gefährdet, als die Energiequelle der Insel, die legendären Sonnensteine, die die Insel vor Schaden schützen, versiegen. Plötzlich liegt das Schicksal von Dinotopia in den Händen von David und Karl … Doch die beiden Brüder sind sich nicht einig: Während Karl so schnell wie möglich von der Insel fort möchte, gefällt David diese Welt. Bei einem Streit von David und Karl stürzen beide über einen riesigen Wasserfall in den Fluss und werden abgetrieben. Marion und Zippo suchen sie im Urwald, wo sie sie schließlich mit Hilfe eines ‚Botenvogels‘ finden. Auf ihrem Weg zurück entdeckt die Truppe zufällig einen zerfallenen Tempel. Hier befindet sich der Eingang zu ‚Die Welt im Inneren‘, ein sagenumworbener Ort, der den Dinosauriern im Anbeginn der Zeiten Unterschlupf bot und der das Geheimnis der Dinotopia-Zivilisation birgt. Doch der Platz vor dem Eingang wird von gefährlichen Riesenkrokodilen bewacht, denen die Truppe knapp entkommt. (Text: RTL)

Karl, David, Marion und Zippo gelangen zur Viddaba-Farm. Hier herrscht Marions Mutter Rosemary mit strenger Hand und Disziplin. Nach einer aufregenden Zeremonie wird Karl zur Arbeit in die Brutstätte abgeordert. Der kleine Babydinosaurier 26 wird ihm als Lebenspartner zugewiesen. David hingegen wird nach Canyon City geschickt, das hoch auf einer Schwindel erregenden Klippe gebaut ist. Hier leben Tausende von Flugsauriern, und David soll zum Saurierpiloten ausgebildet werden. Marion wird auch nach Canyon City geschickt, um dort eine Gruppe Pteranodons zu studieren, die immer aggressiver werden. Nur knapp kann sie einem Angriff entkommen. Mittlerweile erlöschen nach und nach die Sonnensteine, die das Gleichgewicht der Insel aufrecht erhalten und sie mit Energie versorgen. Während Cyruss Crabb versucht, einen Weg in die ‚Welt im Inneren‘ zu finden, versucht Karl immer noch vergeblich einen Weg zu finden, um von der Insel zu fliehen. (Text: RTL)

Die Welt von Dinotopia ist im Ungleichgewicht. Die Sonnensteine erlöschen, und dadurch werden die Fleisch fressenden Dinosaurier immer aggressiver und greifen die Menschen an. Immer mehr Flüchtlinge aus den Provinzen kommen nach Waterfall-City. Karl, David und Marion machen sich auf, den Eingang zur ‚Welt im Inneren‘ zu finden, wo sich der Legende nach große Vorräte von Sonnensteinen befinden sollen. (Text: RTL)