Peter zostaje przyjęty do Horizon High: szkoły dla geniuszy, w której jego najlepszy przyjaciel Harry Osborn został właśnie zawieszony. Parker debiutuje jako Spider-Man i musi stawić czoła Vulture’owi.

Spider-Man musi powstrzymać Scorpiona siejącego spustoszenie w muzeum.

Norman Osborn tworzy Akademię Osborna dla geniuszy, jako sposób na uratowanie swojego syna Harry'ego przed zakłopotaniem związanym z zawieszeniem w Horizon High.

Spider-Man musi powstrzymać szał kradzieży Black Cat, jednocześnie dotrzymując swoich szkolnych obowiązków.

Horizon High urządza imprezę na cześć uniewinnienia Harry'ego, ale Norman prosi Harry'ego, o pozostanie w Akademii Oz.

Spider-Man spotyka potężnego, ale niekontrolowanego Sandmana i pomaga mu spotkać się z córką, z którą nie ma kontaktu, za pomocą symbionta Venoma.

Gdy Spider-Man używa swojego czarnego kostiumu, odkrywa, że jego nowa moc kryje w sobie wielkie niebezpieczeństwo. Musi więc znaleźć sposób na pokonanie kostiumu, który chce go zniszczyć.

Po terrorze wywołanym przez symbionta, Spidey udaje się na Stark Expo w swoim starym kostiumie. Kiedy Ghost przejmuje kontrolę nad wydarzeniem, jedyną szansą na uratowanie życia Spider-Mana jest uwolnienie symbionta.

Kiedy Miles Morales zostaje ugryziony przez eksperymentalnego pająka i staje się Kid Arachnidem. Spidey uczy Milesa odpowiedzialności w byciu superbohaterem, zanim ten narazi się na niebezpieczeństwo.

Kraven Łowca prowadzi transmisję na żywo ze swojego polowania na Spider-Mana. Spidey i Kid Arachnid muszą pokonać złoczyńcę, zanim ten schwyta i dostarczy ich obu Normanowi Osbornowi.

W Halloween Spider-Man musi połączyć siły z niesamowitym Hulkiem, aby powstrzymać Man-Wolfa, supersilnego wilkołaka napędzanego promieniami gamma, przed zarażeniem reszty Manhattanu.

Spidey musi powstrzymać złoczyńcę niskich lotów, który zdobył imponującą technologię zamrażania.

Symbiont uciekł z kompleksu Avengersów i przyczepił się do nowego żywiciela. Teraz Spidey musi dowiedzieć się, jak go pokonać i kim jest ta nowa osoba.

Spider-Man staje się celem nowej postaci w kostiumie o nazwie Screwball, której specjalnością jest robienie kawałów, nagrywanie ich i udostępnianie w internecie. Uniemożliwia to Peterowi walkę z przestępczością.

Kiedy Otto Octavius przeżywa eksplozję, która łączy robotyczne ramiona z jego ciałem, Spider-Man widzi okazję do zrekrutowania „Octopusa”.

Spidey zaprasza Octopusa do patrolowania ulic wraz z Kid Arachnidem i nim samym, dopóki nie staje się jasne, że Otto nie jest zbyt dobrym graczem zespołowym.

Peter spędza dzień w Akademii Oz w nadziei na znalezienie wskazówki, która przekonałaby Harry'ego, że jego tata zamierza zniszczyć Spider-Mana.

Spider-Man śledzi nowego złoczyńcę o pajęczych mocach, który kradnie jego eksperymentalny kombinezon maskujący i zagraża całemu miastu.

Wszyscy na Manhattanie wykazują pajęcze moce. Spider-Man i Spider-Gwen muszą pomóc Czarnej Wdowie wyśledzić Crossbonesa, zanim ten dostarczy vibranium Arnimowi Zoli i Hydrze.

Peter musi znaleźć sposób na wyleczenie Gwen Stacy i Normana Osborna, którzy zamienili się w Spider-potwory. Sprawy przybierają jeszcze trudniejszy obrót, gdy Kraven Łowca zamienia Nowy Jork w swoje tereny łowieckie.

Peter i Harry muszą przedrzeć się przez wyspę pajęczych potworów, aby dostać się do Normana Osborna, który wydaje się kontrolować je wszystkie. Chłopcy odkrywają, kto za tym wszystkim stoi.

Aby wyleczyć populację Spider-potworów na Manhattanie, Spider-Man musi poprowadzić Kid Arachnida, Anyę i Harry'ego w desperackiej ostatniej próbie powstrzymania Jackala.

Spider-Man zmierzy się z Doc Ockiem i jego Podstępną Piątką, nim oni zdołają zrobić mu pranie mózgu i zniszczyć Nowy Jork.

Spider-Man musi znaleźć sposób na powstrzymanie Hobgoblina, który chce go zniszczyć za wszelką cenę.