Le Dr Shaun Murphy doit faire face aux préjugés lorsqu'il aborde le cas d'un patient atteint d'autisme, et le Dr Jared Kalu doit apprendre à accepter ses limites en tant que chirurgien.

Le docteur Glassman tente de minimiser les effets néfastes de la chimiothérapie sur son organisme en présence de Shaun. Une patiente atteinte d'autisme souffre d'une maladie cérébrale. Les médecins vont devoir gérer, simultanément, la relation complexe qu'elle entretient avec son colocataire, lui aussi atteint de TSA (Trouble du Spectre de l'Autisme). Léa ayant un nouveau copain, la cohabitation avec Shaun devient compliquée...

Avec plusieurs candidats en lice à la résidence de Saint-Bonaventure, la Docteure Audrey Lim, cheffe du pôle de chirurgie, charge les Docteurs Shaun Murphy, Claire Browne et Alex Park d'encadrer les six meilleurs candidats résidents de première année et d'en retenir uniquement quatre. Alors que leurs internes de première année les suivent pour la journée, Shaun et Park rencontrent Andrews afin de discuter d'une opération difficile, prévue chez une patiente mineure. Plus tard, Shaun critique Lea en public, par inadvertance, plutôt persuadé d'être en train de la complimenter, tout en discutant des avantages et des inconvénients de la chirurgie controversée. Ailleurs, la Docteure Morgan Reznick demande l'aide de Claire et Lim pour une consultation.

Shaun demande à Sélène de retirer l’immense affiche sur la façade de l’hôpital où il figure en tant que « autiste et chirurgien ». Elle lui explique qu’elle la voit comme une source d’inspiration et lui propose de réfléchir rationnellement et non émotionnellement à cette demande. Une jeune patiente, Holly, arrive à l'hôpital. Son père, Walt, consacre tout son temps libre à chercher un diagnostic pour sa fille depuis 4 ans, face à l'échec de nombreux médecins. Il est persuadé qu’il s’agit d’une myopathie viscérale.

Le tournage du reportage de Sophie débute... Chacun des intervenants doit s’adapter à la présence de la caméra et hésite entre sincérité et mise en scène. Sophie creuse l’histoire de la relation entre Shaun et Léa, provoquant quelques réactions de défense. Shaun et Park doivent passer le test qui validera la fin de leur internat et leur passage au stade de médecin titulaire : gérer seuls de A à Z le cas d’un patient arrivé aux urgences. Assisté de Jordan, Shaun soigne Dana, une femme gravement brûlée. Le stress causé par le tournage lui fait faire une erreur, qu’il va bien sûr réparer. Léa reproche à Sophie d’instrumentaliser Shaun et lui demande à de couper tout ce qui a trait à cette erreur pour éviter que les spectateurs se focalisent là-dessus, mais Shaun finit par l’autoriser à diffuser les images car personne n’est infaillible, même pas le grand chirurgien qu’il est devenu malgré son autisme, et il est convaincu qu’il reste une source d’inspiration malgré cette erreur...