Con Sakura secuestrada por Shin Uchiha, Sasuke y Naruto deben descubrir primero quién es y qué busca, lo que los llevará a ir a hablar con Orochimaru. Mientras tanto, Sarada se prepara para descubrir la verdad sobre su madre.

Llega a visitar Konoha el daimyo del País del Fuego, y con él llega su hijo, un niño rico mimado obsesionado con el Gemaki que no parece tener en cuenta que el dinero es lo único que tiene, pero que solicitará a Boruto como guardaespaldas.

Todos los rastros de Naruto, que es el jefe de la aldea, han desaparecido. Además, parece haber desaparecido junto al enemigo que también había aparecido de repente. Con una situación tan terrible que se desarrolla, el asesor del Hokage, Shikamaru, trae a algunos de sus subordinados para visitar la residencia Uzumaki. Dado que Shikamaru no puede descartar que exista alguna posibilidad potencial de que Kawaki sea un espía de 'Kara', y parecía sospechoso que Kawaki hubiera estado justo al lado de Naruto en el momento de su desaparición, decide interrogar a Kawaki por un mientras y colocarlo bajo arresto domiciliario dentro de una barrera. Sin embargo, Boruto y Kawaki hablan con franqueza sobre la situación actual: se sienten ofendidos por la actitud de Shikamaru y se niegan a cumplir sus órdenes. ¡¿En ese momento, Kawaki puede sentir algo de chakra que se conecta con Naruto desde la mano protésica sobrante ?!

Isshiki se prepara para atacar Konoha y en la aldea intentan evacuar a todo el mundo. Naruto y Sasuke liderarán el ataque, pero Boruto no quiere quedarse fuera.