平时训练刻苦的梅塔尔本该有不错的表现，但他一紧张就会出错的毛病限制了自己的实力，在进行岩像修补工作时还毁掉了火影岩像一半的脸。鹿台指责了梅塔尔后立马意识到自己错了，但他想要找梅塔尔道歉时却遭到了攻击，博人看到梅塔尔身上的气息与当时暴走的电气一样，到底是什么力量在扰乱梅塔尔的心智？

博人整理了所有与黑影有关的事件，他很疑惑为什么只有他能看到这股力量，在一个奇怪的梦中他了解到自己的眼睛里蕴含着力量。博人眼睛的特性让他不自觉联想到了自己的母亲，他认为自己觉醒了白眼的力量，但白眼需要大量的修炼才能开眼，因此鸣人并不赞同他的说法。为了证明自己的力量博人决定去找外公一问究竟。

最近一连串的事件牵扯出了根的残党，佐井在秘密研究所找到了线索。与此同时，早已清楚真正犯人是谁的巳月向博人透漏了消息，但博人却怎么也不愿相信，因为操纵暗影的竟然是他们的班长堇。在遭到佐井抓捕时堇召唤出了鵺，狂暴的鵺势必会给村子带来灾难性的打击，巳月接到的任务是杀掉堇从而停止鵺的活动，面对这种局面博人又会做出怎样的选择？

任务中的佐助遭到了袭击，而袭击他的少年竟然有着写轮眼。收到佐助的讯息后鸣人知道这次事件的严重性，他和佐助约定了见面的地点后立即出发，碰巧听到的佐良娜打算跟过去。佐良娜和悲剧女主综合症发作的蝶蝶一起追赶鸣人，在途中她们遭到了攻击，袭击她们的正是佐助遇到过的写轮眼少年。

博人仅用一天所达到的螺旋丸程度俨然显得奇怪，佐助虽并未直接戳穿博人，也勉强收博人为徒。而中忍考试在即，其他各班的下忍也抓紧时间训练修行，各自都拿到中忍考试推荐表。刚离开辉夜遗迹的大筒木桃式和金式获知查克拉果实部分被分散于九只尾兽当中，两人跟浦式会合后莅临地球。三人首先打败且“收回”体内藏有八尾牛鬼的奇拉比，桃式吸走他的八尾查克拉后准备前去木叶村。身在风之国的一尾守鹤感知到突然“中断联系”的八尾似乎有危险，因此将消息告知我爱罗。

两名中忍护卫深夜遭到袭击而负伤陷入昏迷，博人和佐良娜隔天发现巳月未及时会合，随后在火影室旁边偷听到昨晚发生的袭击，知晓巳月失踪的事情。但在医务室查看受伤中忍记忆的井野，却看到巳月自行离开木叶村的情景。鸣人向在场的人解释巳月实为大蛇丸的儿子，令回村子的纲手和木叶丸等村子高层大为吃惊。佐良娜和博人因为立场不同而产生些许争执，鹿太也告知博人自行出入木叶村有可能被视为叛逃。在村子周边游走的博人发现一条小蛇，巳月称其为“自己的意志”。但博人相信巳月，并与佐良娜一同坚定地希望知晓巳月的意志，两人冒着违令处分的危险离开村子，前去大蛇丸的研究所。

博人急切想见到巳月而不顾一切地跟黑曜对打，但黑曜仅靠一对旋棍和强大体术将博人三人逼入绝境。鹿太于是转移黑曜注意力，先击败一只芥，但黑曜迅速反击而再度占上风。写轮眼都跟不上黑曜速度的佐良娜无力反击，而小蝶和井野新及时回来支援，而猪鹿蝶三人联合对抗黑曜过程中，博人和佐良娜继续追踪巳月。石英使用起爆黏土拦截他们，博人见不占优势而通灵出辛牙，但辛牙不肯服从命令。直到博人精疲力竭、石英准备终结战斗时，辛牙才及时相助并逆转战局。石英的身体突然出现不适，博人刚要用苦无攻击时，巳月现身制止博人攻击，随后“自愿”与石英为伍。博人拿出巳月的护额希望能劝回他，但巳月一手打掉护额、甚至用“雷遁·雷蛇”击伤博人，最后与黑曜和石英一同离开。

负伤的空逃至内部准备接受治疗，博人和佐良娜前去追击，但云母面临身体瓦解但依然召唤出巨大的石头人阻截他们。博人情急之下召唤出辛牙与之对抗，佐良娜找准时机用雷遁·雷球将其击败，辛牙将巨人粉碎，让云母被碎石砸死。石英痛斥巳月一直以来欺骗他的友情，但巳月表示自己并不想伤害他，加入他们阵营仅是是想了解空的行动是否会危害到木叶安全，如今随着空误入歧途，才使自己找到正确的方向。石英以博人为要挟来强迫巳月与其战斗，巳月虽不得以但仍然打败石英，称自己的雷遁能克制他的爆遁；临终之际，石英承认他们俩“并不合拍”，还未来得及跟巳月再次对拳就全身瓦解死去。走投无路的空杀死完善他身体状况的博士，挖出他的心脏为己所用。

博人和佐良娜在山洞深处遇到咒印化的重吾，木叶丸和巳月的及时赶到避免博人两人的危险。联手出击的四人让木叶丸有机会给予重吾最后一击，但木叶丸也因此消耗大量体力。两班汇聚后一同追赶着逃离的重吾，却无法察觉背后的隐情。重吾能够使用自身的能力吸收鸟的咒印化，执行任务的第七班与鸟坂先生一起便待在重吾周围，救助木叶雁的同时也避免重吾的再次暴走。第十五班准备回村汇报的路上，却遭遇两名可以使用特殊颈圈来让自身咒印化的不明忍者。

卡卡西、凯、未来以及途中遇到的小巽四人前往另一个城镇秘汤进行温泉之旅，然而他们抵达小镇后，却发现深山落下的巨大岩石将温泉压住。村民已经尽其所能除去细小的砂石，但对此无济于事。未来想尝试推开巨石，却无奈自己对并不能做到什么。卡卡西找来碰巧在附近执行任务的丁次，丁次因为无法吃到美味的薯片而缺少足够的力气移开大岩石。未来遂和小巽使用汤之国的土豆为丁次炸了很多薯片，获得足够热量和查克拉的丁次也有力气去挑战大岩石了。丁次使用超倍化之术竭力推动着岩石，在未来等人和村民的帮助下成功推开大岩石。

木叶丸和博人没能等到朝木，便主动去寻找她报告情况。负责调查的两人看到外出的柑橘，木叶丸对其进行跟踪却被发现，柑橘还要求对木叶村提出抗议。博人看到外出的朝木，朝木却对他不加理睬，并跟着柑橘前往祠堂里。博人私自跟去见到正打算毁坏发簪的柑橘和摔倒在地上的朝木婆婆。被发现后，博人和朝木相继被柑橘击中，失去一段记忆，带着发簪逃走的博人在崖边失足落水。木叶丸回到村中接受火影暂时对其禁足的处罚，并接受宵村的一切指控。柑橘决定提前举办婚礼，也将此事告知了柠檬。博人回家翌日与佐良娜、巳月一起去吃汉堡，咬下超酸柠檬汉堡的瞬间想起柠檬，却不认识她；回家路上碰到小蝶的博人，再次想起抱着柠檬飞跃的木叶丸，依然想不起来对方是谁；直到遇见那天的发卡，才逐渐回忆起发生的这一切。木叶丸也找到可能有效的解决方法，来帮助村民击败走马。博人找到木叶丸后，两人一同前往橙村拯救柠檬。

新希及时抵达火之国边境，将守鹤交到佐井手里，但另一头的博人刚被浦式擒获，最后发现茶釜空无一物而中计。博人因此命悬一线，新希即时折返救下博人，两人随后遭遇焦灼却难胜的战斗，直到博人意外开启净眼，能够看到浦式进出时空间的情况，于是每次都能很好地做出准备，在他与新希的合力之下，对浦式造成一定的伤害，但两人已经体力不支。正当浦式即将发动致命一击时，佐助及时从异空间逃回来，见情况不妙的浦式，双眼突然变成蓝色轮回眼，随后立刻逃跑而消失无踪。博人和新希以及手鞠和勘九郎都平安无事，我爱罗苏醒后迅速赶往木叶汇报情况。返家的新希经过此战对博人产生不同的看法，也认识到羁绊的重要性。

博人和佐助回到过去的木叶，推断浦式其实准备穿越到鸣人小时候去获取九尾查克拉，该文物自我介绍叫作“唐锄”，是浦式专属的时间移动宝具，以及回到过去需要的注意事项，最后告知他们浦式将在几天后莅临。唐锄因缺失查克拉而停机，佐助和博人乔装打扮成卖艺人士寻找当时的鸣人。话音刚落，两人撞见刚刚偷窥浴室而被人追赶的自来也和鸣人，目睹他们被当时的五代火影纲手教训。纲手称不久前有“一名下忍”叛逃出村，村子处于部分警戒状态，因而安排鸣人和自来也负责监视新来的两位陌生人。佐助随后单独离开在远处保护鸣人，鸣人由于担心被纲手骂，只能拉着博人回家一起住。博人仅能隐瞒身份，跟当时无依无靠的父亲鸣人相处。

博人和木叶丸逃出浮囚城后遭到大量暴民追赶，跟佐良娜和麦野会合后只能兵分两路，试图寻找出路以及追寻被抢走的细胞样本。然而一行人的身份已被默之国的所有人获悉，即使博人灵机一动驾驶飞艇从空中离开，但即将出城之际还是被暴民击落。被包围的四人得到先前遇过的小偷片原协助，躲入错综复杂的下水道，在他的躲藏处跟赶来的巳月碰面，得知片原的妹妹古奈刚好是结比奈诊所中受巳月抗体救治而康复的少女。片原联络在外的同伴找出强盗三人的已知位置后协助众人出城，一行人分头寻找强盗踪迹时，博人、佐良娜和巳月追寻过程中遭到三名云忍拦截。另一边，迪帕同样抵达默之国开始行动。