宇宙彼端的“小行星库玛利亚”爆炸了，之后地球上的“熊”不知为何一同暴起并开始袭击人类，人类和熊之间筑起了巨大的“断绝之壁”进入互相不可侵犯的状态。岚丘学园的学生椿辉红羽和泉乃纯花两人单独在花坛看着盛开的百合花，既是“朋友”又是“恋人”的两人互相注视着对方。此时“熊警报”响起，熊侵入了人类的世界，人类遭到了袭击。侵入人类世界的熊究竟是……？

银子和露露试图接近红羽，甚至闯到了她的家中。银子以强硬的态度逼近红羽，但被拿着枪的蜜子阻止了。蜜子担心着红羽的事情，但百合川木乃美却对此感到了嫉妒，她的心中开始燃起邪念。与此同时，红羽再一次被神秘的电话叫了出去。红羽在与熊对峙之时昏倒，而蜜子正潜藏在那里。对于红羽如此执着的她究竟有什么目的？

为了从熊手下保命，女学生们被告知了朋友是很重要的。重视群体，将不识时务的人视作恶的“排除的仪式”在学园内召开。主持人·鬼山江梨子宣布红羽被选为了应被排除的人。面对这样的结果，蜜子在暗中窃笑。她将红羽叫了出来，并显露出邪恶的本性。枪声与尖叫声响彻屋顶。

王国中的爱都被弟弟米伦王子夺走了，“露露公主”因此对米伦感到憎恨。她对于为了自己而去寻找“约定之吻”、将蜂蜜的壶交给自己并说“这就是”的米伦采取冷淡的态度。此时发生了意想不到的悲剧，露露公主被空虚感所包围。在深深的后悔当中，她与银子相遇了，并且获得了光芒。这就是两人动身前往人类世界之前的故事。

为了和红羽成为朋友，银子和露露强行要求同居。虽然做了喜欢的料理来招待她，但还是很难融洽相处。另一方面，在学园中，针岛薰对红羽表现出关心的态度。她提出把被“透明风暴”破坏的百合花坛恢复原状，想要在花坛庆祝红羽的生日，并说这也是纯花所希望的。银子和露露对针岛进行了调查，但……

红羽在与纯花初次相见时所展现出的那份温柔。纯花想要在透明风暴中保护红羽的那份决心。不放弃喜欢的话，即使失去了什么也不会变得透明。在红羽回想起种种回忆的同时，针岛薰等人在学园为红羽举办的生日会就要开始了。银子也为了向红羽表示自己的喜欢之情，拖着伤痕累累的身体全力跑向百合花坛。

澪爱所画的绘本，是幼时的红羽和最喜欢的那个女孩的故事。但红羽却对此没有记忆。对此感到介怀的她，听到因高烧而在疗养中的银子嘴里哼唱的“喜欢之歌”，不禁为之一惊。银子就是那个自己以前最珍视的朋友……？另一方面，一直在旁边看护着的露露发现了一封收件人写着“罪熊收”的信，她为其中所写的银子的罪感到惊愕。

红羽知道了“那个女孩”就是银子这一事实。但百合香却告诉红羽至今为止所有事件的元凶就是银子，并说要将银子排除。百合香究竟有什么企图？终于，与银子展开对峙的红羽发问了。你是什么人？在猛烈的雷鸣当中，被告知了真相的红羽将会……。

所谓的喜欢，即是与对方合为一体，即是吞噬对方。失去了喜欢之情，如同空箱一般活着的百合香，心中怀着与澪爱之间未能完成的思念逼近红羽。即使破灭也要实现喜欢之情的人们。如疯狂般喜欢的欲望，虽然无法说是正确，却是切实的思念。诉说着喜欢欲望的蜜子也出现在银子的身边。银子和红羽的喜欢之情将去向何方？

为了将潜伏在学园内的熊抓出来，大木蝶子率领的猎熊队准备了秘密兵器。露露感觉到自身的危险，但她想要让红羽和银子的关系变好而奔走。熊变成人的样子所要进行的契约是？蝶子与猎熊队的秘密兵器对露露和红羽穷追不舍。我们，已经成为朋友了吧？面对露露的问题，红羽……。

蝶子开始了将被捉住的银子排除的仪式，并且说包庇熊的人也是同罪，要一并排除掉。我是为了吃掉你才来到人类的世界，是孤身一人的银子！人类的敌人！凝视着大声咆哮的银子，红羽已经明白了一切。红羽下定决心仰望天空，裁决的时刻终于来了。