Karolina, Chase et Janet sont maintenus dans l'Algorithme, retenus par Jonah, dans le corps de Victor Stein, la Mère dans celui de Stacey Yorkes et la Fille dans celui de Tina Minoru.

Chase et Janet parviennent, à la manière d'un rêve conscient, à manipuler l'Algorithme de l'intérieur et se ménager une sortie. Alex et Nico se cachent de Jonah pour mettre la main sur l'Abstract, mais Nico craint de perdre le contrôle de sa magie. Molly et Xavin suivent Tina, possédée par la Fille, chargée de préparer le voyage retour des Gibborim.

La méfiance générale règne chez les jeunes qui cherchent le traître caché parmi eux. Accablée par la méfiance de Xavin à son égard et effrayée par ses visions récurrentes, Nico affronte la chose qui lui fait le plus peur : son pouvoir obscur.

Le fils du Magistrat a envahi le corps d'Alex. Leslie commence à accoucher sans le savoir. Xavin explique à quel point le fils est dangereux et les jeunes décident de l'arrêter. Avec l'aide de Tamar, Leslie accouche et la prophétie de Xavin s'accomplit de manière surprenante.

Les enfants se retrouvent dans une dimension alternative pleine de visions de leur passé. Ils doivent retrouver leurs parents et Alex avant la fin du temps imparti. Une personne est laissée derrière.

Après avoir brisé l'envoûtement de Molly, les jeunes Runaways tentent de faire savoir que les téléphones sont dangereux, mais Morgan les en empêchent. Nico fait sortir Tina de la prison où Morgan la retenait pour aller affronter cette dernière.

Tyrone et Tandy acceptent d'aider Nico à libérer Alex, mais ils doivent d'abord sauver Karolina, Chase et Gert des griffes de Morgan. Après que Ty les a emmenés dans la Dimension Noire, la bande infiltre la prison d'Alex avec l'aide de Quinton le Magnifique.

Morgan prévoie de fusionner les dimensions et les membres survivants du Cercle sauvent Molly, qui a été envoûtée, et rejoignent les autres jeunes. Les enfants et les parents unissent leurs forces pour empêcher Morgan de prendre le pouvoir. Dans la bataille, Morgan pousse jusqu'à ses limites la noirceur de Nico...

Deux ans après leur combat, les héros ont suivi des chemins différents et font leur deuil chacun à leur manière, mais leur nouvelle vie est interrompue par une version future d'Alex venue pour les tuer. Un Chase venu du même futur l'en empêche et ramène les jeunes dans le passé...