聖アンソニー教会の若き神父トマスは、彼の教会へ通う信者で２人の娘を持つ母アンジェラから、とある悩みを打ち明けられる。それは家に悪霊がいて、娘のキャサリンに取り憑こうとしているという内容だった。アンジェラの話を信じられないトマスだったが、ある夜、悪霊が取り憑いた少年を救おうと戦うマーカスという神父の夢を見る…。

ケイシーに取り憑いた悪魔の姿を垣間見たトマス神父は、補佐司教であるイーガンに悪魔祓いの許可を求めるものの認められず、成す術もないままでいた。行動を起こしてくれないトマスに業を煮やしたアンジェラは、教会にある聖水を盗み、食事に乗じてケイシーに飲ませようと試みるが…。

ケイシーが悪魔憑きの徴候を見せ始める５ヵ月前、キャサリンは自らが運転する車で事故を起こし、同乗していた親友のジュリアを死なせてしまっていた。５ヵ月が経ち、ジュリアとキャサリンが所属していたバレエ団では、ジュリアの追悼会が開かれることになり、ランス家は家族全員で見に行く計画を立てる。そんな中、トマスの紹介でランス家を訪ねたマーカスはケイシーの部屋であるオルゴールを発見する…。

電車で若い男を襲ったケイシーは、措置入院させられる。医師の方針に異議を唱えるも、従わざるを得ないアンジェラは、トマス神父を呼び出し、何としても悪魔祓いをしてほしいと懇願する。その訴えを聞いたトマスは、イーガン司教に禁じられた悪魔祓いを行うため、ある人物に相談を持ち掛ける。一方、マーカスはベネットに教えてもらった修道院で、悪魔祓いを行うバナーデット院長を訪ねるが…。

マーカスとトマスは、ついにケイシーの悪魔祓いを開始する。しかし、強力な悪霊は決して立ち去らず、油断したトマスは悪霊の誘惑につかまりかけてしまう。そんな中、ケイシーに取り憑いた悪霊にある事を囁かれたヘンリーは、妻のアンジェラに疑惑を募らせる。悪霊の存在など信じられないキャサリンは、ケイシーの叫び声に耐えられず、警察を呼んでしまうが…。

救急隊員たちを殺害し行方をくらましたケイシーを探すため、トマスは教会でボランティアを募り、マスコミも利用して捜索を開始する。捜索が難航する中、アンジェラのもとにケイシーかもしれない遺体が発見されたという知らせが入る。一方、ローマ教皇来訪の準備を進めるマリアの邸宅では、街の名士で形成される“昇天の会”という会合が開催されていた…。

湖でケイシーを見つけたマーカスは、バーナデットのいる女子修道院でシスターたちと悪魔祓いを行うことにする。トマスはまず家族へ知らせるべきだと主張するが、マーカスに止められてしまい、何が正しいのか思い悩む。トマスはアンジェラたちにウソをつきながら、マーカスと共に修道院で悪魔祓いを続けるが、ケイシーの状態は悪化していく。一方ベネットは、マリアの多額の献金の出所に懸念を抱き…。

ケイシーが修道院にいることを知ったアンジェラは、悪魔祓いを受ける娘に付き添うことに。マーカスたちはアンジェラを囮に敵をおびき出すが、アンジェラは悪霊によって４０年前の自分の姿を幻視させられる。一方、ベネットは発見した死体の山を匿名で通報。彼はギーヨ枢機卿にも死体の件を報告し、教皇歓迎委員会のメンバーが事件に関与していると話すが…。

大勢の人々が抗議に押し寄せる中、クリスの遺体が運び出され、居間ではランス一家への事情聴取が行われる。「気づいたら母が階段の下に倒れていた」と話すアンジェラは、ジャフィーの手を取り、悪霊が彼女に乗り移った時の幻視を見せる。一方マーカスは、チェリーやレスターと共にベネットの足取りをたどり、彼が敵に捕まったと確信する。

アンジェラに乗り移った悪霊は、家族３人を部屋へと閉じ込め、そこへやってきたトマスをを苦しめる。一方、サイモンに捕まったマーカスは、ベネットと共に倉庫に監禁されてしまう。サイモンは、拘束した２人を傷つけ、悪霊に身を捧げるよう迫る。そんな中、教皇暗殺計画実行の時が刻一刻と迫っていた…。