자살한 친구 해나 베이커의 죽음을 애도하던 클레이에게 7개의 카세트 테이프가 든 상자가 배달되고, 이 7개의 테이프에는 해나가 죽기 전 직접 녹음한 자살의 13가지 이유가 들어있다.

해나는 전학생인 제시카, 알렉스와 친해진다. 저스틴은 갑자기 학교에 나오지 않고, 해나의 엄마는 충격적인 사실을 알게 된다.

질투와 가십에 휘말린 해나는 친구를 잃고 상처받는다. 알렉스는 밀려드는 후회로 괴로워하고, 클레이는 친구들의 압박에 술을 마셨다가 곤경에 빠진다.

누군가 자신을 스토킹하자 불안에 떨던 해나는 덫을 놓아 반격한다. 해나의 엄마는 교장을 찾아가고, 클레이는 해나를 죽음으로 몰고 간 장본인을 찾아 복수를 한다.

클레이와 해나는 학교 댄스 파티에서 함께 춤을 추며 좋은 시간을 보내지만 끔찍한 루머로 인해 엉망이 되고 만다. 클레이는 코트니를 해나의 무덤에 데리고 간다.

로맨틱한 밸런타인데이를 꿈꾸던 해나의 기대는 산산조각이 나고, 알렉스는 반 친구 한 명과 싸움을 벌인 후 진실을 밝히기로 결심한다.

해나에게 접근했다가 거절당한 반 친구. 보복으로 해나의 간절한 도움의 손길을 무참히 짓밟고, 이에 해나는 외로움을 심하게 느끼며 절망에 빠진다.

시 낭독 모임에 간 해나는 반 친구를 만나고, 이로 인해 또 다른 끔찍한 루머가 생겨난다. 클레이는 토니에게서 해나가 죽던 날 밤 일어난 일을 듣게 된다.

여름방학을 맞아 열린 파티에서 해나는 충격적인 장면을 목격한다. 클레이는 저스틴과 심한 언쟁을 벌이고, 마커스는 클레이에게 의미심장한 경고를 한다.

친구의 차를 타고 집으로 돌아가던 해나에게 예기치 않은 사고가 나고, 클레이는 파티에서 있었던 충격적인 일에 대한 진실을 듣는다.

클레이와 해나는 점점 더 가까워진다. 해나가 겪은 충격적인 일이 담긴 테이프를 듣던 클레이는 감정을 주체하지 못하고 브라이스의 집으로 찾아간다.

부모님과 심하게 다툰 후 배회하던 해나의 발길은 파티가 벌어지던 반 친구의 집으로 향한다. 해나의 죽음과 관련된 급우 모두에게 소환장이 발부된다.

해나는 마지막으로 포터 선생에게 도움을 청하러 간다. 클레이는 토니에게 자신이 만든 새로운 테이프를 전하고 다음 작전을 준비한다.

해나가 자살하고 다섯 달이 지났다. 학교를 상대로 진행되는 소송. 그 첫 번째 증인으로 타일러가 법정에 선다. 한편, 클레이는 사물함에서 불길한 사진을 발견한다.

두려움과 진실 사이에서 용기를 내는 코트니. 스카이는 해나의 그림자를 떨치지 못하는 클레이를 보며 상처받는다. 그리고 누군가 타일러의 사무실에 침입한다.

친구들을 향한 협박에 불안해지는 제시카. 하지만 진실을 말하기엔 두려움이 너무 크다. 클레이는 토니의 도움을 받아 결정적일지도 모를 증인을 찾아 나선다.

비밀이 늘어만 가는 클레이. 부모님에게도 털어놓을 수가 없다. 마커스는 법정에서 교묘한 거짓말을 둘러대고, 압박을 견디지 못한 제시카와 알렉스는 학교를 빠져나간다.

사이러스와 친해지며 외톨이에서 아웃사이더로 거듭나는 타일러. 알렉스는 잃어버린 기억을 찾으려 애쓰고, 라이언과 해나 어머니는 해나의 시에서 실마리를 찾으려 한다.

내가 알던 해나가 그 애의 전부일까? 충격적인 잭의 고백에 흔들리는 클레이, 대책도 없이 학교로 향하는 저스틴. 진실을 밝히려는 클레이의 계획은 이대로 무너지는 걸까.

몸도 마음도, 회복되지 않는다. 좌절을 넘어 분노에 빠져드는 알렉스. 클레이는 증언대에 서고, 제시카는 끔찍한 기억을 되살린다. 그리고 세 번째 폴라로이드가 도착한다.

부부 사이의 불화, 그 때문에 조사를 받는 해나의 부모님. 학교가 발칵 뒤집어지자 제시카는 해나의 어머니를 찾아간다. 한편, 저스틴은 빠져나갈 궁리를 하느라 바쁘다.

타일러가 사이러스의 여동생과 데이트를 한다. 테이프에 대해 브라이스에게 따지는 클로이. 데이트를 앞둔 제시카는 불안에 휩싸이고, 포터 선생은 후회로 괴로워한다.

자신의 과거를 고백하는 토니. 셰리는 클럽하우스에 들어가기 위해 계획을 세운다. 포터 선생은 저스틴을 돕고자 나서고, 잭과 브라이스는 격한 몸싸움을 벌인다.

마침내 증언한 브라이스. 그 여파로 학교에는 커다란 혼란이 일어난다. 제시카는 클로이에게 클럽하우스의 정체에 대해 말하고, 알렉스는 차츰 기억이 되살아난다.

클레이와 아이들을 향한 협박이 점점 거세진다. 징계 처분을 받는 타일러. 저스틴은 브라이스의 실체에 대해 증언하지만, 그 때문에 위험한 상황에 빠지고 만다.

한 달이 지났다. 해나를 향한 사랑으로 한 자리에 모인 사람들. 함께 해나를 추억하며 서로 위로한다. 한편, 잔인한 폭언과 폭행에 시달리던 한 아이가 극단으로 치닫는다.

봄 댄스파티가 끝나고 8개월 후, 경찰이 학교로 찾아와 클레이를 데리고 간다. 왜 하필 지금일까. 8개월 전, 대형 사건을 수습하던 클레이는 전학생 아니를 만난다.

말 못 할 비밀을 품고 지냈던 클로이. 사실을 알게 된 클레이와 아니는 그녀를 만난다. 힘들어하는 클로이 곁엔 언제나 잭이 있었다. 브라이스는 왜 아무것도 몰랐던 걸까.

불길한 예감은 틀리지 않는다. 긴장감이 감도는 리버티 고등학교. 아니는 제시카와 브라이스의 언쟁을 떠올린다. 인정하기 싫지만, 부정할 수 없다. 제시카가 의심스럽다.

총을 가진 타일러를 불안하게 지켜보는 친구들. 타일러는 앙심을 품고 브라이스를 찾아간다. 그가 정말 살인을 저질렀을까. 친구들에게 차마 말하지 못한 비밀은 무엇일까.

브라이스의 차 안에서 스테로이드가 발견된다. 경찰이 학교를 수색하자 겁에 질리는 알렉스. 이별의 아픔으로 힘들어하던 알렉스는 어쩌다 브라이스와 엮이게 된 걸까.

경찰의 심문을 받는 토니. 하지만 그는 좀처럼 입을 열지 않는다. 클레이는 장례식장에서 용의자를 찾으려 하고, 아니는 그곳에서 충격적인 비밀 두 가지를 알아낸다.

브라이스와 클레이의 모습이 담긴 보안 영상이 공개된다. 저스틴과 클레이를 추궁하는 경찰. 클레이는 정말 아니와 브라이스 사이를 질투해서 문제를 일으킨 걸까.

포터 선생이 학교에 나타난다. 보안관이 지켜보는 가운데 클레이의 친구들을 불러 그에 대해 캐묻는 포터 선생. 아니는 브라이스와 포터 선생의 연결 고리를 발견한다.

경찰이 클레이를 ‘요주의 인물’로 지목한다. 모두가 클레이를 의심의 눈초리로 바라볼 때, 저스틴을 눈여겨보는 아니. 저스틴의 말과 행동, 전부 수상하다.

해나의 어머니가 동네로 돌아온다. 클레이는 몰랐던 토니와 브라이스의 사연을 알고 있는 그녀. 괴로워하는 클레이에게 그녀가 충고한다. 부디, 자신을 지키라고.

경찰이 클레이를 점점 압박한다. 폭력으로 얼룩진 홈커밍 경기. 그날 밤, 그에게 무슨 일이 있었던 걸까. 격렬하게 증오하고 사랑한 아이들, 그들 모두 사건의 용의자다.

위기에 빠진 클레이, 그를 보호하고자 중대한 결정을 내린 친구들. 클레이는 홈커밍 경기에서 벌어진 일을 경찰에게 털어놓는다. 그러나 그가 모르는 또 다른 사건이 있다.

클레이는 조건부로 자유의 몸이 된다. 경찰에게 사건의 자초지종을 털어놓는 아니. 그녀의 계획은 성공할 수 있을까. 마침내 브라이스의 죽음에 얽힌 진실이 밝혀진다.

총이 발견된다. 타일러가 조사를 받자 초조한 친구들. 경찰이 학교에까지 오자 불안은 더욱 커진다. 힐크레스트에서 퇴학당한 윈스턴은 리버티 고등학교로 전학을 온다.

누군가가 날 함정에 빠뜨리려 한다. 집에서도, 학교에서도 곤란한 일을 겪는 클레이. 스프레이 페인트, 술, 이게 다 뭐지? 대학교 투어에서 그는 또다시 문제에 휘말린다.

학교가 온통 사랑으로 달아오르는 밸런타인데이. 하지만 클레이에겐 댄스파티를 준비할 마음의 여유가 없다. 발신자를 알 수 없는 전화가 끊임없이 그를 괴롭힌다.

누가 그 이메일을 보냈지? 서로를 의심하는 친구들. 공포와 불안은 여전하지만, 클레이는 피하고 싶지 않다. 기괴한 상황이 계속되는 캠핑. 혹시 전설이 되살아나는 걸까.

약물 검사를 받는 클레이와 저스틴. 탄로 나는 파티 계획. 누군가가 우리를 지켜보고 있는 것 같다. 의심스러운 추적을 피해, 클레이는 새로운 파티를 준비한다.

그냥 훈련일까, 실제 상황일까. 갑자기 봉쇄 상황에 돌입하는 학교. 학생 모두 곳곳으로 대피한다. 그런데 타일러는 어디로 사라진 거지? 클레이와 토니는 그가 걱정된다.

정신 건강이 더욱 나빠지는 클레이. 그가 또 어디로 튈지 알 수가 없다. 대학 입학 면접을 보는 학생들. 자신이 어떤 사람인지 보여줘야 하는 질문 앞에서 마음이 괴롭다.

누구를 어떻게 믿지? 서로에 대한 신뢰가 무너지고, 학교는 전쟁이 터지기 직전처럼 아슬아슬하다. 심각한 권력 남용에 분노한 학생들은 생각을 행동에 옮기기로 한다.

프롬을 취소하겠다. 화가 난 생활 지도부장은 학생들을 조사하고 처벌한다. 불리한 상황에서 벗어나려는 친구들. 부모님께 진실을 말하자. 전부는 아니고 적당히만.

치열하게 싸우고 고통을 견뎌내며, 고등학교에서 살아남은 친구들. 이제 과거를 묻고 떠날 때다. 그들은 아름다운 작별을 할 수 있을까, 밝은 미래를 꿈꿀 수 있을까.