Dopo aver preso il posto del padre nella guida degli affari familiari, Lorenzo si reca a Roma con la madre Lucrezia per chiedere il sostegno del Papa. Al corrente di questa mossa, i Pazzi contattano Francesco Salviati per cercare di mandare all'aria il piano dei Medici. Giuliano, nel frattempo, incontra la nuova musa di Sandro Botticelli, la bellissima Simona Vespucci, e se ne innamora.

Il papa è morto e al suo posto si trova adesso Sisto IV che nomina Salviati, cugino dei Pazzi, arcivescovo di Pisa. Lorenzo risponde stringendo un'alleanza commerciale con Sforza, in modo da impedire al nuovo porporato l'ingresso in città, ma Jacopo approfitta della fuga d'amore di Bianca con Guglielmo per compromettere, nelle votazioni della Signoria, l'astuta mossa dei Medici.

La fortuna sembra sorridere ai Medici: Lorenzo e Clarice hanno appena avuto un bambino e l'amicizia con Francesco Pazzi garantisce la pace a Firenze. Ma quando Sisto IV obbliga Sforza a cedergli Imola, il fragile equilibrio creato con Venezia e Milano viene messo seriamente in pericolo. Per questo Lorenzo pensa di mandare Giuliano nella città emiliana, ma il fratello rifiuta per non lasciare sola Simonetta.

Approfittando dei timori di Lorenzo per la tenuta dell'alleanza con Milano e Venezia, i Pazzi scatenano un tumulto nella vicina Città di Castello. Giuliano, distrutto dal rifiuto di Simonetta, decide così di partire per sedare la rivolta, mentre il Papa dichiara guerra al comune sedizioso. Così, con i Medici impegnati su più fronti, Jacopo Pazzi può finalmente avanzare la sua candidatura a gonfaloniere di Firenze.

Dopo l'ennesima sconfitta i Pazzi hanno deciso che è tempo di sbarazzarsi definitivamente dei Medici. Francesco Pazzi e Salviati congiurano insieme al conte Montesecco per convincere il Papa a organizzare un'ambasciata di pace a Firenze in modo da creare una trappola per assassinare contemporaneamente Lorenzo e Giuliano.

I Pazzi riescono a mettere in atto il loro violento piano colpendo durante la messa in Duomo. Jacopo occupa Palazzo Vecchio e proclama una nuova Repubblica Fiorentina, ma il popolo è ancora dalla parte dei Medici e insorge, invocando a gran voce Lorenzo.